体外粪菌培养与XPJYF处理
评估不同剂量和时间XPJYF对抑郁症患者粪便菌群组成的影响。
将抑郁症患者粪便样本在厌氧条件下培养,分别以1、4、8 mg/ml XPJYF处理12或24小时,然后进行16S rRNA测序分析菌群组成。
Antidepression of Xingpijieyu formula targets gut microbiota derived from depressive disorder.
包含体外菌群培养、粪菌移植大鼠模型、LPS诱导星形胶质细胞体外模型,并有行为学、ELISA、免疫荧光、Western blot、16S rRNA测序等多层级验证。
抑郁症患者粪便菌群 无菌大鼠粪菌移植模型 大鼠原代皮层星形胶质细胞(LPS诱导活化)
XPJYF体外处理剂量8 mg/ml、时间12小时(H12-8) 无菌大鼠灌胃XPJYF剂量1.533 g/kg/天,用药2周 粪菌移植方案:2 ml菌液灌胃,每日一次,持续2周 LPS诱导星形胶质细胞活化浓度1 mg/ml 行为学测试:强迫游泳试验、旷场试验、糖水偏好试验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估不同剂量和时间XPJYF对抑郁症患者粪便菌群组成的影响。
将抑郁症患者粪便样本在厌氧条件下培养,分别以1、4、8 mg/ml XPJYF处理12或24小时,然后进行16S rRNA测序分析菌群组成。
验证XPJYF对抑郁症患者粪菌诱导的抑郁大鼠的治疗作用。
将来自抑郁症患者或健康个体的菌液通过灌胃移植到无菌大鼠,2周后对抑郁症粪菌移植大鼠灌胃XPJYF 2周,并进行行为学及生理指标检测。
探究XPJYF对活化星形胶质细胞功能的影响及其机制。
使用LPS刺激大鼠原代皮层星形胶质细胞建立活化模型,给予XPJYF处理,检测糖代谢、炎症因子、氧化应激和BDNF表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 体外菌群培养 | YCFA培养基 | -- | -- |
| ELISA检测 | TNF-α ELISA试剂盒 | R&D | RTA00 |
| IL-6 ELISA试剂盒 | R&D | R600B | |
| IL-1 ELISA试剂盒 | R&D | RLB00 | |
| IFN-γ ELISA试剂盒 | R&D | RIF00 | |
| 5-羟色胺ELISA试剂盒 | Bioswamp | RA20506 | |
| 多巴胺ELISA试剂盒 | Bioswamp | RA20050 | |
| 皮质酮ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-0160c | |
| 促肾上腺皮质激素ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-R0048c | |
| 促肾上腺皮质激素释放激素ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-R0270c | |
| 免疫荧光 | 抗GFAP抗体 | Abcam | ab7260 |
| 抗兔IgG | Abcam | -- | |
| 594标记的亲和纯化驴抗体 | Jackson | -- | |
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 糖代谢检测 | 葡萄糖摄取检测试剂盒 | Abcam | Ab136955 |
| 葡萄糖-1-磷酸检测试剂盒 | Abcam | Ab155892 | |
| ATP检测试剂盒 | Beyotime | s0026 | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 抗TNF-α抗体 | Proteintech | 17590-1-AP | |
| 抗IL-1β抗体 | Cell Signaling Technology | 12242s | |
| 抗IL-6抗体 | Proteintech | 21865-1-AP | |
| 抗COX-2抗体 | Proteintech | 12375-1-AP | |
| 抗iNOS抗体 | Proteintech | 18985-1-AP | |
| 抗BDNF抗体 | Proteintech | 28205-1-AP | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-g | |
| 16S rRNA测序 | TIANamp细菌DNA提取试剂盒 | Tiangen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 体外菌群培养 | XPJYF处理浓度和时间:8 mg/ml、12小时(H12-8);培养基及添加物:YCFA培养基含2 mg/ml葡萄糖、麦芽糖和纤维二糖。 阅读提示:见Methods 2.1节 |
| 粪菌移植动物模型 | 无菌大鼠周龄:6周;粪菌灌胃量:2 ml/天,持续2周;XPJYF剂量:1.533 g/kg/天,灌胃2周;动物分组及样本量。 阅读提示:见Methods 2.2节及图5A |
| 行为学测试 | 强迫游泳试验的水温、水深、持续时间;旷场试验的箱体尺寸、观察时间;糖水偏好试验的适应和测试流程。 阅读提示:见Methods 2.3节 |
| LPS诱导星形胶质细胞实验 | LPS浓度:1 mg/ml;XPJYF浓度:8 mg/ml,处理时间:12小时;检测指标:2-DG摄取、G1P、ATP、炎症因子、氧化应激、BDNF。 阅读提示:见Methods 2.6-2.8节及图6 |
| 16S rRNA测序与生物信息学分析 | 测序区域:V3-V4;引物序列;分析流程:QIIME2、LEfSe、PICRUSt。 阅读提示:见Methods 2.9-2.10节 |