构建Sec1敲除小鼠
验证Sec1在小鼠IBD中的功能,排除Fut2干扰
使用CRISPR/Cas9技术敲除Sec1基因,PCR验证基因型,并检测Fut2表达以确认特异性
Sec1 regulates intestinal mucosal immunity in a mouse model of inflammatory bowel disease.
包含Sec1敲除小鼠模型、DSS诱导IBD、细胞siRNA沉默、体内外功能验证(炎症因子、凋亡、增殖)及机制研究(DR5),多个独立证据层级。
C57BL/6小鼠DSS诱导结肠炎模型 CT26.WT细胞 CMT93细胞
Sec1敲除小鼠(CRISPR/Cas9) 3% w/v DSS诱导结肠炎 siRNA沉默Sec1(si-m-Sec1序列) DR5及凋亡蛋白表达检测 细胞增殖、凋亡和周期分析
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Sec1在小鼠IBD中的功能,排除Fut2干扰
使用CRISPR/Cas9技术敲除Sec1基因,PCR验证基因型,并检测Fut2表达以确认特异性
评估Sec1缺失对IBD进展的影响
用3% DSS诱导野生型和Sec1−/−小鼠结肠炎,监测体重、DAI并进行组织学分析
确定Sec1对全身炎症和Th17/Treg平衡的影响
ELISA检测血清IL-1β、IL-6、TNF-α水平;流式细胞术分析脾脏Th17和Treg细胞比例
在体外验证Sec1对细胞增殖、凋亡和炎症因子分泌的影响
在CT26.WT和CMT93细胞中沉默Sec1,检测细胞因子分泌、增殖、凋亡和细胞周期
阐明Sec1调控凋亡的分子机制
检测Sec1缺失或沉默后DR5和凋亡相关蛋白的表达
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型 | C57BL/6小鼠 | Cyagen Biosciences | -- |
| 结肠炎诱导 | 葡聚糖硫酸钠 | MP Biomedicals | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Excell Bio | -- | |
| 青链霉素溶液 | -- | -- | |
| CT26.WT细胞系 | Xiamen Immocell Biotechnology Co. Ltd | -- | |
| CMT93细胞系 | Xiamen Immocell Biotechnology Co. Ltd | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| 凋亡检测 | AnnexinV-APC/7-AAD凋亡检测试剂 | -- | -- |
| 细胞周期分析 | 碘化丙啶 | -- | -- |
| 细胞增殖检测 | CCK-8细胞增殖检测试剂盒 | Elabscience | E-CK-A362 |
| 免疫荧光 | FUT3抗体 | Affinity | -- |
| DR5抗体 | Invitrogen | -- | |
| CY3标记山羊抗兔IgG二抗 | Boster Biological Technology | -- | |
| DAPI染料 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 凋亡检测 | TUNEL BrightRed凋亡检测试剂盒 | Vazyme | A113-03 |
| 流式细胞术 | CytoFLEX流式细胞仪 | Beckman | -- |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| Immobilon-P PVDF膜 | Millipore | -- | |
| GAPDH抗体 | Goodhere Biology | -- | |
| FUT3抗体 | Affinity | -- | |
| DR5抗体 | Invitrogen | -- | |
| HRP标记二抗 | Goodhere Biology | -- | |
| qRT-PCR | Trizol试剂 | -- | -- |
| ReverTra Ace qPCR反转录试剂盒 | Toyobo | -- | |
| 2×SYBR Green qPCR混合液(含ROX) | Sparkjade | -- | |
| 荧光定量PCR仪 | Bio-rad | -- | |
| ELISA | ELISA试剂盒 | Elabscience Biotechnology | -- |
| 脾脏淋巴细胞分离 | 单核细胞分离液 | Tianjin Haoyang Biological Manufacture | LTS1092PK |
| 流式细胞术 | IC固定液 | eBioscience | -- |
| 1×透化缓冲液 | eBioscience | -- | |
| CD4抗体 | eBioscience | -- | |
| CD25抗体 | eBioscience | -- | |
| Foxp3抗体 | eBioscience | -- | |
| IL-17A抗体 | eBioscience | -- | |
| 刺激 | PMA/离子霉素 | Yeasen | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 小鼠品系(C57BL/6),Sec1敲除方法(CRISPR/Cas9),gRNA序列,敲除验证(PCR片段大小),伦理批准号 阅读提示:Materials and methods: Construction of Sec1−/− mice and Sec1-siRNA intestinal epithelial cells; Table 1 |
| 结肠炎诱导 | DSS浓度(3% w/v),分子量(36-50 kDa),给药途径(饮用水),持续时间(第1-5天),观察时间点(第7天处死) 阅读提示:Materials and methods: Mouse model of colitis; Results: Sec1 played a protective role against mouse IBD |
| 细胞培养与转染 | 细胞系(CT26.WT, CMT93),培养基(DMEM+10% FBS+1% P/S),siRNA序列(si-m-Sec1),转染试剂(Lipofectamine 2000),转染时间(24h) 阅读提示:Materials and methods: Construction of Sec1−/− mice and Sec1-siRNA intestinal epithelial cells; Apoptosis and cell cycle analysis |
| 炎症因子检测 | 样本(细胞上清或血清),检测指标(IL-1β, IL-6, TNF-α),ELISA试剂盒品牌 阅读提示:Materials and methods: The enzyme-linked immunosorbent assay (ELISA); Results: Sec1 suppressed in vivo inflammation and inhibited apoptosis of epithelial cells |
| 细胞增殖和凋亡检测 | 检测方法(CCK-8,流式凋亡,TUNEL),试剂(CCK-8试剂盒,AnnexinV-APC/7-AAD,PI,TUNEL试剂盒),细胞密度,孵育时间 阅读提示:Materials and methods: Apoptosis and cell cycle analysis; Results: Expression of Sec1 was associated with lowered inflammation, increased cell proliferation and reduced apoptosis in cell cultures |
| 机制验证 | 检测方法(Western blot, qRT-PCR, 免疫荧光),抗体(DR5, cleaved Caspase-3, -8, -9, Bax, BCL-2),样本(结肠组织或细胞) 阅读提示:Materials and methods: Western blot, Quantitative RT-PCR; Results: Sec1 regulated apoptosis by modulating fucosylation of DR5 |