体外药效评估
评估HHT对甲状腺癌细胞活力、增殖、凋亡、迁移和侵袭的影响
使用CCK-8、克隆形成、流式细胞术、Transwell和 wound healing实验检测HHT处理后的TPC-1和8505C细胞。
Repurposing homoharringtonine for thyroid cancer treatment through TIMP1/FAK/PI3K/AKT signaling pathway.
文献包含体外细胞实验(增殖、凋亡、迁移、侵袭)、蛋白质组学、体内异种移植瘤模型及临床组织样本分析,并进行功能验证(过表达、敲低、回复)和机制验证(通路抑制)。
人甲状腺癌细胞系TPC-1 人甲状腺癌细胞系8505C 人甲状腺癌细胞系BCPAP 人甲状腺癌细胞系FTC-133 BALB/c裸鼠皮下异种移植瘤模型
HHT处理浓度:TPC-1为20nM,8505C为50nM;处理时间48小时 TIMP1过表达和敲低构建方法(oeTIMP1、siTIMP1)及验证 体内实验:TPC-1细胞(5×10^6)皮下注射,HHT剂量1mg/kg灌胃每日一次,共14天 FAK抑制剂GSK2256098和PI3K抑制剂LY294002的使用浓度及处理时间
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估HHT对甲状腺癌细胞活力、增殖、凋亡、迁移和侵袭的影响
使用CCK-8、克隆形成、流式细胞术、Transwell和 wound healing实验检测HHT处理后的TPC-1和8505C细胞。
鉴定HHT处理后的差异表达蛋白及富集通路
对HHT处理的TPC-1细胞进行TMT标记蛋白质组学分析,KEGG和GO分析。
验证TIMP1在HHT抗肿瘤作用中的功能角色
过表达和敲低TIMP1,检测细胞增殖、凋亡、迁移、侵袭及HHT作用的变化;进行敲低后回复实验。
验证FAK/PI3K/AKT信号通路是否介导TIMP1对甲状腺癌进展的促进作用
使用FAK抑制剂GSK2256098和PI3K抑制剂LY294002处理TIMP1过表达细胞,观察细胞功能变化及通路蛋白磷酸化水平。
评估HHT在体内的抗肿瘤效果及TIMP1的作用
建立皮下异种移植瘤模型,给予HHT治疗,测量肿瘤体积和重量,并进行IHC和TUNEL染色。
评估TIMP1在甲状腺癌组织中的表达及其与临床特征的相关性
使用TCGA数据库和免疫组化(IHC)分析甲状腺癌组织芯片中TIMP1表达,并统计分析其与临床病理特征的关系。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 高三尖杉酯碱 | DC Chemicals (Shanghai, China) | DC9650 |
| GSK2256098 | Selleck | S8523 | |
| LY294002 | Selleck | S1105 | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000 | Invitrogen | 11668030 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| 细胞活力检测 | CCK-8检测试剂盒 | BBI Life Sciences (Shanghai, China) | E606335-0500 |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-APC/7-AAD凋亡检测试剂盒 | Elabscience (Wuhan, China) | E-CK-A218 |
| Annexin V-APC/PI凋亡检测试剂盒 | Elabscience (Wuhan, China) | E-CK-A217 | |
| 反转录与qPCR | TransScript All-in-One第一链cDNA合成预混液 | TransGen (Beijing, China) | AT341 |
| qPCR | AceQ通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme (Nanjing, China) | Q511-03 |
| TUNEL检测 | 一步法TUNEL凋亡检测试剂盒 | Beyotime (Shanghai, China) | C1086 |
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Gibco, USA | -- |
| 胎牛血清 | Gibco, USA | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 一抗 | -- | -- | |
| 二抗 | -- | -- | |
| 蛋白质组学 | 胰蛋白酶 | Promega, USA | -- |
| C18色谱柱 | -- | -- | |
| Pierce™定量比色肽测定试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Ultimate 3000系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| XBridge C18色谱柱 | Waters Corporation, USA | -- | |
| Orbitrap Fusion™与EASY-nLC 1100联用系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 流式分析 | Attune NXT流式细胞仪 | Thermo Fisher Scientific, USA | -- |
| Transwell实验 | Transwell小室 | Corning, USA | -- |
| Matrigel基质胶 | Corning, USA | -- | |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | Jihui Laboratory Animal (Shanghai, China) | -- |
| 细胞系 | TPC-1细胞系 | Chinese Academy of Sciences | -- |
| BCPAP细胞系 | Chinese Academy of Sciences | -- | |
| FTC-133细胞系 | Chinese Academy of Sciences | -- | |
| 8505C细胞系 | Chinese Academy of Sciences | -- | |
| 抗体 | 兔多克隆抗Bax抗体 | Proteintech | 50599-2-lg |
| 兔多克隆抗Bcl2抗体 | Millipore | ab1722 | |
| 兔单克隆抗Cleaved caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664T | |
| 兔多克隆抗E-cadherin抗体 | Proteintech | 20874-1-AP | |
| 兔多克隆抗N-cadherin抗体 | Proteintech | 22018-1-AP | |
| 兔多克隆抗NIS抗体 | Abcam | ab83816 | |
| 兔单克隆抗TIMP1抗体 | Abcam | ab211926 | |
| 兔多克隆抗FAK抗体 | Cell Signaling Technology | 3285 | |
| 兔单克隆抗phospho-FAK抗体 | Cell Signaling Technology | 8556s | |
| 兔单克隆抗PI3K抗体 | Zen bio | R22768 | |
| 兔多克隆抗Phospho-PI3K抗体 | Cell Signaling Technology | 4228 | |
| 兔单克隆抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4691 | |
| 兔单克隆抗Phospho-AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4060S | |
| 兔多克隆抗Ki-67抗体 | Abcam | ab15580 | |
| 兔单克隆抗GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5174 | |
| 病毒包装 | 慢病毒 | Asia Vector Biotechnology (Shanghai, China) | -- |
| 寡核苷酸 | 靶向TIMP1的siRNA | RiboBio (Guangzhou, China) | -- |
| 靶向TIMP1的shRNA | Asia Vector Biotechnology (Shanghai, China) | -- | |
| 质粒 | pcDNA3.1-3×Flag-TIMP1 | Asia Vector Biotechnology (Shanghai, China) | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外药物处理 | HHT浓度与处理时间;细胞系选择 阅读提示:Methods: Cell Counting Kit-8 (CCK-8) assay; Figure 1B-C |
| TIMP1过表达/敲低 | 转染方法(慢病毒/siRNA)、转染试剂、筛选标记 阅读提示:Methods: Cell transfection; Figures 3-5 |
| 通路抑制实验 | GSK2256098和LY294002的浓度及处理时间 阅读提示:Figure 7; Methods: Western blotting |
| 异种移植瘤模型 | 细胞数量、注射部位、肿瘤建立时间、HHT剂量及给药途径 阅读提示:Methods: Animal experiments; Figure 6A |
| 免疫组化评估 | IHC评分标准(IRS) 阅读提示:Methods: Immunohistochemistry; Figure 8 |