评估体外抗胃癌活性
验证Dehy对胃癌细胞增殖、迁移和侵袭的抑制作用
使用MTT、集落形成、伤口愈合和Transwell侵袭实验检测Dehy对MKN-28和AGS细胞的影响,并观察细胞形态和凋亡。
Dehydrocostus lactone suppresses gastric cancer progression by targeting ACLY to inhibit fatty acid synthesis and autophagic flux.
高,包含体外细胞功能实验、体内异种移植模型、PDX模型、患者组织芯片,涉及网络药理学、代谢分析和机制验证。
人胃癌细胞系MKN-28和AGS MKN-28细胞异种移植裸鼠模型 患者来源异种移植(PDX)模型 胃癌和癌旁组织芯片(99对)
细胞系:人胃癌细胞系MKN-28和AGS Dehy处理浓度:0、5、10、15 μM 体内给药剂量:Dehy 15和30 mg/kg/day,5-FU 25 mg/kg/day PDX模型给药:Dehy 30 mg/kg每日一次,5-FU 25 mg/kg隔日一次 ACLY过表达:pcDNA-ACLY质粒转染
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Dehy对胃癌细胞增殖、迁移和侵袭的抑制作用
使用MTT、集落形成、伤口愈合和Transwell侵袭实验检测Dehy对MKN-28和AGS细胞的影响,并观察细胞形态和凋亡。
验证Dehy在体内的抗肿瘤作用及安全性
建立MKN-28细胞异种移植裸鼠模型,分别给予Vehicle、5-FU、低剂量Dehy和高剂量Dehy,测量肿瘤体积和重量,并检测凋亡标志物。
探索Dehy的潜在靶点和代谢影响
从TCMSP和SwissADME获取Dehy靶点,从DisGeNET和GeneCards获取GC相关靶点,取交集后富集分析GO和KEGG通路;进行XF底物氧化应激测试评估代谢底物偏好。
验证Dehy抑制脂肪生成酶和减少脂质储存
通过Western blot检测ACLY、ACC和FASN的蛋白表达,并用BODIPY 493/503染色检测中性脂质水平。
探讨Dehy抑制ACLY的机制
qRT-PCR检测ACLY mRNA水平,使用MG132和3-MA处理评估降解途径,Co-IP检测ACLY泛素化,Western blot检测ACLY磷酸化。
验证Dehy是否直接结合IKKβ并抑制其磷酸化
Western blot检测p-IKKβ和IKKβ,BLI测定Dehy与IKKβ结合常数,分子对接分析结合模式。
验证Dehy对自噬和溶酶体膜功能的影响
Western blot检测自噬标志物(Beclin-1、LC3、p62),MDC染色观察自噬体,mRFP-GFP-LC3转染检测自噬流,透射电镜观察自噬体,Western blot检测LAMP1和LAMP2。
验证ACLY在Dehy抗胃癌作用中的关键作用
在MKN-28和AGS细胞中转染pcDNA-ACLY或空载体,检测脂质水平、自噬标志物和凋亡标志物。
验证ACLY在胃癌中的高表达及Dehy联合5-FU的疗效
使用组织芯片进行IHC分析,评估ACLY表达;建立PDX模型,比较Control、5-FU、Dehy和联合治疗组的肿瘤生长。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 去氢木香内酯 | Chengdu Must Bio-Technology Co., Ltd | A0301 |
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | BioChannel | -- |
| 新生牛血清 | Evergreen Company | -- | |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | Jiangsu KeyGen Biotech. Inc. | -- |
| JC-1线粒体膜电位检测试剂盒 | Jiangsu KeyGen Biotech. Inc. | -- | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Beyotime | -- | |
| 可溶与不溶蛋白提取试剂盒 | Sangon Biotech | -- | |
| 蛋白印迹 | PVDF膜 | Merck Millipore | -- |
| ECL化学发光底物 | Biosharp | -- | |
| 脂质过氧化测定 | GSH比色法检测试剂盒 | Elabscience | -- |
| 脂质过氧化MDA检测试剂盒 | Beyotime | -- | |
| 代谢分析 | XF底物氧化应激测试试剂盒 | Seahorse Bioscience | -- |
| XF24细胞外通量分析仪 | Seahorse Bioscience | -- | |
| 脂质染色 | BODIPY 493/503 | Gibco | GC42959 |
| RNA提取 | RNA提取试剂盒 | Vazyme | -- |
| 逆转录 | HiScript III逆转录预混液(gDNA去除) | Vazyme | -- |
| qRT-PCR | ABI 7500 Fast实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- |
| 免疫共沉淀 | Protein A琼脂糖 | Beyotime | P2051 |
| SDS-PAGE上样缓冲液 | Beyotime | P0015A | |
| 分子结合分析 | His标签NF-κB亚基β | CUSABIO | CSB-EP011572HU |
| 分子对接 | AutoDock软件 | -- | -- |
| 自噬检测 | MDC | Solarbio | -- |
| mRFP-GFP-LC3腺病毒 | HanBio Technology | -- | |
| 质粒转染 | ACLY质粒 | RiboBio | -- |
| Lipofectamine 2000试剂 | ThermoFisher | -- | |
| 免疫荧光 | DAPI | -- | -- |
| Western blot | 抗ACLY抗体 | Abcam | ab40793 |
| 抗ACC抗体 | Abcam | ab45174 | |
| 抗FASN抗体 | Abcam | ab128870 | |
| 抗Beclin-1抗体 | Cell Signaling Technology | 3495 | |
| 抗Cleaved Caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9664 | |
| 抗FTH1抗体 | Cell Signaling Technology | 4393 | |
| 抗IKKβ抗体 | Cell Signaling Technology | 8943 | |
| 抗LC3A/B抗体 | Cell Signaling Technology | 12741 | |
| 抗NCOA4抗体 | Cell Signaling Technology | 66849 | |
| 抗Phospho-ACLY (Ser455)抗体 | Cell Signaling Technology | 4331 | |
| 抗Bax抗体 | ProteinTech | 50599-2-Ig | |
| 抗Bcl-2抗体 | ProteinTech | 12789-1-AP | |
| 抗GPX4抗体 | ProteinTech | 67763-1-Ig | |
| 抗β-actin抗体 | ProteinTech | 66009-1-Ig | |
| 抗p62/SQSTM1抗体 | ProteinTech | 18420-1-AP | |
| 抗LAMP2抗体 | ProteinTech | 66301-1-Ig | |
| 抗LAMP1抗体 | ProteinTech | 21997-1-AP | |
| 抗泛素抗体 | ProteinTech | 10201-2-AP | |
| 抗Phospho-IKKα/β (Ser176/180)抗体 | Beyotime | AF5839 | |
| 山羊抗小鼠IgG二抗 | ZSGB-BIO | ZB-2305 | |
| 山羊抗兔IgG二抗 | ZSGB-BIO | ZB-2306 | |
| 细胞培养 | 胰蛋白酶-EDTA | Beyotime | -- |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | Sibef Biotechnology Co., Ltd | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外细胞实验 | 细胞系来源、培养条件、Dehy处理浓度和时间 阅读提示:Methods: Cell culture, Cell viability and colony formation assay; Figure legends 1 |
| 细胞凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI染色步骤、JC-1染色时间 阅读提示:Methods: Flow cytometry analysis of apoptosis, Mitochondrial membrane potential (JC-1) assay |
| 体内异种移植实验 | 小鼠品系、性别、体重、细胞注射数量、分组、给药剂量和频率 阅读提示:Methods: GC cells xenograft studies; Figure legends 3 |
| 代谢分析 | XF实验细胞密度、抑制剂浓度、OCR测定 阅读提示:Methods: Oxygen consumption rate (OCR); Figure legends 4 |
| 脂质检测 | BODIPY 493/503染色浓度和孵育时间 阅读提示:Methods: Quantification of cellular neutral lipids; Figure legends 5 |
| 蛋白表达检测 | 抗体稀释比例、蛋白上样量 阅读提示:Methods: Western blot assay; Table S1 |
| 自噬检测 | MDC浓度、mRFP-GFP-LC3转染条件、透射电镜步骤 阅读提示:Methods: Monodansylcadaverine (MDC) staining assay, mRFP-GFP-LC3 puncta assay, Transmission electron microscopy; Figure legends 7 |
| PDX模型 | PDX模型的建立、分组、给药方案 阅读提示:Methods: GC patient-derived xenograft (PDX) models; Figure legends 9 |
| 分子结合分析 | BLI实验条件、分子对接所用软件和参数 阅读提示:Methods: Biolayer interferometry (BLI) assay, Molecular docking model |