建立SCI小鼠模型和OGD细胞模型
模拟脊髓损伤的体内和体外条件,用于评估FTO的作用
采用改良Allen法建立C57BL/6小鼠SCI模型;小鼠脊髓神经元原代细胞(MC178)进行OGD处理(无糖DMEM,94% N2/1% O2/5% CO2,4小时)。
Mechanism of Fat Mass and Obesity-Related Gene-Mediated Heme Oxygenase-1 m6A Modification in the Recovery of Neurological Function in Mice with Spinal Cord Injury.
包含体内SCI小鼠模型和体外OGD细胞模型,并进行了功能验证(BBB评分、mNSS、凋亡检测)和机制验证(Me-RIP、RNA稳定性、RIP)。
C57BL/6小鼠SCI模型 小鼠脊髓神经元原代细胞(MC178)OGD模型
SCI模型建立:采用改良Allen法,T10脊髓撞击(5g重量,50mm高度) FTO过表达:鞘内注射pcDNA3.1-FTO慢病毒(2μL,1×10^8 TU/mL) FTO抑制:Dac51(体内20mg/kg尾静脉注射;体外5μM) HO-1敲低:si-HO-1转染 行为学评估:BBB评分和mNSS评分,分别在术后第3、6、14、21、28天和0、7、14、21、28天进行
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
模拟脊髓损伤的体内和体外条件,用于评估FTO的作用
采用改良Allen法建立C57BL/6小鼠SCI模型;小鼠脊髓神经元原代细胞(MC178)进行OGD处理(无糖DMEM,94% N2/1% O2/5% CO2,4小时)。
验证FTO对SCI小鼠神经功能和神经元凋亡的影响
SCI小鼠鞘内注射pcDNA3.1-FTO或pcDNA3.1-NC慢病毒,通过BBB评分、mNSS评分、HE染色和TUNEL染色评估神经功能和病理。
验证FTO对OGD诱导的神经元凋亡的影响
OGD处理的小鼠脊髓神经元细胞转染pcDNA3.1-FTO或pcDNA3.1-NC,通过MTT和流式细胞术评估细胞活力和凋亡。
阐明FTO调节HO-1表达是否通过m6A修饰途径
通过RT-qPCR和western blot检测HO-1 mRNA和蛋白水平;Me-RIP检测HO-1 m6A修饰水平;放线菌素D处理检测mRNA稳定性;RIP检测YTHDF2与HO-1 mRNA的相互作用。
验证HO-1在FTO抑制OGD诱导神经元凋亡中的必要性
OGD细胞共转染pcDNA3.1-FTO和si-HO-1或si-NC,检测HO-1表达、细胞活力和凋亡。
在动物水平确认FTO介导的HO-1 m6A修饰促进神经恢复
SCI小鼠注射pcDNA3.1-FTO和Dac51,检测脊髓组织匀浆中HO-1 m6A水平、BBB评分、mNSS评分、HE染色和TUNEL染色。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | 脊髓撞击装置 | RWD | Model III |
| 青霉素 | -- | -- | |
| pcDNA3.1-FTO质粒 | Hanbio | -- | |
| Dac51 | Abmole | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | -- | |
| 神经生长因子 | Invitrogen | NGF 2.5S | |
| Lipofectamine 3000转染试剂 | Invitrogen | -- | |
| RT-qPCR | TRIzol试剂 | Sigma-Aldrich | -- |
| PrimeScriptTM RT试剂盒 | TaKaRa | -- | |
| ABI 7500检测系统 | Applied Biosystem | -- | |
| Western blot | RIPA细胞裂解液 | Beyotime | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 抗FTO抗体 | Abcam | ab280081 | |
| 抗HO-1抗体 | Abcam | ab189491 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab9485 | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG | Abcam | ab205718 | |
| MTT assay | MTT试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 酶标仪 | Metsch Instruments | -- | |
| 流式细胞术 | 膜联蛋白V-FITC/碘化丙啶凋亡检测试剂盒 | BD Bioscience | -- |
| 流式细胞仪 | BD Bioscience | FACSCalibur | |
| Me-RIP | 抗IgG抗体 | Abcam | ab109489 |
| 抗m6A抗体 | Abcam | ab151230 | |
| RIP | Magna RIP试剂盒 | Millipore | -- |
| 抗YTHDF2抗体 | Abcam | ab246514 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | C57BL/6小鼠周龄、性别、体重;Allen法撞击参数(重量、高度、直径);麻醉剂量;术后护理 阅读提示:Materials and Methods 中 Establishment of Spinal Cord Injury Mouse Model |
| FTO过表达和抑制 | pcDNA3.1-FTO慢病毒滴度和注射体积;注射位点;Dac51剂量和给药途径 阅读提示:Materials and Methods 中 Animal Grouping and Treatment 和 Cell Culture and Establishment of OGD Model |
| OGD细胞模型 | 原代神经元来源和培养条件;OGD处理时间、气体条件;NGF浓度 阅读提示:Materials and Methods 中 Cell Culture and Establishment of Oxygen/Glucose Deprivation Model |
| 行为学评估 | BBB评分时间点;mNSS评分时间点;评分者盲法 阅读提示:Materials and Methods 中 Functional Behavior Assessments 和 Neurobehavioral Assessment |
| 机制检测 | Me-RIP抗体和浓度;放线菌素D浓度和取样时间;RIP抗体和用量 阅读提示:Materials and Methods 中 Methylated RNA Immunoprecipitation、RNA Stability、Rip |