TNF-α诱导内皮细胞损伤模型建立
建立TNF-α诱导的内皮细胞炎症和损伤模型,并检测miR-27b表达变化。
使用40 ng/mL TNF-α处理teloHAEC、HUVEC和HCAEC细胞8小时,通过qRT-PCR检测miR-27b表达,CCK-8和LDH释放评估细胞活力。
MiR-27b attenuates mitochondrial oxidative stress and inflammation in endothelial cells.
包含多种细胞系(teloHAEC、HUVEC、HCAEC)的体外实验,细胞功能、凋亡、线粒体功能及机制验证(荧光素酶报告基因、Western blot、qRT-PCR)等至少两个独立证据层级,并包括功能验证和机制验证。
teloHAEC细胞 HUVEC细胞 HCAEC细胞
TNF-α处理浓度和持续时间(40 ng/mL,8小时) miR-27b模拟物转染浓度(20 nM)及转染试剂(Lullaby) FOXO1作为miR-27b直接靶点的验证(荧光素酶报告基因) 细胞活力检测(CCK-8)和LDH释放检测的重复数(n=4和n=3) 流式细胞术检测线粒体膜电位和凋亡的事件数(至少20,000个事件)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
建立TNF-α诱导的内皮细胞炎症和损伤模型,并检测miR-27b表达变化。
使用40 ng/mL TNF-α处理teloHAEC、HUVEC和HCAEC细胞8小时,通过qRT-PCR检测miR-27b表达,CCK-8和LDH释放评估细胞活力。
评估miR-27b过表达对TNF-α诱导的炎症反应的抑制作用。
用20 nM miR-27b mimic或阴性对照转染细胞,然后TNF-α处理,检测炎症因子VCAM1、ICAM1、IL-6和NO水平。
检测miR-27b对TNF-α诱导的细胞周期阻滞的影响。
通过PI染色和流式细胞术分析细胞周期分布,并通过Western blot检测cyclin D1和cyclin E1蛋白水平。
评估miR-27b对TNF-α诱导的线粒体氧化应激和功能障碍的影响。
使用MitoSOX检测线粒体ROS,MDA含量,GSH/GSSG和NAD+/NADH比,MitoTracker评估线粒体完整性,JC-1检测膜电位,ATP含量检测,以及p66Shc、COX-IV、SOD2乙酰化水平。
验证miR-27b对TNF-α诱导的线粒体凋亡的抑制作用。
通过Annexin V/PI双染流式细胞术检测凋亡,NucView 488和MitoView 633染色检测caspase-3激活和线粒体去极化,Western blot检测caspase-3和Bax/Bcl-2。
验证FOXO1是hsa-miR-27b-3p的直接靶基因。
通过qRT-PCR和Western blot检测FOXO1 mRNA和蛋白水平,以及Akt磷酸化水平;用双荧光素酶报告基因实验验证miR-27b与FOXO1 3'UTR的结合。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 血管细胞基础培养基 | ATCC | PCS-100-030 |
| 内皮细胞生长试剂盒-VEGF | ATCC | PCS-100-041 | |
| EGM-2MV培养基 | Lonza | CC-3202 | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 转染 | hsa-miR-27b miRNA模拟物 | Applied Biological Materials, Inc. | MCH01638 |
| miRNA模拟物阴性对照 | Applied Biological Materials, Inc. | MCH00000 | |
| Lullaby转染试剂 | OZ Biosciences | LL70500 | |
| 药物处理 | 重组人TNF-α蛋白 | Biotechne, R&D Systems, Inc. | 210-TA020 |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Donjindo Molecular Technologies, Inc. | -- |
| 细胞毒性检测 | LDH检测试剂盒-WST | Dojindo Molecular Technologies, Inc. | CK12 |
| 脂质过氧化检测 | 脂质过氧化检测试剂盒 | Abcam | ab118970 |
| 炎症因子检测 | ICAM1 ELISA试剂盒 | Abcam | ab174445 |
| VCAM1 ELISA试剂盒 | Abcam | ab223591 | |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Abcam | ab178013 | |
| NO释放检测 | 一氧化氮检测试剂盒 | Abcam | ab272517 |
| RNA提取 | 总RNA纯化试剂盒 | Norgen Biotek Corp. | 17200 |
| RNA定量 | NanoDrop2000分光光度计 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| cDNA合成 | ID3EAL cDNA合成系统 | MiRXES | 1103101 |
| ID3EAL miRNA逆转录引物1-plex hsa-miR-27b-3p | MiRXES | 1103111-HSA0000419A | |
| Tetro cDNA合成试剂盒 | Meridian Bioscience Inc. | BIO-65043 | |
| PCR | SureCycler 8800热循环仪 | Agilent Technologies | -- |
| qPCR | CFX96实时荧光定量PCR检测系统 | Bio-Rad | -- |
| ID3EAL miRNA qPCR预混液 | MiRXES | 1104202 | |
| ID3EAL miRNA qPCR引物hsa-miR-27b-3p | MiRXES | 1104101-HSA0000419A | |
| QuantiTect SYBR Green PCR试剂盒 | Qiagen | 204143 | |
| 细胞周期检测 | 碘化丙啶 | -- | -- |
| 核糖核酸酶A | -- | -- | |
| 流式细胞术 | BD Accuri C6流式细胞仪 | Becton Dickinson | -- |
| ATP检测 | ATP检测试剂盒 | Abcam | ab83355 |
| NAD+/NADH检测 | NAD+/NADH检测试剂盒-WST | Dojindo Molecular Technologies | N509 |
| 线粒体分析 | MitoTracker Green FM荧光探针 | Invitrogen | M7514 |
| MitoSOX红色线粒体超氧化物指示剂 | Invitrogen | M36008 | |
| 线粒体自噬检测试剂盒 | Dojindo Molecular Technologies | MD01 | |
| ROS阳性对照 | 甲萘醌 | Sigma Aldrich | M57405 |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1染料 | Dojindo Molecular Technologies | MT09 |
| 线粒体通透性转换孔检测 | 线粒体通透性转换孔检测试剂盒 | Abcam | ab239704 |
| 细胞核染色 | Hoechst 33342 | Abcam | ab228551 |
| 凋亡检测 | Annexin V凋亡检测试剂盒 | BD Pharmigen | 556547 |
| Nucview 488和Mitoview 633凋亡检测试剂盒 | Biotium | 30062 | |
| 荧光素酶实验 | pEGFP rbFOX1质粒 | Addgene | 63085 |
| 转染 | Dreamfect 1000转染试剂 | OZ Biosciences, Quimigen | DF41000 |
| 荧光素酶实验 | 萤火虫和海肾荧光素酶单管检测试剂盒 | Biotium | 30081-T |
| 含FOXO1 3'UTR的荧光素酶质粒 | GeneCopoeia | CS-HmiT127365-MT06-01 | |
| 对照载体 | GeneCopoeia | CmiT000001-MT06 | |
| 荧光素酶检测 | Tecan Infinite M200酶标仪 | Tecan | -- |
| Western blot | 抗BAX抗体 | Biorbyt | orb216030 |
| 抗Bcl-2抗体 | Elabscience Biotechnology Inc. | E-AB-15522 | |
| 抗磷酸化Akt (Thr308)抗体 | Cell Signaling Technology | 13038 | |
| 抗Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 2920 | |
| 抗SOD2抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-137254 | |
| 抗SOD2 (乙酰K68)抗体 | Abcam | ab137037 | |
| 抗COX-IV抗体 | Invitrogen | MA5-15078 | |
| 抗caspase-3抗体 | Cell Signaling Technology | 9662 | |
| 抗cyclin D1抗体 | Abcam | ab134175 | |
| 抗cyclin E1抗体 | Abcam | ab33911 | |
| 抗FOXO1A抗体 | Abcam | ab39670 | |
| 抗p66Shc抗体 | Abcam | ab54518 | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Elabscience Biotechnology Inc. | E-AB-20036 | |
| 抗肌动蛋白抗体 | Abcam | ab179467 | |
| 抗GAPDH抗体 | Abcam | ab9485 | |
| Excellent化学发光底物试剂盒 | Elabscience Biotechnology Inc. | E-IR-R301 | |
| ChemiDoc成像系统 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| Image Lab 6.0.1软件 | Bio-Rad Laboratories | -- | |
| ImageJ软件 | National Institutes of Health | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源及培养条件:teloHAEC、HUVEC、HCAEC;培养基及添加剂;培养温度、CO2浓度。 阅读提示:Methods 2.1节 |
| TNF-α处理 | TNF-α浓度(40 ng/mL)和处理时间(8小时);溶解缓冲液(PBS含0.1% BSA);对照组处理(HBSS-10mM Hepes)。 阅读提示:Methods 2.1节 |
| miR-27b过表达 | miR-27b mimic浓度(20 nM);转染试剂Lullaby用量;转染时间(6小时)及血清添加时间(12小时)。 阅读提示:Methods 2.1节 |
| 细胞活力与毒性检测 | CCK-8检测的孵育时间(4小时)和波长(450nm);LDH检测的孵育时间(30分钟)和波长(490nm);重复数(n=4和n=3)。 阅读提示:Methods 2.2和2.3节 |
| 线粒体功能检测 | MitoSOX、MitoTracker、JC-1等染料的浓度和孵育时间;流式事件数(至少20,000)。 阅读提示:Methods 2.12和2.13节 |