建立I/R诱导的AKI大鼠模型并评估肾损伤
评估Hexarelin预处理对I/R诱导的AKI的肾功能和组织学损伤的影响。
大鼠分为正常、假手术、AKI、Hexarelin预处理和生理盐水预处理组,通过双侧肾动脉夹闭45分钟再灌注24小时建立模型,检测血清肌酐、BUN、KIM-1水平,并进行H&E和PAS染色。
Hexarelin alleviates apoptosis on ischemic acute kidney injury via MDM2/p53 pathway.
包含大鼠体内模型、HK-2细胞体外模型、分子对接与生信分析,并进行了功能验证(凋亡相关蛋白检测)和机制验证(MDM2/p53表达验证)。
大鼠双侧肾动脉夹闭45分钟再灌注24小时模型 HK-2人肾皮质近曲小管上皮细胞系 缺氧/复氧(H/R)诱导的HK-2细胞模型
Hexarelin预处理剂量:100 μg/kg/d,腹腔注射7天 AKI模型:双侧肾动脉夹闭45分钟,再灌注24小时 HK-2细胞H/R处理:缺氧9小时,复氧3小时 Hexarelin处理浓度:10^-4 μmol/L 凋亡相关蛋白检测:Caspase-3、Bax、Bad、Bcl-2及MDM2、p53
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估Hexarelin预处理对I/R诱导的AKI的肾功能和组织学损伤的影响。
大鼠分为正常、假手术、AKI、Hexarelin预处理和生理盐水预处理组,通过双侧肾动脉夹闭45分钟再灌注24小时建立模型,检测血清肌酐、BUN、KIM-1水平,并进行H&E和PAS染色。
检测Hexarelin预处理对I/R诱导的肾小管细胞凋亡及相关凋亡蛋白表达的影响。
通过TUNEL染色检测肾组织凋亡细胞,并通过qRT-PCR和Western blot检测凋亡相关蛋白Caspase-3、Bax、Bad、Bcl-2的表达。
确定H/R处理条件及Hexarelin的合适浓度,评估其对H/R诱导的细胞损伤的影响。
HK-2细胞经不同浓度Hexarelin预处理后,进行缺氧9小时复氧3小时处理,检测HIF-1α表达、细胞活力及KIM-1水平。
验证Hexarelin在体外对H/R诱导的细胞凋亡的抑制作用。
使用PI染色检测凋亡细胞,并通过qRT-PCR和Western blot检测凋亡相关蛋白表达。
通过生物信息学分析鉴定I/R诱导的AKI中的凋亡相关通路和转录因子,并通过分子对接预测Hexarelin的靶蛋白。
对GSE98622数据集进行GSEA分析,鉴定凋亡通路相关基因和转录因子;使用Pharmmapper和Autodock进行分子对接,预测Hexarelin与MDM2的结合。
在体内和体外模型中验证Hexarelin预处理对MDM2和p53表达的影响。
通过qRT-PCR和Western blot检测肾组织和HK-2细胞中p53和MDM2的表达,并用免疫组化检测肾组织中的表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | Hexarelin | -- | -- |
| 细胞培养 | DMEM-F12培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素溶液 | Solarbio | P1410 | |
| qRT-PCR | PrimeScript RT试剂盒(含gDNA Eraser) | Takara | RR047A |
| TB Green Premix Ex Taq II | Takara | RR820A | |
| ABI-7500 | -- | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | -- | -- | |
| BCA蛋白检测试剂盒 | -- | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| β-actin抗体 | Elabscience Biotechnology | E-AB-20058 | |
| Caspase-3抗体 | Abcam | -- | |
| Bax抗体 | Elabscience Biotechnology | -- | |
| Bcl-2抗体 | Elabscience Biotechnology | -- | |
| BAD抗体 | Affinity | AF7927 | |
| P53抗体 | Elabscience Biotechnology | -- | |
| MDM2抗体 | Elabscience Biotechnology | -- | |
| 二抗(山羊抗兔或山羊抗鼠IgG-HRP) | Absin | -- | |
| 优质化学发光底物检测试剂盒 | Elabscience Biotechnology | -- | |
| 免疫组化 | 牛血清白蛋白 | Servicebio | -- |
| DAB显色试剂盒 | Servicebio | G1211 | |
| TUNEL | TUNEL凋亡检测试剂盒 | -- | -- |
| PI染色 | 碘化丙啶 | Yeasonbiotech | -- |
| 分子对接 | Autodock软件 | -- | -- |
| Pharmmapper服务器 | -- | -- | |
| Pymol软件 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立与分组 | 大鼠品系、周龄、体重、性别、分组方式、每组样本量(n=10)、Hexarelin剂量(100 μg/kg/d)、给药途径(腹腔注射)、给药时长(7天)、手术方法(双侧肾动脉夹闭45分钟再灌注24小时)、对照组设置(正常、假手术、生理盐水预处理) 阅读提示:见Materials and Methods中的Animal experiment部分及Figure 1 legends |
| 细胞培养与H/R模型 | HK-2细胞来源、培养条件(DMEM-F12、10%FBS、1%青霉素-链霉素)、缺氧处理条件(1% O2, 5% CO2, 94% N2)、缺氧时间(9小时)、复氧时间(3小时)、Hexarelin处理浓度(10^-4 μmol/L) 阅读提示:见Materials and Methods中的Cell culture and hypoxia/reoxygenation (H/R) treatment部分及Figure 3 legends |
| 凋亡相关检测 | TUNEL染色、PI染色、qRT-PCR检测Caspase-3/Bax/Bad/Bcl-2的引物序列(见补充材料)、Western blot抗体稀释比例、内参(β-actin) 阅读提示:见Materials and Methods中的TUNEL, PI staining, qRT-PCR, Western blot部分及Figures 2和4 legends |
| MDM2/p53通路验证 | qRT-PCR和Western blot检测p53/MDM2的引物和抗体信息、免疫组化抗体稀释比例(1:200) 阅读提示:见Materials and Methods中的Western blot和Immunohistochemistry部分及Figure 6 legends |
| 生信分析 | GSE98622数据集来源、差异表达基因阈值(log2FC>1.5, FDR<0.05)、GSEA方法、转录因子富集方法、分子对接软件版本和参数 阅读提示:见Materials and Methods中的Bioinformatics analysis部分及Figure 5 legends |