安全性评估
评估菌株的体外安全性,包括溶血性、细胞毒性和抗生素敏感性。
在羊血琼脂平板上划线培养,观察溶血;XTT法检测HT-29和HepG2细胞活力;采用EFSA推荐的抗生素进行MIC测定。
In vitro safety and functional characterization of the novel Bacillus coagulans strain CGI314.
该研究包含多种体外实验:生化检测(抗氧化、胆固醇、乳酸等)、细胞实验(HT-29、HepG2等)、代谢组学分析和模拟胃肠道条件测试,涉及安全性和功能性验证。
HT-29 肠上皮细胞系 HT-29-MTX 粘液分泌型肠上皮细胞系 HepG2 肝癌细胞系 Bacillus coagulans CGI314 及其孢子
孢子热稳定性测试温度:45°C、75°C、90°C,时间0.5、1、3分钟 模拟胃液条件:0.3%胃蛋白酶,pH 3.0,37°C处理2小时;模拟肠液条件:0.1%胰酶和0.3%胆汁盐,pH 7.5,37°C处理2小时 细胞粘附实验:HT-29和HT-29-MTX细胞以5×10^5细胞/孔,培养21-28天,细菌浓度3.0-8.0×10^7 CFU/ml,共培养3.5小时 抗氧化实验:H2O2浓度2 mM处理,DCF-DA染色浓度60 μM,荧光测定 屏障完整性实验:H2O2浓度1 mM,处理48小时,FITC-dextran浓度1 mg/ml
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估菌株的体外安全性,包括溶血性、细胞毒性和抗生素敏感性。
在羊血琼脂平板上划线培养,观察溶血;XTT法检测HT-29和HepG2细胞活力;采用EFSA推荐的抗生素进行MIC测定。
评估孢子在极端温度和模拟胃肠道条件下的存活能力。
将孢子悬浮液分别在45°C、75°C、90°C水浴中处理0.5、1、3分钟,然后进行平板计数。模拟胃液(0.3%胃蛋白酶,pH 3.0)处理2小时,然后模拟肠液(0.1%胰酶,0.3%胆汁盐,pH 7.5)处理2小时,每隔1小时取样计数。
评估菌株对肠上皮细胞的粘附能力及其自聚集和共聚集特性。
将CGI314孢子悬浮液与HT-29和HT-29-MTX细胞共培养3.5小时后,洗涤并计数粘附细菌。通过96孔板测量OD600值,计算自聚集和共聚集百分比。
评估菌落的酶法抗氧化能力及其在不同细胞模型中的保护效果。
采用总抗氧化能力试剂盒、过氧化氢酶试剂盒和GSH试剂盒测定细胞裂解液中的抗氧化活性。在HT-29和HepG2细胞中,用DCF-DA荧光探针评估H2O2诱导的ROS产生,并用XTT法测定细胞活力。
评估菌株在发酵过程中产生的氨基酸、维生素和短链脂肪酸。
使用HPLC-FLD和UHPLC-MS分析TSB培养基中的氨基酸和维生素,使用GC-MS分析UHT牛奶中的氨基酸和SCFA。
评估菌株对多种病原菌的抑制能力。
采用双层琼脂法,将CGI314点种在MRS琼脂上,培养20小时后覆盖含有指示菌的TSA或sBHI琼脂,再培养24小时观察抑菌圈。
评估菌株对LPS诱导的促炎基因表达的影响。
将HT-29细胞与CGI314(活菌或热灭活)预培养20小时,然后加入LPS(10 ng/ml)刺激3.5小时,提取RNA,用qRT-PCR检测IL-8、TNF-α和CXCL10的表达。
评估菌株对H2O2诱导的肠屏障破坏的保护作用。
使用分化成熟的HT-29-MTX细胞(培养25-28天),将CGI314或细胞上清液单独或与1 mM H2O2处理,测量TEER和FITC-dextran渗透性,并检测紧密连接蛋白的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 菌株培养 | 胰蛋白胨大豆肉汤 | Becton, Dickinson and Company | -- |
| MRS肉汤 | Merck | -- | |
| 耐受性测试 | 猪胃黏膜胃蛋白酶 | Sigma-Aldrich | P6887 |
| 猪胰腺胰酶 | Sigma-Aldrich | P1750 | |
| 胆汁盐 | Sigma-Aldrich | 48305 | |
| 抗氧化活性测定 | 总抗氧化能力检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | MAK187 |
| 过氧化氢酶检测试剂盒 | Cohesion Biosciences | CAK1061 | |
| 还原型谷胱甘肽检测试剂盒 | Elabscience | E-BC-K030-S | |
| 细胞活力检测 | XTT试剂 | -- | -- |
| 胆固醇降低测定 | 总胆固醇微量板检测试剂盒 | -- | CAK1116 |
| 乳酸测定 | 乳酸检测试剂盒 | -- | CAK1177 |
| 抗菌活性测定 | MRS琼脂 | -- | -- |
| 胰蛋白胨大豆琼脂 | -- | -- | |
| 脑心浸液琼脂(含补充物) | -- | -- | |
| 抗炎活性测定 | 大肠杆菌O111:B4脂多糖 | Sigma-Aldrich | L4391 |
| RNA提取 | Monarch总RNA小提试剂盒 | NEB | -- |
| RNA定量 | Qubit RNA宽范围定量试剂盒 | Thermofisher scientific | -- |
| RT-qPCR | Luna通用qPCR预混液 | NEB | -- |
| LunaScript逆转录预混试剂盒 | NEB | -- | |
| 蛋白质印迹 | NuPAGE 4-12% Bis-Tris凝胶 | -- | -- |
| iBlot 2凝胶转印仪 | Invitrogen/ThermoFisher Scientific | -- | |
| iBlot 2 NC迷你转印叠 | Invitrogen/ThermoFisher Scientific | -- | |
| 兔抗β-actin、occludin、claudin 1、ZO-1抗体 | ABclonal | -- | |
| SuperSignal West Pico PLUS化学发光底物 | Thermo Scientific | -- | |
| iBright成像系统 | Invitrogen/ThermoFisher Scientific | -- | |
| TEER测量 | Millicell ERS-2电阻仪 | Millipore | -- |
| 屏障通透性 | 4 kDa FITC标记葡聚糖 | -- | -- |
| 仪器 | Multiskan FC酶标仪 | ThermoFisher | -- |
| Varioskan LUX多功能酶标仪 | ThermoFisher Scientific | -- | |
| BeadBug 6匀浆仪 | -- | -- | |
| Thermo Scientific Vanquish液相色谱 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Orbitrap Exploris 240质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 代谢物分析 | Zebron ZB-FFAP气相色谱柱(30 m × 0.25 mm × 0.25 μm) | -- | -- |
| 气相色谱7890B | Agilent | -- | |
| 四极杆检测器5977B | Agilent | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 菌株培养 | 培养条件:TSB或MRS肉汤,37°C,24小时 阅读提示:Methods 2.1 |
| 耐受性测试 | 温度处理条件:45°C、75°C、90°C,时间0.5、1、3分钟;模拟胃液成分(胃蛋白酶浓度、pH、时间);模拟肠液成分(胰酶浓度、胆汁盐浓度、pH、时间) 阅读提示:Methods 2.3, 2.4 |
| 粘附与聚集 | 细胞密度、培养时间(21-28天);细菌浓度、MOI;共培养时间;聚集测定条件(OD600测量时间点) 阅读提示:Methods 2.5, 2.6 |
| 抗氧化活性 | 细菌浓度(1×10^8 CFU/ml);试剂盒名称;细胞浓度;H2O2浓度;DCF-DA浓度和染色时间 阅读提示:Methods 2.7, 2.9 |
| 细胞毒性 | 细胞浓度;处理时间(20小时);XTT浓度和孵育时间 阅读提示:Methods 2.8 |
| 胆固醇降低 | 胆固醇浓度(6 mM);培养时间(72小时);取样时间点(0、4、8、24、32、48、72小时) 阅读提示:Methods 2.12 |
| 抗菌活性 | 指示菌种类和培养条件;CGI314浓度;琼脂层组成;培养时间 阅读提示:Methods 2.14 |
| 抗炎活性 | 细菌浓度(2×10^8 CFU/ml);LPS浓度(10 ng/ml);共培养时间(20小时)刺激时间(3.5小时) 阅读提示:Methods 2.15 |
| 屏障保护 | HT-29-MTX细胞分化时间(25-28天);细菌浓度(6-8×10^8 CFU/ml);H2O2浓度(1 mM);处理时间(48小时);TEER测量设备;FITC-dextran浓度和测量时间 阅读提示:Methods 2.16, 2.17 |