动物模型建立与药物治疗
建立LPS诱导的ALI大鼠模型,并评估EEAR的治疗效果。
SD大鼠随机分为5组,连续7天灌胃给予生理盐水、EEAR低剂量(314.7 mg/kg)、EEAR高剂量(2517.4 mg/kg)或地塞米松(5 mg/kg),第7天给药2小时后气管内滴注LPS(5 mg/kg)诱导ALI,6小时后处死动物。
Therapeutic effects and mechanism of Atractylodis rhizoma in acute lung injury: Investigation based on an Integrated approach.
包含动物模型(LPS诱导大鼠ALI)和多个验证层级(病理、炎症因子、WB、分子对接、代谢组学),并进行功能验证与机制验证。
LPS诱导的SD大鼠急性肺损伤模型
大鼠品系和体重:Sprague-Dawley (SD) 大鼠,130 ± 10 g EEAR给药剂量和途径:低剂量314.7 mg/kg,高剂量2517.4 mg/kg,灌胃给药,连续7天 LPS诱导剂量和途径:5 mg/kg,气管内滴注 对照组:地塞米松(Dex)5 mg/kg,灌胃给药 检测时间点:LPS给药后6小时处死动物
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立LPS诱导的ALI大鼠模型,并评估EEAR的治疗效果。
SD大鼠随机分为5组,连续7天灌胃给予生理盐水、EEAR低剂量(314.7 mg/kg)、EEAR高剂量(2517.4 mg/kg)或地塞米松(5 mg/kg),第7天给药2小时后气管内滴注LPS(5 mg/kg)诱导ALI,6小时后处死动物。
评估EEAR对ALI大鼠肺组织病理变化和炎症反应的影响。
通过HE染色观察肺组织病理变化,计算肺湿/干比(W/D),并通过ELISA和免疫组化检测BALF和肺组织中TNF-α、IL-1β、IL-6和MCP-1的表达。
分析EEAR的化学成分组成。
使用UPLC-MS分析EEAR,通过与标准品对比鉴定出19种化合物。
预测EEAR治疗ALI的潜在靶点和信号通路。
基于UPLC-MS鉴定的化合物,通过SwissADME筛选类药性,通过TCMSP、SwissTargetPrediction和DrugBank预测靶点,通过GeneCards、OMIM和DrugBank获取ALI相关靶点,取交集后构建PPI网络和成分-靶点-通路网络,并进行GO和KEGG富集分析。
验证核心化合物与核心靶点的结合亲和力。
选择排名前六的化合物和排名前三的靶点(MAPK1, AKT1, PIK3CA)进行分子对接,使用AutoDock Tools 1.5.6和PyMol软件。
验证EEAR对PI3K-AKT和MAPK信号通路蛋白表达的影响。
提取肺组织蛋白,通过Western blot检测PI3K、p-PI3K、AKT、p-AKT、p38、p-p38、Erk1/2、p-Erk1/2的表达水平。
分析EEAR对ALI大鼠肺组织代谢物和代谢通路的影响。
通过GC-MS检测肺组织代谢物,使用Metaboanalyst 5.0进行多元统计分析,筛选差异代谢物并富集代谢通路。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 提取 | 80%乙醇 | -- | -- |
| UPLC-MS分析 | 甲醇 | -- | -- |
| 甲酸 | -- | -- | |
| 安捷伦1260 Infinity系统 | Agilent | -- | |
| Welch Xtimate C18色谱柱 | Welch | -- | |
| LTQ-Orbitrap-MS质谱仪 | -- | -- | |
| 标准品 | 苍术素 | Chengdu Push Biotechnology Co., Ltd. | PU02410025 |
| 绿原酸 | Chengdu Push Biotechnology Co., Ltd. | PS01311000 | |
| 阿魏酸 | Chengdu Push Biotechnology Co., Ltd. | PS01911000 | |
| 乙酰苍术醇 | Chengdu Push Biotechnology Co., Ltd. | PS22120806 | |
| 4-甲基伞形酮 | Chengdu Push Biotechnology Co., Ltd. | PS020119 | |
| 苍术内酯I | Chengdu Push Biotechnology Co., Ltd. | PS010510 | |
| 苍术内酯II | Chengdu Push Biotechnology Co., Ltd. | PS010511 | |
| 苍术内酯III | Chengdu Push Biotechnology Co., Ltd. | PS010512 | |
| 动物实验 | 脂多糖(LPS) | -- | -- |
| 地塞米松 | -- | -- | |
| ELISA | TNF-α ELISA试剂盒 | ABclonal Technology Co., Ltd. | RK00029 |
| IL-6 ELISA试剂盒 | ABclonal Technology Co., Ltd. | RK00020 | |
| IL-1β ELISA试剂盒 | ABclonal Technology Co., Ltd. | RK00009 | |
| MCP-1 ELISA试剂盒 | Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd. | SEKR0024 | |
| IHC | TNF-α抗体 | ABclonal Technology Co., Ltd. | A11534 |
| IL-6抗体 | ABclonal | A21264 | |
| IL-1β抗体 | Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd. | K108840P | |
| 二抗 | Servicebio Technology Co., Ltd. | -- | |
| Western blot | BCA试剂盒 | Elabscience Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 增强化学发光检测试剂盒 | Vazyme Biotech Co., Ltd. | -- | |
| P38抗体 | Cell Signaling Technology | 8690S | |
| p-P38抗体 | Cell Signaling Technology | 4511S | |
| Erk1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4695S | |
| p-Erk1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 4370S | |
| AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4691S | |
| p-AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 4060S | |
| PI3K抗体 | Cell Signaling Technology | 4249S | |
| β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 3700S | |
| p-PI3K抗体 | Cell Signaling Technology | 17366S | |
| GC-MS分析 | 甲氧基吡啶 | -- | -- |
| DB-5MS毛细管柱 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | 大鼠品系、性别、体重、来源;LPS剂量和给药途径;给药时间点;对照组设置 阅读提示:见Methods 2.4 Animal experiment design |
| EEAR制备 | 苍术来源、提取溶剂(80%乙醇)、提取次数和时间、提取温度 阅读提示:见Methods 2.1 Preparation of extract of Atractylodis rhizoma |
| EEAR剂量换算 | 人体与大鼠剂量换算方法;提取物得率;低、高剂量具体数值 阅读提示:见Methods 2.2 Conversion of dosage |
| 肺湿干比测定 | 肺叶选择;干燥温度和时间;计算公式 阅读提示:见Methods 2.5 Lung wet/dry ratios |
| 炎症因子检测 | BALF收集方法;ELISA试剂盒品牌和货号;检测指标 阅读提示:见Methods 2.6 Detection of inflammatory factors |
| 免疫组化 | 组织固定液和固定时间;一抗、二抗品牌和货号;抗原修复方法 阅读提示:见Methods 2.7 Immunohistochemical (IHC) staining |
| Western blot | 蛋白提取方法;蛋白定量试剂盒;上样量;一抗、二抗稀释比和孵育条件;内参 阅读提示:见Methods 2.8 Western blot analysis |
| UPLC-MS分析 | 色谱柱型号;流动相组成和梯度程序;质谱参数;标准品信息(货号) 阅读提示:见Methods 2.3 Sample pretreatment and UPLC-MS chromatographic conditions |
| 网络药理学 | 数据库版本;筛选条件(如吸收评分);靶点预测和疾病靶点来源;PPI网络置信度 阅读提示:见Methods 2.10-2.13 Compound screening, Target prediction, Network construction, Pathway enrichment analysis |
| 分子对接 | 蛋白质数据库(PDB)ID;对接软件版本;结合能阈值 阅读提示:见Methods 2.14 Molecular docking simulation of component targets |
| GC-MS代谢组学 | 样品前处理步骤(衍生化试剂和条件);色谱柱型号;质谱参数;数据处理和统计方法 阅读提示:见Methods 2.15 GC-MS analysis of the endogenous metabolites |
| 统计分析 | 统计软件(GraphPad 8.0);统计方法(one-way ANOVA, Dunnett's post hoc test);显著性水平 阅读提示:见Methods 2.16 Statistical analysis |