PF50的纯化和鉴定
获得并验证PF50蛋白组分。
从新鲜埃及蜂王浆中通过硫酸铵沉淀、透析和CM-Sephadex离子交换层析纯化PF50,并用SDS-PAGE分析分子量。
Major royal jelly proteins elicited suppression of SARS-CoV-2 entry and replication with halting lung injury.
包含假病毒中和、RdRp活性、肺损伤细胞模型及分子对接等多个独立实验层级,并有明确的功能和机制验证。
ACE2-HEK293细胞 LTC-A549细胞(长期培养的A549细胞) SARS-CoV-2假型慢病毒
PF50对SUK和SAfr假病毒中和实验的IC50值分别为7.25 μM和16.92 μM RdRp活性抑制实验的IC50值为29.93 μM 博来霉素诱导肺损伤模型中,PF50的EC为2.5 nM(最高安全剂量) 使用ACE2-HEK293重组细胞系(#79951)和LTC-A549细胞 实验重复数:中和实验n=3,RdRp实验n=2,肺损伤实验n≥3
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
获得并验证PF50蛋白组分。
从新鲜埃及蜂王浆中通过硫酸铵沉淀、透析和CM-Sephadex离子交换层析纯化PF50,并用SDS-PAGE分析分子量。
评估PF50抑制SARS-CoV-2变异株进入细胞的能力。
将PF50与SUK或SAfr假病毒预孵育,然后加入ACE2-HEK293细胞,培养48小时后检测荧光素酶活性。
评估PF50对SARS-CoV-2 RdRp酶活性的影响。
使用SARS-CoV-2 RdRp均相测定试剂盒,将PF50与RdRp预孵育,然后测定RNA合成活性。
建立肺损伤模型并评估PF50的保护和治疗作用。
将LTC-A549细胞暴露于博来霉素,然后用PF50或秋水仙碱进行处理或预处理,评估细胞活力、形态和生化参数。
研究PF50对氧化应激、炎症、ACE/ACE2平衡和细胞凋亡的影响。
检测ROS、GSH、TNF-α、NOX活性、ACE/ACE2活性,以及NF-κB、iNOS、TGF-β和纤连蛋白的mRNA表达。
预测PF50与S蛋白、RdRp、NOX2、ACE2、ACE和AT1R的结合机制。
利用GRAMM-X、HDOCK和PatchDock服务器进行分子对接,并分析结合亲和力。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | ACE2-HEK293重组细胞系 | BPS Bioscience | 79951 |
| 生长培养基1 N | BPS Bioscience | 79801 | |
| MEM培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 非必需氨基酸 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 嘌呤霉素 | -- | -- | |
| A549细胞 | American Type Culture Collection | CCL-185 | |
| 假病毒中和实验 | SARS-CoV-2假病毒(英国B.1.1.7) | BPS Bioscience | 78112 |
| SARS-CoV-2假病毒(南非B.1.351) | BPS Bioscience | 78142 | |
| 复苏培养基1 | BPS Bioscience | 60187 | |
| 抗S抗体(C-A11) | BPS Bioscience | 101024 | |
| ONE-Step荧光素酶试剂 | BPS Bioscience | 60690 | |
| Corning 96孔白色透明底板 | Corning | 3610 | |
| 细胞活力检测 | CellTiter-Glo试剂盒 | Promega | 7571 |
| 蛋白纯化 | CM-Sephadex | Sigma-Aldrich | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Sigma-Aldrich | -- | |
| MTT实验 | MTT | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞凋亡检测 | 碘化丙啶 | Sigma-Aldrich | -- |
| 溴化乙锭 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 吖啶橙 | Sigma-Aldrich | -- | |
| ROS检测 | DCFH-DA | Sigma-Aldrich | -- |
| NOX活性检测 | NADPH | Sigma-Aldrich | -- |
| GSH检测 | 还原型谷胱甘肽 | Sigma-Aldrich | -- |
| DTNB | Sigma-Aldrich | -- | |
| 蛋白鉴定 | SilverQuest银染试剂盒 | Thermo Fisher | LC6070 |
| 细胞凋亡检测 | FITC-Annexin V | Elabscience | E-CK-A111 |
| RdRp活性检测 | 链霉亲和素偶联供体微珠 | PerkinElmer | 6760002S |
| 肺损伤模型 | 博来霉素 | Celon Labs Pvt. Limited | -- |
| 秋水仙碱 | El Nasr Pharmaceutical Chemicals Co. | -- | |
| ACE/ACE2活性检测 | ACE2检测试剂盒 | BioVision | K897 |
| ACE检测试剂盒 | Elabscience Biotechnology | E-BC-K003-S | |
| RT-qPCR | GeneJET RNA纯化试剂盒 | Thermo Scientific | -- |
| cDNA合成试剂盒 | Thermo Scientific | -- | |
| 2× SYBR green预混液试剂盒 | Thermo Scientific | -- | |
| 正反向引物 | Bioneer | -- | |
| TNF-α检测 | TNF-α ELISA试剂盒 | RayBiotech | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | ACE2-HEK293细胞培养条件(培养基组分、嘌呤霉素浓度) 阅读提示:Methods 2.1 |
| 假病毒中和实验 | PF50浓度范围(12–0.004 μM)、预孵育时间、感染时间、IC50值 阅读提示:Methods 2.4, Results 3.4, 3.5, Figure 2, 3 |
| RdRp活性检测 | PF50浓度范围(120–0.002 μM)、酶浓度、预孵育和反应时间 阅读提示:Methods 2.5, Results 3.6, Figure 4 |
| 肺损伤模型 | LTC-A549细胞制备(培养25天)、博来霉素IC50、PF50和秋水仙碱浓度 阅读提示:Methods 2.6, Results 3.7 |
| 分子对接 | PDB ID、服务器、结合亲和力计算 阅读提示:Methods 2.7, Results 3.2, 3.6, 3.9-3.11 |