验证isiBCL-2的基因沉默效果
评估isiBCL-2是否有效抑制BCL-2表达。
在U251细胞中转染100 nM isiBCL-2、siBCL-2或siNC,48小时后通过qRT-PCR检测BCL-2 mRNA水平。
Therapeutic efficacy of a novel self-assembled immunostimulatory siRNA combining apoptosis promotion with RIG-I activation in gliomas.
包含体外细胞实验(CCK-8、集落形成、划痕、Transwell、流式、Western blot、ELISA)、体内异种移植瘤模型及免疫组化/TUNEL分析,并进行RIG-I敲低验证,涉及多个独立证据层级。
U251人胶质母细胞瘤细胞株 皮下异种移植瘤裸鼠模型(BALB/c nude mice)
isiBCL-2处理浓度100 nM,处理时间48 h 体外转染试剂Lipofectamine 2000 体内给药剂量2.5 nmol/20 g,每三天瘤内注射,共22天 体内转染试剂EntransterTM-in vivo BCL-2 mRNA水平降低67.52%,凋亡率约51.96%
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估isiBCL-2是否有效抑制BCL-2表达。
在U251细胞中转染100 nM isiBCL-2、siBCL-2或siNC,48小时后通过qRT-PCR检测BCL-2 mRNA水平。
检测isiBCL-2是否抑制胶质瘤细胞生长和转移能力。
通过CCK-8实验、集落形成实验、划痕实验和Transwell实验评估细胞活力、增殖、迁移和侵袭。
验证isiBCL-2是否诱导胶质瘤细胞凋亡。
采用Annexin V/PI双染流式细胞术检测凋亡率,Western blot检测凋亡相关蛋白表达。
确定isiBCL-2是否激活RIG-I/MAVS/IRF3通路。
通过qRT-PCR、Western blot和免疫荧光检测RIG-I、MAVS、IRF3和磷酸化IRF3水平。
探究RIG-I激活引起的线粒体损伤和ROS积累。
使用JC-1染色和DCFH-DA探针通过荧光显微镜和流式细胞仪检测MMP和ROS水平。
评估isiBCL-2是否增强免疫反应相关分子如MHC-I、IFN-β和CXCL10的表达。
通过qRT-PCR和ELISA检测IFN-β和CXCL10表达,免疫荧光和流式检测MHC-I水平。
确认isiBCL-2的效应是否通过RIG-I介导。
在U251细胞中敲低RIG-I(siRIG-I),然后评估isiBCL-2对细胞活力、凋亡、细胞因子分泌和MHC-I表达的影响。
验证isiBCL-2在动物模型中的抗肿瘤活性和免疫调节作用。
建立U251细胞皮下异种移植裸鼠模型,瘤内注射PBS、siBCL-2或isiBCL-2,测量肿瘤体积,进行IHC、TUNEL、qRT-PCR和ELISA分析。
证实isiBCL-2通过Hoogsteen碱基配对形成RNA二聚体。
通过天然凝胶电泳检测isiBCL-2和siBCL-2的迁移情况。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜尔贝科改良伊格尔培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| siRNA合成 | siRNA序列 | Suzhou GenePharma | -- |
| qRT-PCR | 总RNA提取试剂盒 | EZBiosciences | -- |
| Color逆转录试剂盒 | EZBiosciences | -- | |
| SYBR Green qPCR混合液 | EZBiosciences | -- | |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Fude | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V/PI双染凋亡检测试剂盒 | Elabscience | -- |
| Western blotting | RIPA裂解缓冲液 | Biosharp | BL504A |
| Halt蛋白酶抑制剂 | Biosharp | BS-00-0903 | |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Biosharp | BL615A | |
| 抗BCL-2抗体 | Abmart | T40056T40056 | |
| 抗BAX抗体 | Abmart | T40051 | |
| 抗细胞色素C抗体 | Abmart | T55734T55734 | |
| 抗PARP抗体 | Abmart | T40050 | |
| 抗Caspase 3抗体 | Abmart | T40044 | |
| 抗Caspase 9抗体 | Abmart | T40046 | |
| 抗RIG-I抗体 | Proteintech | 20566-1-AP | |
| 抗MAVS抗体 | Proteintech | 66911-1-Ig | |
| 抗IRF3抗体 | Proteintech | 11312-1-AP | |
| 抗磷酸化IRF3抗体 | Proteintech | 29528-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| ELISA | 人IFN-β和CXCL10 ELISA试剂盒 | Jiangsu Meiman | -- |
| 免疫荧光 | QuickBlock封闭液 | Beyotime | P0220 |
| CoraLite488/594荧光二抗 | Proteintech | -- | |
| DAPI染色液 | Biosharp | BS097-10 | |
| 体内实验 | Entranster-in vivo转染试剂 | Engreen Biosystem | -- |
| 免疫组化 | 抗Ki67抗体 | Servicebio | GB121141 |
| 细胞培养 | U251细胞系 | Procell Life Science & Technology | -- |
| 实验耗材 | 培养板 | CORNING | -- |
| 迁移/侵袭实验 | Transwell小室 | Corning | -- |
| Western blotting | 细胞裂解液 | -- | -- |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与siRNA转染 | U251细胞系;siRNA浓度100 nM;转染试剂Lipofectamine 2000;转染时间48 h;培养基DMEM含10% FBS 阅读提示:Materials and methods: Cell culturing, Establishment of the in vitro assay |
| 体外功能实验 | CCK-8实验:3×10^3细胞/孔,处理48 h;集落形成实验:2×10^3细胞/孔,14天;划痕实验:2×10^5细胞/孔,观察至48 h;Transwell迁移/侵袭:1×10^4/1.5×10^4细胞,48 h 阅读提示:Materials and methods: Cell viability assay, Colony formation ability, Assessment of cancer cell migration and invasion |
| 凋亡检测 | Annexin V/PI双染;处理48 h;使用Elabscience试剂盒 阅读提示:Materials and methods: Determination of apoptosis |
| RIG-I信号通路检测 | RIG-I、MAVS、IRF3、P-IRF3的蛋白水平;使用Proteintech抗体;qRT-PCR检测mRNA 阅读提示:Materials and methods: Western blotting analysis, qRT-PCR |
| 体内实验 | BALB/c裸鼠;皮下注射1×10^7 U251细胞;分成对照组、siBCL-2组和isiBCL-2组,每组5只;剂量2.5 nmol/20 g;每三天瘤内注射,共22天;肿瘤体积公式0.5×长×宽^2 阅读提示:Materials and methods: Animal handling, Assessment of isiBCL-2 anti-tumor activity in vivo |
| 免疫组化与TUNEL | 肿瘤组织固定、包埋、切片4-8 μm;抗体:Ki67、BCL-2、RIG-I、MHC-I;TUNEL反应液孵育2 h 阅读提示:Materials and methods: Immunohistochemistry (IHC) and terminal deoxynucleotidyl transferase dUTP nick end labeling (TUNEL) assay |
| RNA二聚体验证 | 天然凝胶电泳;RNA浓度10 µM;检测~50 bp条带 阅读提示:Discussion 和 Figure 8 legend |