建立耐药细胞系
获得稳定的耐他莫昔芬和耐5-氟尿嘧啶的乳腺癌细胞系,用于后续药物敏感性研究
将MCF-7细胞逐步暴露于浓度递增的他莫昔芬(1-15 µM),每个浓度维持至少4周,建立TR/MCF-7;将MDA-MB 231细胞逐步暴露于5-氟尿嘧啶(1-30 μM),建立5-FUR/MDA-MB 231
Pterostilbene-isothiocyanate reduces miR-21 level by impeding Dicer-mediated processing of pre-miR-21 in 5-fluorouracil and tamoxifen-resistant human breast cancer cell lines.
建立了两种耐药细胞系,通过细胞活力、凋亡、迁移、克隆、球体形成、侵袭等体外功能实验,RT-qPCR和免疫印迹验证分子表达,分子对接和miR-IP验证机制。
MCF-7乳腺癌细胞系 MDA-MB 231乳腺癌细胞系 耐他莫昔芬MCF-7(TR/MCF-7)细胞系 耐5-氟尿嘧啶MDA-MB 231(5-FUR/MDA-MB 231)细胞系
PTER–ITC处理浓度:TR/MCF-7为15和20 μM,5-FUR/MDA-MB 231为20和30 μM 耐药细胞系建立条件:TR/MCF-7经1-15 μM他莫昔芬逐步诱导,5-FUR/MDA-MB 231经1-30 μM 5-氟尿嘧啶逐步诱导 miR-21和靶基因表达检测使用RT-qPCR和免疫印迹,内参分别为RNU6和GAPDH miR-IP实验使用抗Dicer抗体和Protein A-Sepharose珠子,检测Dicer结合pre-miR-21水平 分子对接使用HADDOCK 2.2,pre-miR-21结构PDB ID: 5UZT
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得稳定的耐他莫昔芬和耐5-氟尿嘧啶的乳腺癌细胞系,用于后续药物敏感性研究
将MCF-7细胞逐步暴露于浓度递增的他莫昔芬(1-15 µM),每个浓度维持至少4周,建立TR/MCF-7;将MDA-MB 231细胞逐步暴露于5-氟尿嘧啶(1-30 μM),建立5-FUR/MDA-MB 231
评估PTER–ITC对耐药和非耐药乳腺癌细胞活力的抑制作用
使用MTT法检测不同浓度PTER–ITC(0.01-500 µM)处理24 h后的细胞存活率,计算IC50
检测PTER–ITC对耐药细胞迁移能力和凋亡的影响
进行伤口愈合实验,观察处理后12和24小时伤口闭合变化;通过AO/EtBr和DAPI染色观察凋亡形态
评估PTER–ITC对耐药细胞克隆形成和球体形成能力的影响
将MCF-7和TR/MCF-7细胞接种后处理,培养14天观察克隆形成;通过悬滴法形成球体,培养7天后观察
检测PTER–ITC对耐药细胞侵袭能力的影响
使用transwell小室,以Matrigel包被,检测MDA-MB 231和5-FUR/MDA-MB 231细胞侵袭能力
验证PTER–ITC对miR-21及其下游靶基因表达的影响
提取RNA进行RT-qPCR检测miR-21、pre-miR-21和靶基因(PTEN、PDCD4、TPM1、TIMP3、Fas L)的mRNA水平;Western blot检测蛋白水平
探究PTER–ITC是否通过与pre-miR-21结合阻断Dicer加工,验证其作用机制
使用HADDOCK 2.2进行分子对接,预测PTER–ITC与pre-miR-21的结合模式;通过miR-IP实验检测PTER–ITC处理后Dicer结合pre-miR-21的水平
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | Himedia | AT007 |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 胰酶-EDTA | Gibco | -- | |
| 细胞活力检测 | MTT试剂 | Himedia | TC191 |
| 细胞凋亡检测 | 吖啶橙 | Himedia | MB116 |
| 溴化乙锭 | Himedia | MB071 | |
| DAPI染料 | Himedia | MB097 | |
| 药物处理 | 5-氟尿嘧啶 | Himedia | RM1502 |
| 他莫昔芬柠檬酸盐 | Calbiochem | 579000 | |
| 溶剂 | 二甲基亚砜 | -- | -- |
| Western blot | 抗PTEN抗体 | Elabscience | E-AB-19312 |
| 抗PDCD4抗体 | Elabscience | E-AB-40340 | |
| 抗TPM1抗体 | Elabscience | E-AB-10661 | |
| 抗TIMP3抗体 | Elabscience | E-AB-65858 | |
| 抗Fas L抗体 | Elabscience | E-AB-70036 | |
| 抗Dicer抗体 | Elabscience | E-AB-13197 | |
| 抗GAPDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | Sc-47724 | |
| HRP标记的抗小鼠二抗 | Jackson ImmunoResearch | 115-035-003/111 | |
| HRP标记的抗兔二抗 | Jackson ImmunoResearch | 111-035-003/111 | |
| RT-qPCR | 逆转录酶 | Thermo Fisher Scientific | EP0441 |
| SYBR Green预混液 | Thermo Fisher Scientific | K0221 | |
| miR-IP | 蛋白A-Sepharose珠子 | G Biosciences | 786-283 |
| 细胞培养 | 96孔板 | Greiner | -- |
| Transwell小室 | Corning | -- | |
| 细胞侵袭实验 | 基质胶 | Sigma | -- |
| 结晶紫 | Himedia | -- | |
| WB | RIPA裂解液 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 耐药细胞系建立 | 他莫昔芬浓度递增步骤(1-15 µM)、5-氟尿嘧啶浓度递增步骤(1-30 µM)、每个浓度处理时间至少4周、培养基更换频率(每3天) 阅读提示:Materials and methods: Establishment of hormone- and chemo-resistant cell lines |
| PTER–ITC处理浓度 | TR/MCF-7处理剂量(15和20 μM)、5-FUR/MDA-MB 231处理剂量(20和30 μM) 阅读提示:Materials and methods: Dose determination of PTER–ITC |
| 细胞活力检测 | PTER–ITC浓度范围(0.01-500 µM)、处理时间(24小时)、MTT孵育时间(4小时)、测量波长(570 nm) 阅读提示:Materials and methods: Effect of PTER–ITC on viability of resistant and non-resistant cells |
| 分子表达检测 | RT-qPCR内参(RNU6用于miR-21/pre-miR-21,GAPDH用于靶基因)、Western blot上样对照(GAPDH) 阅读提示:Materials and methods: RT-qPCR analysis; Protein expression analysis |
| 机制验证 | 分子对接使用HADDOCK 2.2,pre-miR-21结构PDB ID 5UZT;miR-IP实验使用抗Dicer抗体和Protein A-Sepharose珠子 阅读提示:Materials and methods: Molecular docking; miRNA immunoprecipitation (miR-IP) assay |