细胞毒性评估
测定PTER-ITC对骨肉瘤细胞的毒性作用
使用MTT法检测PTER和PTER-ITC对hFOB 1.19和MG-63细胞活力的影响,并计算IC50。
Pterostilbene-Isothiocyanate Inhibits Proliferation of Human MG-63 Osteosarcoma Cells via Abrogating β-Catenin/TCF-4 Interaction-A Mechanistic Insight.
研究包含体外细胞实验(增殖、迁移、凋亡)和机制验证(Co-IP、荧光素酶报告基因),及计算机模拟,但缺乏动物模型或患者样本等体内证据。
人骨肉瘤细胞系MG-63 人正常成骨细胞系hFOB 1.19
PTER-ITC处理浓度(5、10 μM)对MG-63细胞增殖、迁移和凋亡的影响 β-catenin与TCF-4的物理相互作用(Co-IP实验) β-catenin介导的TCF-4转录激活(TOPFlash荧光素酶报告基因实验) E-cadherin和N-cadherin蛋白表达水平(免疫荧光和免疫印迹)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
测定PTER-ITC对骨肉瘤细胞的毒性作用
使用MTT法检测PTER和PTER-ITC对hFOB 1.19和MG-63细胞活力的影响,并计算IC50。
评估PTER-ITC对细胞增殖和迁移的影响
通过伤口愈合实验和Transwell迁移实验,检测PTER-ITC处理后MG-63细胞的增殖和迁移能力。
验证PTER-ITC是否诱导细胞凋亡
使用AO/EtBr和DAPI染色观察细胞形态变化,TUNEL实验检测DNA断裂,Rhodamine 123染色评估线粒体膜电位。
检测PTER-ITC对相关标志物表达的影响
通过RT-qPCR和免疫印迹检测增殖、凋亡、转移相关基因的mRNA和蛋白水平。
预测PTER-ITC与TCF-4的结合模式
利用分子对接和MD模拟分析PTER-ITC与TCF-4的结合稳定性和相互作用。
验证PTER-ITC对β-catenin/TCF-4相互作用的抑制
通过Co-IP实验检测β-catenin和TCF-4的相互作用,使用TOPFlash荧光素酶报告基因检测TCF-4转录活性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM-F12培养基 | Himedia | AT106 |
| α-MEM培养基 | Himedia | AT154 | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 胰蛋白酶-EDTA | Gibco | -- | |
| 细胞毒性检测 | MTT | Himedia | TC191 |
| 免疫染色封闭 | 牛血清白蛋白 | Himedia | TC194 |
| 细胞凋亡检测 | 吖啶橙 | Himedia | MB116 |
| 溴化乙锭 | Himedia | MB071 | |
| DAPI | Himedia | MB097 | |
| 线粒体膜电位检测 | 罗丹明123 | Cayman Chemicals | 16672 |
| 细胞凋亡检测 | TUNEL检测试剂盒 | AAT Bioquest | 22853 |
| 免疫印迹 | 抗PCNA抗体 | Elabscience | E-AB-10010 |
| 抗切割PARP-1抗体 | Elabscience | E-AB-30059 | |
| 抗MMP-2抗体 | Elabscience | E-AB-32054 | |
| 抗MMP-9抗体 | Elabscience | E-AB-70247 | |
| 抗活性Caspase-3抗体 | Elabscience | E-AB-22115 | |
| 抗TCF-4抗体 | Elabscience | E-AB-60206 | |
| 抗β-actin抗体 | Elabscience | E-AB-20058 | |
| 抗E-cadherin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | Sc-8426 | |
| 抗N-cadherin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | Sc-8424 | |
| 抗β-catenin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | Sc-7963 | |
| HRP标记抗小鼠二抗 | Jackson ImmunoResearch Laboratory | 115-035-003/111 | |
| HRP标记抗兔二抗 | Jackson ImmunoResearch Laboratory | 111-035-003/111 | |
| 免疫荧光 | 山羊抗小鼠FITC二抗 | Thermo Fisher Scientific | 62-6511 |
| 山羊抗小鼠TRITC二抗 | Thermo Fisher Scientific | A16071 | |
| RT-qPCR | 逆转录酶 | Thermo Fisher Scientific | EP0441 |
| SYBR Green预混液 | Thermo Fisher Scientific | K0221 | |
| 免疫共沉淀 | Protein A琼脂糖珠 | G Biosciences | 786-283 |
| 转染 | Polyfect转染试剂 | Qiagen Inc. | 301105 |
| RT-qPCR | 引物 | Eurofins Scientific | -- |
| 试剂配制 | 二甲基亚砜 | Sisco Research Laboratories | -- |
| 甲醇 | Sisco Research Laboratories | -- | |
| 氯仿 | Sisco Research Laboratories | -- | |
| 化合物合成 | 紫檀茋-异硫氰酸酯 | -- | -- |
| Transwell迁移实验 | Transwell小室 | Corning | -- |
| 细胞迁移染色 | 结晶紫 | Himedia | -- |
| 划痕实验 | ImageJ软件 | -- | -- |
| 显微成像 | Zeiss Axiovert 25显微镜 | Zeiss | -- |
| 荧光成像 | BioTek Lionheart LX自动显微镜 | BioTek | -- |
| 吸收光检测 | Fluostar optima酶标仪 | BMG Labtech | -- |
| RT-qPCR | Quant Studio 3实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- |
| 免疫印迹 | PVDF膜 | Advanced Microdevices Pvt. Ltd. | SVFX8301XXXX101 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 鲁米诺试剂 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| TOPFlash荧光素酶报告基因实验 | M50 Super 8x TOPFlash质粒 | Addgene | 12456 |
| β-半乳糖苷酶质粒 | -- | -- | |
| 分子对接 | AutoDock Tools | -- | -- |
| ACD/ChemSketch | -- | -- | |
| Avogadro | -- | -- | |
| Pyrx | -- | -- | |
| PyMOL | -- | -- | |
| Maestro | Schrödinger | -- | |
| 分子动力学模拟 | GROMACS | -- | -- |
| PRODRG | -- | -- | |
| 数据分析 | GraphPad Prism | GraphPad Software | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | hFOB 1.19细胞培养于含G418 (0.3 mg/mL)、2.5 mM L-谷氨酰胺和10% FBS的DMEM-F12培养基,34°C;MG-63细胞培养于含10% FBS和1%抗生素的α-MEM培养基,37°C,5% CO2。 阅读提示:Methods 2.2 Cell Culture |
| 细胞毒性检测 | PTER-ITC浓度(2.5, 5, 10, 20, 40, 80, 100 μM),处理24小时,MTT浓度5 mg/mL,孵育4小时,检测波长570 nm。 阅读提示:Methods 2.3 Cytotoxicity Assay 和 Figure 1 |
| 细胞增殖和迁移 | 划痕实验:PTER-ITC浓度5和10 μM,ZA 10 μM,观察12和24小时;Transwell迁移:1.25 × 10^5细胞/孔,处理24小时,结晶紫染色。 阅读提示:Methods 2.4 Wound-Healing Assay 和 2.6 In Vitro Cell Migration Assay |
| 凋亡检测 | PTER-ITC浓度5和10 μM,处理24小时;TUNEL染色使用TdT染色溶液(45 μL TdT反应缓冲液、5 μL CoCl2、0.5 μL TF5-dUTP、0.5 μL TdT酶),孵育2小时;Rhodamine 123浓度10 μg/mL,孵育20-25分钟。 阅读提示:Methods 2.7 Mitochondrial Membrane Potential Integrity Assay 和 2.8 TUNEL Assay |
| 分子表达分析 | RT-qPCR使用SYBR Green Master Mix,β-actin作为内参,ΔΔCt法;免疫印迹使用RIPA缓冲液裂解,PVDF膜,一抗稀释1:1000,二抗1:5000,ECL显色。 阅读提示:Methods 2.10 RT-qPCR Analysis 和 2.11 Protein Expression and Immunoblot Analysis |
| 机制验证 | Co-IP:使用β-catenin或TCF-4抗体(1:100)免疫沉淀,Protein A-Sepharose beads;TOPFlash:MG-63细胞共转染450 ng/well TOPFlash质粒和0.6 ng/well β-gal质粒,处理不同浓度PTER-ITC 24小时,检测荧光素酶活性。 阅读提示:Methods 2.13 Co-Immunoprecipitation Assay 和 2.14 TOPFlash Luciferase Assay |