免疫性肝纤维化大鼠“肠-肝轴”的改变。

Alterations in the "Gut-Liver Axis" on Rats with Immunological Hepatic Fibrosis.

作者信息Zhaoyao Qi, Xinxin Qi, Yuanhui Xu, Hongguang Sun, Dengfeng Li, Jincun Liu, Meili Cong, Tao Liu
PMID37781475
发布时间2023-09-21
DOI10.1155/2023/5577850

实验完整度

高

研究包含动物模型建立、组织学与血液生化验证、16S肠道菌群测序、血清代谢组学及关联分析等多个独立证据层级,并涉及功能验证和机制探讨。

主要模型

Sprague-Dawley大鼠BSA诱导肝纤维化模型 肠道菌群样本 血清样本

重点核对

BSA诱导方案:分两阶段,包括皮下注射BSA不完全福氏佐剂致敏和尾静脉注射BSA攻击 组别:正常对照组与BSA模型组,每组大鼠数量及随机分配方法 检测时间点:1期(第6周)和2期(第13周)

摘要

目前仍缺乏具备人类疾病所有特征的标准模型。特别是在免疫性肝纤维化中,牛血清白蛋白(BSA)诱导的肝纤维化模型与人类肝纤维化模型具有相同的发展机制,但很少受到关注。我们标准化了大鼠BSA诱导的肝纤维化模型,并全面评估了其病理特征。我们还使用16S测序评估了BSA诱导的肝纤维化大鼠肠道微生态的稳态,并使用超高效液相色谱-串联质谱(UHPLC-MS/MS)检测了这些大鼠血清中的多种差异代谢物。我们观察到BSA诱导的肝纤维化大鼠肝脏组织形态学发生稳定而明确的组织学改变,血清中炎症标志物浓度显著升高。这与BSA诱导可导致大鼠肠道菌群紊乱的事实一致。UHPLC-MS/MS分析大鼠血清样本,在正离子模式和负离子模式下分别鉴定出17种和25种差异代谢物。网络分析显示,苯丙氨酸或酪氨酸代谢物(如PAGln)是BSA诱导的肝纤维化大鼠血清中的主要代谢物。综上所述,我们的结果表明,由肠道菌群引起的氨基酸代谢紊乱可能在免疫性肝纤维化的进展中发挥重要作用。

实验结论

提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。

研究问题
BSA诱导的免疫性肝纤维化大鼠模型中,肠道菌群和血清代谢物如何改变,以及这些改变在肝纤维化进展中的作用。
核心机制
肠道菌群紊乱导致氨基酸代谢异常,特别是苯丙氨酸和酪氨酸代谢途径改变,影响PAGln等代谢物生成,可能在免疫性肝纤维化进展中起作用。
主要证据
16S测序显示BSA大鼠肠道菌群α多样性下降,特定菌属(如Akkermansia减少,Coprobacillus等增加)改变;UHPLC-MS/MS检测到血清差异代谢物,网络分析显示PAGln为核心代谢物,并与菌群显著相关。
研究意义
研究提示BSA模型可用于微生态多组学研究,为理解免疫性肝纤维化的发病机制提供依据。

研究路径

按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。

1

建立BSA诱导的肝纤维化大鼠模型

建立具有人类肝纤维化相似机制的免疫性肝纤维化动物模型。

大鼠适应性喂养3天后随机分为正常组和BSA组。BSA组接受多阶段BSA注射:第1-6周每周第二天皮下注射BSA不完全福氏佐剂,第7-13周每周第2和第5天尾静脉注射BSA生理盐水。正常组注射等量生理盐水。

2

评估肝纤维化模型病理特征

验证BSA诱导的肝纤维化模型的成功性和病理特征。

采集大鼠血清和肝脏组织,进行HE染色、天狼星红染色和免疫组化检测Col-I、Col-III、α-SMA表达,检测血清ALT、AST、ALB、TBIL、TP、LN、Col-IV和炎症因子TNF-α、IL-6、IL-1β水平。

3

肠道菌群16S测序分析

比较BSA模型组和正常组大鼠肠道菌群结构和组成的差异。

提取盲肠和结肠内容物总DNA,扩增16S rRNA V3-V4区,进行高通量测序。分析α多样性、β多样性、差异菌属及功能预测。

4

血清代谢组学分析

鉴定BSA模型组和正常组大鼠血清差异代谢物,并分析相关代谢通路。

采用UHPLC-MS/MS对血清样本进行正负离子模式检测,筛选差异代谢物(VIP>1,P<0.05,FC>1),并进行KEGG和HMDB注释及通路富集分析。

5

整合分析肠道菌群与血清代谢物

探讨肠道菌群改变与血清代谢物变化之间的关联及其在肝纤维化中的作用。

通过Spearman相关分析和网络分析,评估差异菌群与血清差异代谢物及临床指标(肝纤维化标志物、炎症因子)的关联。

研究方法

按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。

产品清单

实验环节名称品牌货号
牛血清白蛋白SigmaA1933-5G
不完全弗氏佐剂----
乌拉坦----
IL-1β ELISA试剂盒ElabscienceE-EL-R0012c
TNF-α ELISA试剂盒ElabscienceE-EL-R2856c
IL-6 ELISA试剂盒ElabscienceE-EL-R0015c
Col-IV ELISA试剂盒上海生工生物工程有限公司D731044-96T
层粘连蛋白ELISA试剂盒CusbioCSB-E04646r
胶原I兔多克隆抗体ServicebioGB11022-3
胶原III兔多克隆抗体ServicebioGB111629
α-平滑肌肌动蛋白兔多克隆抗体ServicebioGB111364
全自动生化分析仪Mind-rayBS-240
Vanquish UHPLC系统Thermo Fisher--
Orbitrap Q-Exactive HF-X质谱仪Thermo Fisher--
Hypesil Gold色谱柱----

关键环节

汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。

环节核对要点
动物模型建立
动物品系、性别、体重、来源、随机分组方法、各组动物数量、BSA剂量、注射途径、时间点(第6周和第13周)
阅读提示:Methods: Animals, Establishment of the BSA-Induced Liver Fibrosis Rat Model, Figure 1(a)
模型评估
肝组织采集固定方法,HE/天狼星红染色条件,免疫组化抗体及稀释度,血清生化指标(ALT, AST, ALB, TBIL, TP)检测方法,ELISA试剂盒及操作步骤
阅读提示:Methods: Animal Samples, Histological Analysis, Biochemical Assays, ELISA; Results: Section 3.1
肠道菌群测序
肠道内容物采集和保存方法,DNA提取方法,16S rRNA V3-V4引物序列,测序平台,生物信息分析流程(α/β多样性、差异菌筛选方法)
阅读提示:Methods: Bacterial DNA Extraction and 16S Sequencing, Sequencing and Metabolites Data Analysis
代谢组学分析
血清样本准备,UHPLC-MS/MS参数(色谱柱、流动相、梯度、质谱参数),数据处理软件和参数(VIP阈值、差异代谢物筛选标准)
阅读提示:Methods: Untargeted Metabolomics, Sequencing and Metabolites Data Analysis