患者突变鉴定
确定STK33基因是否与非梗阻性无精子症相关。
对620例NOA患者进行STK33基因测序,发现两个功能缺失突变;在HEK293T细胞中过表达突变体验证蛋白表达效果。
STK33 Phosphorylates Fibrous Sheath Protein AKAP3/4 to Regulate Sperm Flagella Assembly in Spermiogenesis.
包含患者突变鉴定、细胞实验、三种基因修饰小鼠模型、组织学与电镜分析、磷酸化蛋白质组学、体外激酶实验、Co-IP及ICSI功能验证,证据层级多且含功能与机制验证。
NOA患者队列 HEK293T细胞 Stk33−/−、Stk33KI/KI及Stk33-/KI小鼠 小鼠精子
NOA患者突变类型:c.1336C>A (p.Glu446*)和c.508_509delCA (p.Val170fs) 小鼠模型:Stk33−/−(移码突变)、Stk33KI/KI(无义突变)及Stk33-/KI复合突变,通过CRISPR/Cas9产生 生育力测定:雄性小鼠与WT雌鼠交配至少3个月,记录产仔数 精子分析:CASA检测精子数量、活力及前向运动 磷酸化蛋白质组学及体外激酶测定:TMT标记、Ti-IMAC富集、LC-MS/MS,STK33底物鉴定标准
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定STK33基因是否与非梗阻性无精子症相关。
对620例NOA患者进行STK33基因测序,发现两个功能缺失突变;在HEK293T细胞中过表达突变体验证蛋白表达效果。
模拟人类突变,研究Stk33突变对生育力和精子发生的影响。
利用CRISPR/Cas9构建Stk33−/−、Stk33KI/KI和Stk33-/KI小鼠,评估雄性生育力、精子数量、形态、运动能力及超微结构。
鉴定Stk33敲除后睾丸中差异磷酸化位点以确定其调控网络。
收集Stk33−/−和WT小鼠睾丸进行蛋白质提取、TMT标记、高pH反相分级和Ti-IMAC富集,通过LC-MS/MS定量磷酸化位点。
直接鉴定STK33的磷酸化底物。
使用重组STK33(WT和激酶失活K140M)对睾丸肽段进行体外激酶实验,结合18O标记和磷酸化蛋白质组学分析。
验证AKAP3/4是否为STK33直接底物及其表达变化。
通过Co-IP验证STK33与AKAP3/4相互作用,在突变小鼠中检测AKAP3/4的蛋白表达和定位。
评估Stk33缺失对精子激活卵母细胞能力的影响。
进行ICSI实验,比较WT和Stk33−/−精子注射卵母细胞后的原核形成率,并在部分实验中用SrCl2进行人工卵母细胞激活。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 基因编辑 | MEGAshortscript试剂盒 | Ambion | AM1354 |
| MEGAclear试剂盒 | Ambion | AM1908 | |
| 组织学染色 | 伊红 | Servicebio | G1002 |
| PAS染色试剂 | Solarbio | G1281 | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488 | Thermo Fisher Scientific | A21202 |
| Alexa Fluor 555 | Thermo Fisher Scientific | A32732 | |
| Hoechst 33342 | Thermo Fisher Scientific | 62249 | |
| 抗AKAP3抗体 | Proteintech | 13907-1-AP | |
| 抗AKAP4抗体 | Elabscience | E-AB-65117 | |
| 抗乙酰化微管蛋白抗体 | Sigma | T6793 | |
| 精子分析 | 人输卵管液培养基 | Irvine Scientific | 90126 |
| IVOS II精子分析仪 | Hamilton Thorne | -- | |
| 数据分析 | GraphPad Prism 9 | GraphPad | -- |
| 卵母细胞采集 | Embryomax M2培养基 | Sigma | MR-015-D |
| Hepes-CZB培养基 | Nanjing EasyCheck | M2750 | |
| 孕马血清促性腺激素 | Nanjing EasyCheck | M2620 | |
| 人绒毛膜促性腺激素 | Nanjing EasyCheck | M2520 | |
| 牛睾丸透明质酸酶 | -- | -- | |
| ICSI | PiezoXpert显微操作仪 | Eppendorf | -- |
| 蛋白提取 | Sep-Pak柱 | Waters | -- |
| OASIS HLB真空小柱 | Waters | -- | |
| 高pH反相分级 | ACQUITY UPLC M-Class系统 | Waters | -- |
| XBridge BEH C18色谱柱 | Waters | -- | |
| Agilent 1260系统 | Agilent | -- | |
| XBridge BEH300 C18色谱柱 | Waters | -- | |
| 体外激酶实验 | 碱性磷酸酶 | Sigma | P0114 |
| γ-[18O4] ATP | -- | -- | |
| 磷酸化肽段富集 | Ti-IMAC微珠 | JKchemical | -- |
| 质谱分析 | LTQ Orbitrap Fusion Lumos质谱仪 | Thermo Finnigan | -- |
| Easy-nLC 1200纳升液相色谱 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| Acclaim PepMap100 C18色谱柱 | DIONEX | -- | |
| Acclaim PepMap RSLC C18色谱柱 | DIONEX | -- | |
| C18 StageTips | -- | -- | |
| 蛋白表达与纯化 | pcDNA3.1(-)载体 | -- | -- |
| pet28a (+)载体 | -- | -- | |
| Ni-NTA琼脂糖 | Qiagen | 30210 | |
| NanoDrop分光光度计 | -- | -- | |
| 免疫共沉淀 | Xfect转染试剂 | Vazyme | T101 |
| Pierce免疫沉淀裂解缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | 87787 | |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Bimake | B14001 | |
| 蛋白A/G磁珠 | Thermo Fisher Scientific | 88802 | |
| G1亲和树脂 | GenScript | L00432 | |
| Western blot | 通用蛋白提取裂解液 | Beyotime | P0013C |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma | P8340 | |
| 聚偏二氟乙烯膜 | Bio-Rad | 1620177 | |
| 抗STK33抗体 | Proteintech | 12857-1-AP | |
| 抗GFP抗体 | Abways | AB0005 | |
| 抗β-微管蛋白抗体 | Abclonal | AC-021 | |
| 抗HA抗体 | Sigma | H6908 | |
| 抗FLAG抗体 | MBL | PM020 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abways | AB0036 | |
| 抗His抗体 | Abways | AB0002 | |
| 抗磷酸化(丝氨酸/苏氨酸)苯丙氨酸抗体 | Abcam | ab17464 | |
| 质谱分析 | MaxQuant | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 患者突变筛查 | STK33基因突变类型及位置 阅读提示:见Methods 'NOA Patient Population'和Results 'Identification of STK33 Gene Mutations in NOA Patients' |
| 小鼠模型构建 | sgRNA序列、注射方法、基因型鉴定 阅读提示:见Methods 'Animals' |
| 精子分析 | 精子提取方法、CASA参数、样本量 阅读提示:见Methods 'Fertility Test and Sperm Analysis' |
| 磷酸化蛋白质组学 | TMT标记批次、分级策略、质谱参数、筛选阈值 阅读提示:见Methods 'Protein Sample Preparation, Digestion, and TMT Labeling', 'High-pH Reverse Phase Fractionation', 'Mass Spectrometric Data Acquisition' |
| 体外激酶实验 | STK33重组蛋白表达和纯化条件、激酶反应缓冲液和ATP类型 阅读提示:见Methods 'In vitro Kinase Assay'和'Plasmids Construction and Prokaryotic Expression' |