体外细胞系筛选和TNFα敏感性评估
确定结直肠癌细胞系对TNFα诱导的细胞死亡和PANX1裂解的敏感性
评估五种结直肠癌细胞系(HCT15、HCT116、SW480、SW620、LoVo)对TNFα的响应,通过细胞活力检测和免疫印迹检测相关蛋白表达和裂解。
TNFα modulates PANX1 activation to promote ATP release and enhance P2RX7-mediated antitumor immune responses after chemotherapy in colorectal cancer.
包括体外细胞实验(细胞活力、免疫印迹、ATP检测、DC共培养)、体内动物模型(CT26同系移植瘤、FOLFOX/OXP处理)、临床样本(TMA、SNP基因分型)及TCGA数据分析,涵盖功能验证和机制验证。
结直肠癌细胞系(HCT15、HCT116、SW480、SW620、LoVo) CT26同系小鼠移植瘤模型(BALB/c小鼠) THP1分化未成熟树突状细胞和Jurkat T细胞共培养体系 III期结直肠癌患者组织微阵列(TMA)及临床队列
TNFα处理浓度:50 ng/mL;OXP处理浓度:25 μM(体外) 小鼠肿瘤模型:5×10^5 CT26细胞皮下注射,OXP剂量50 mg/kg(体内) P2RX7激动剂BzATP和拮抗剂A438079的剂量:20 μM(腹腔注射) P2RX7-E496A(rs3751143)基因型及CD8+ TIL密度与生存的关联(临床样本)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定结直肠癌细胞系对TNFα诱导的细胞死亡和PANX1裂解的敏感性
评估五种结直肠癌细胞系(HCT15、HCT116、SW480、SW620、LoVo)对TNFα的响应,通过细胞活力检测和免疫印迹检测相关蛋白表达和裂解。
验证TNFα通过TNFR1而非TNFR2介导caspase依赖的PANX1裂解
通过shRNA敲低TNFR1或TNFR2,或使用TNFR1抑制剂R-7050,检测TNFα处理的细胞中caspase-8、caspase-3和PANX1的裂解水平。
确定PANX1是否影响caspase依赖性凋亡和ATP释放
敲低PANX1后,检测TNFα处理细胞的caspase-3裂解、凋亡和细胞内/外ATP水平。
验证TNFα是否增强化疗药物诱导的PANX1裂解和ATP释放
用TNFα联合OXP或5-Fu处理HCT15和HCT116细胞,检测细胞活力、caspase-3活性、PANX1裂解和ATP释放。
评估PANX1介导的ATP释放是否增强癌细胞免疫原性,促进DC成熟和T细胞毒性
将OXP/TNFα处理的HCT116shNC或HCT116shPANX1细胞与THP1-未成熟DC共培养,检测DC成熟标志物和细胞因子;再与Jurkat T细胞共培养,检测T细胞毒性因子。
验证PANX1敲低是否降低化疗疗效并减少免疫细胞浸润
将CT26shNC或CT26shPANX1细胞皮下注射至BALB/c小鼠,给予OXP治疗,测量肿瘤体积和重量,并分析肿瘤浸润免疫细胞亚群。
验证ATP-P2RX7信号是否通过树突状细胞促进化疗抗肿瘤免疫
在CT26移植瘤模型中,使用P2RX7激动剂BzATP或拮抗剂A438079联合FOLFOX化疗,评估肿瘤生长和免疫细胞浸润;并在DC消耗模型中使用氯膦酸脂质体清除DC,观察对BzATP疗效的影响。
验证PANX1表达和P2RX7基因型与免疫浸润及患者生存的关联
对III期结直肠癌患者肿瘤组织微阵列进行免疫组化检测PANX1、CD8、CD11c,并通过SNP基因分型检测P2RX7-E496A(rs3751143)多态性,分析其与CD8+ TIL密度及生存结果的关联。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Life Technologies | -- |
| 胎牛血清 | Life Technologies | -- | |
| 青霉素/链霉素 | -- | -- | |
| L-谷氨酰胺 | -- | -- | |
| Matrigel基质胶 | -- | -- | |
| 药物处理 | TNFα | -- | -- |
| 奥沙利铂 | -- | 61825-94-3 | |
| 5-氟尿嘧啶 | -- | 51-21-8 | |
| z-VAD-fmk | -- | -- | |
| z-DEVD-fmk | -- | -- | |
| Nec-1 | -- | -- | |
| 槲皮素 | -- | 117-39-5 | |
| R-7050 | -- | -- | |
| BzATP | -- | -- | |
| A438079 | -- | -- | |
| ATP检测 | 奎纳克林 | Sigma | -- |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 发光ATP检测试剂盒 | Abcam | ab113849 | |
| 细胞功能检测 | CCK-8检测 | -- | -- |
| 细胞凋亡检测 | 凋亡/坏死检测试剂盒 | Enzo Life Sciences | -- |
| RNA提取 | TRIzol | Invitrogen | -- |
| 逆转录 | iScript逆转录预混液 | Bio-Rad | -- |
| qRT-PCR | iQ SYBR Green预混液 | Bio-Rad | -- |
| CFX96 Touch实时荧光定量PCR检测系统 | Bio-Rad | -- | |
| Western blotting | PVDF膜 | GE | -- |
| HRP标记的二抗 | GE Healthcare | -- | |
| Immobilon Western化学发光HRP底物 | Millipore | -- | |
| Restore Western blot剥离缓冲液 | Pierce | -- | |
| ImageQuant LAS 4000生物分子成像仪 | GE Healthcare | -- | |
| 抗体 | 抗TNFR1抗体 | ABclonal | A12540 |
| 抗TNFR2抗体 | ABclonal | A12536 | |
| 抗caspase-3抗体 | Cell Signaling Tech. | 9662 | |
| 抗caspase-3抗体 | iREAL Bio. | IR96-401 | |
| 抗裂解caspase-3抗体 | Cell Signaling Tech. | 9661 | |
| 抗PANX1抗体 | Abcam | ab233479 | |
| 抗PANX1抗体 | Cell Signaling Tech. | 91137 | |
| 抗caspase-8抗体 | Santa Cruz | SC-81656 | |
| 抗磷酸化SFK (Y416)抗体 | Cell Signaling Tech. | 2101 | |
| 抗磷酸化SFK (Y416)抗体 | ABclonal | AP0511 | |
| 抗RIPK1抗体 | Cell Signaling Tech. | 4926 | |
| 抗RIPK3抗体 | Cell Signaling Tech. | 10188 | |
| 抗MLKL抗体 | Cell Signaling Tech. | 14993 | |
| 抗磷酸化MLKL (S358)抗体 | Cell Signaling Tech. | 91689 | |
| 流式抗体(CD8) | CD45-PE抗体 | Elabscience | E-AB-F1136UD |
| CD8a-PerCP抗体 | Elabscience | E-AB-F1104UF | |
| 流式抗体(Treg) | CD25-PerCP抗体 | Elabscience | E-AB-F1194J |
| Foxp3-FITC抗体 | Elabscience | E-AB-F1238C | |
| 流式分析 | Foxp3/转录因子染色缓冲液套装 | eBioscience | -- |
| BD Canto II流式细胞仪 | BD | -- | |
| 组织芯片构建 | AutoTiss 10C组织芯片仪 | EverBio Technology Inc. | -- |
| 免疫组化 | Vectastain Elite ABC-HRP试剂盒 | Vector Laboratories | PK-6100 |
| DAB显色剂 | Vector Laboratories | -- | |
| 抗CD8抗体 | Abcam | ab4055 | |
| 抗CD11c抗体 | Abcam | ab52632 | |
| 显微镜 | 奥林巴斯BX53显微镜 | OLYMPUS | -- |
| DNA提取 | QuickExtract FFPE DNA提取试剂盒 | Epicenter | QEF81050 |
| SNP基因分型 | MassARRAY系统 | Agena Bioscience | -- |
| Taq DNA聚合酶 | Agena Bioscience | -- | |
| 碱性磷酸酶 | Agena Bioscience | -- | |
| SpectroCHIP阵列 | Agena Bioscience | -- | |
| 统计 | SAS统计软件 | SAS Institute | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外细胞处理 | TNFα浓度(50 ng/mL)、OXP浓度(25 μM)、处理时间(24小时或6小时)、细胞系(HCT15、HCT116) 阅读提示:Materials and methods: Cell culture, treatment, and western blotting analysis; Figure legends for Fig. 1-3 |
| 动物模型 | CT26细胞数量(5×10^5/只)、BALB/c小鼠周龄和性别(4周龄雌性)、OXP剂量及给药时间(50 mg/kg,第7、12、19天)、肿瘤体积测量方法 阅读提示:Materials and methods: Evaluation of immune cell profiles in PANX1-deficient tumor-bearing animals; Figure legends for Fig. 4 |
| P2RX7激动剂/拮抗剂处理 | FOLFOX剂量(20 μM左亚叶酸钙、20 μM 5-Fu、100 μM OXP)、BzATP和A438079剂量(20 μM)、给药时间(FOLFOX前后1小时腹腔注射)、分组设计 阅读提示:Materials and methods: Treatment of tumor-bearing animals with an ATP antagonist and agonist |
| 临床样本分析 | TMA样本量(156例)、IHC抗体和稀释度(CD8 1:500, PANX1 1:500)、CD8+ TIL评分标准、SNP基因分型方法(MassARRAY)、P2RX7-E496A(rs3751143)分型、生存分析模型调整变量 阅读提示:Materials and methods: Construction of the tissue microarray, Immunohistochemistry, Genomic DNA extraction and SNP genotyping; Figure legends for Fig. 7 |