sEVs的分离与表征
从TNBC细胞系和患者血浆中分离并验证小细胞外囊泡
通过超速离心从MDA-MB-231细胞和患者血浆中分离sEVs,使用FACS检测CD81/CD63/CD9,透射电镜观察形态,NTA分析粒径和浓度。
TNBC-derived Gal3BP/Gal3 complex induces immunosuppression through CD45 receptor.
包含细胞系模型、患者血浆样本、体外PBMC共培养、蛋白质相互作用、Western blot、FACS、细胞因子检测等多个独立证据层级,并有功能验证(CD45阻断)和机制验证(信号通路磷酸化)。
MDA-MB-231细胞系 健康供者PBMCs TNBC患者血浆 MCF10-A正常乳腺细胞系
CD45受体阻断肽(2.9 μM,Calbiochem) GW4869(10 μM)抑制sEV生物发生 PBMCs与TEX或EX共培养48小时 Treg细胞(CD4+/CD25+/FOXP3+)及IL-10、IL-35水平 多种乳腺癌细胞系(MDA-MB-231、MCF7、BT474、MCF10-A)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
从TNBC细胞系和患者血浆中分离并验证小细胞外囊泡
通过超速离心从MDA-MB-231细胞和患者血浆中分离sEVs,使用FACS检测CD81/CD63/CD9,透射电镜观察形态,NTA分析粒径和浓度。
鉴定TNBC来源sEVs中与免疫抑制相关的蛋白
对四种来源的sEVs进行质谱分析,发现Gal3BP在TNBC样本中高表达。
证明TNBC来源的Gal3BP与分泌的Gal3形成复合物
通过ELISA-like assay和免疫共沉淀(Western blot)验证Gal3BP与Gal3的物理相互作用。
检测Gal3BP/Gal3复合物是否通过CD45影响T细胞信号
将PBMCs与TEX或复合物共培养,通过FACS检测CD45通路蛋白磷酸化,包括Lck、ZAP-70、VAV-1。
评估复合物对Treg细胞及抑制性细胞因子的影响
FACS分析Treg细胞比例,ELISA检测IL-10和IL-35。
验证阻断CD45能否逆转免疫抑制
在PBMCs中加入CD45抑制剂,检测IFN-γ分泌和效应细胞激活。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 支原体检测试剂盒 | Biological Industries | -- |
| PBMC分离 | Ficoll-Paque Plus 密度梯度离心介质 | GE Healthcare | -- |
| sEVs表征 | 醛/硫酸盐乳胶微球 | Invitrogen | -- |
| 抗人CD81-APC、CD63-APC、CD9-APC抗体 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 同型对照IgG1-APC | Miltenyi Biotec | -- | |
| Navios流式细胞仪 | Beckman Coulter | -- | |
| Kaluza软件 | Beckman Coulter | -- | |
| NanoSight NS300纳米颗粒跟踪分析仪 | Malvern Panalytical | -- | |
| JEM 1400plus透射电子显微镜 | Jeol | -- | |
| QE HF质谱仪 | Thermo Scientific | -- | |
| MaxQuant 1.5.2.8软件 | -- | -- | |
| Perseus软件 | -- | -- | |
| 生物素化抗Gal3BP抗体 | -- | -- | |
| 链霉亲和素磁珠(µMACS链霉亲和素试剂盒) | Miltenyi Biotec | -- | |
| μMACS分离器 | Miltenyi Biotec | -- | |
| 抗小鼠Gal3BP抗体(2µg/ml) | Novus Biological | -- | |
| 生物素化Gal3(0.1µg/ml) | R&D Systems | -- | |
| 山羊抗小鼠680RD | Li-Cor | -- | |
| 链霉亲和素800CW | Li-Cor | -- | |
| Li-Cor Odyssey红外成像系统 | Li-Cor | -- | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | R&D Systems | -- | |
| 蛋白质相互作用 | 吐温-20 | -- | -- |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 生物素化抗Gal3抗体 | -- | -- | |
| 链霉亲和素-辣根过氧化物酶 | -- | -- | |
| 1M盐酸 | -- | -- | |
| FACS分析 | GW4869 | Sigma-Aldrich | 6823-69-4 |
| CD45抑制剂 | Calbiochem | 345630-40-2 | |
| 抗CD3-PC5.5抗体 | Beckman Coulter | -- | |
| 抗Gal3-PE抗体 | R&D Systems | -- | |
| 抗小鼠Gal3BP抗体 | Novus Biologicals | -- | |
| 小鼠抗人FITC抗体 | Jackson ImmunoResearch | -- | |
| 共聚焦显微镜 | Cytospin 4细胞涂片机 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| 抗CD3-APC抗体 | Beckman Coulter | -- | |
| DAPI | Invitrogen | -- | |
| 封片剂 | Electron Microscopy Sciences | -- | |
| TCS SP5共聚焦激光扫描显微镜 | Leica Microsystems | -- | |
| 尼康相机 | Nikon | -- | |
| 抗CD9抗体(MACS) | -- | -- | |
| 免疫细胞激活 | ImmunoCult人CD3/CD28/CD2细胞活化剂 | StemCell Technologies | -- |
| 免疫细胞分析 | CD3-PC5.5、CD4-PC7、CD8-KO、CD56-PE、CD69、CD57、CD25抗体 | Beckman Coulter | -- |
| 破膜缓冲液 | R&D Systems | -- | |
| 细胞因子检测 | IFNγ ELISA试剂盒 | eBioscience | -- |
| 人IL-10 ELISA试剂盒 | R&D Systems | -- | |
| 人IL-35 ELISA试剂盒 | Elabscience Biotechnology | -- | |
| 统计分析 | GraphPad软件 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| sEVs分离 | 超速离心具体参数(转速、时间)、细胞培养条件(细胞代数、融合度) 阅读提示:Material and methods: Isolation of EVs from cell cultures and plasma |
| sEVs表征 | sEVs浓度(40μl:48×10^7)、抗体类型和浓度、NTA检测阈值 阅读提示:Material and methods: Characterization of sEVs; Figure 1 legend |
| Gal3BP/Gal3复合物检测 | 免疫共沉淀蛋白量(27×10^7 sEVs)、抗体浓度、Western blot条件 阅读提示:Material and methods: Western blot identification; Figure 3 legend |
| PBMCs共培养 | PBMCs数量(1×10^6)、处理时间(48小时、72小时)、GW4869浓度(10μM)、CD45抑制剂浓度(2.9μM) 阅读提示:Material and methods: FACS analysis for identification of...; Figure 5 legend |