验证乌苯美司对GC细胞迁移和侵袭的抑制作用
测定乌苯美司是否抑制GC细胞的迁移和侵袭能力。
使用伤口愈合实验和Transwell实验检测不同浓度乌苯美司处理后MKN-28、MGC-803、BGC-823、SGC-7901细胞的迁移和侵袭能力,并通过Western blot检测EMT标志物(E-cadherin、N-cadherin、Vimentin)的表达。
Ubenimex Suppresses the Ability of Migration and Invasion in Gastric Cancer Cells by Alleviating the Activity of the CD13/NAB1/MAPK Pathway.
包含体外细胞实验(伤口愈合、Transwell)、Western blot、基因芯片、高内涵筛选和过表达验证,涉及功能验证和机制验证。
MKN-28人胃癌细胞系 MGC-803人胃癌细胞系 BGC-823人胃癌细胞系 SGC-7901人胃癌细胞系
乌苯美司浓度:0.12 mg/mL或0.25 mg/mL(转染实验用0.12 mg/mL) CD13过表达质粒转染后乌苯美司对迁移侵袭的抑制作用被抵消,验证靶向性 NAB1过表达质粒转染后恢复p90RSK、ERK1/2、RPS6、Rab11表达水平 细胞在无血清条件下培养10小时后进行Transwell实验 所有实验重复至少三次,统计显著性P<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
测定乌苯美司是否抑制GC细胞的迁移和侵袭能力。
使用伤口愈合实验和Transwell实验检测不同浓度乌苯美司处理后MKN-28、MGC-803、BGC-823、SGC-7901细胞的迁移和侵袭能力,并通过Western blot检测EMT标志物(E-cadherin、N-cadherin、Vimentin)的表达。
验证乌苯美司是否通过下调CD13抑制迁移和侵袭。
用Western blot检测乌苯美司处理后CD13蛋白表达水平;将CD13过表达质粒转染至GC细胞,再进行Transwell实验,观察对乌苯美司作用的影响。
鉴定与乌苯美司介导的GC转移抑制相关的靶基因。
使用Affymetrix Clariom S基因芯片比较MKN-28细胞处理前后基因表达谱,选择下调超过两倍的基因,进行高内涵筛选,分析沉默候选基因后细胞迁移率变化。
确定CD13与NAB1之间的上下游关系。
通过Western blot检测CD13或NAB1过表达后对方蛋白表达的影响,并检测乌苯美司处理后NAB1表达变化。
探究乌苯美司是否通过抑制MAPK信号通路激活来抑制转移,并验证NAB1的作用。
用Western blot检测乌苯美司处理后p-MAPK及其下游分子(p90RSK、ERK1/2、RPS6、Rab11)的表达;将NAB1过表达质粒转染至GC细胞,再检测这些分子的表达,并进行Transwell实验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 乌苯美司 | Shenzhen Main Luck Pharmaceuticals Inc. | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素和链霉素 | North China Pharmaceutical Co., Inc. | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白磷酸酶抑制剂 | Solarbio | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | -- | |
| PVDF膜 | Millipore | -- | |
| 抗ANPEP抗体 | Abcam | ab108382 | |
| 抗NAB1抗体 | Abcam | ab150389 | |
| 抗p-MAPK抗体 | Abcam | ab151279 | |
| 抗E-cadherin抗体 | Elabscience | E-AB-53267 | |
| 抗N-cadherin抗体 | Elabscience | E-AB-70061 | |
| 抗Vimentin抗体 | Elabscience | E-AB-18212 | |
| 抗β-actin抗体 | Proteintech | 20536-1-AP | |
| 二抗 | Proteintech | SA00001-2 | |
| 细胞培养 | Lipofectamine 3000转染试剂 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| Transwell实验 | Transwell小室 | Corning | -- |
| 基质胶 | BD Biosciences | -- | |
| 基因芯片 | Affymetrix Clariom S基因芯片 | Affymetrix | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 药物处理 | 乌苯美司的浓度(0.12 mg/mL和0.25 mg/mL)及处理时间(Transwell实验为24小时,伤口愈合实验为特定时间) 阅读提示:Methods中的Reagents and Antibodies和Cell Culture,以及图1和图2的图注 |
| 细胞培养 | 胃癌细胞系来源(中国科学院细胞库),培养基DMEM+10% FBS,100 U/mL青霉素和100 μg/mL链霉素,37°C、5% CO2培养条件 阅读提示:Methods中的Cell Culture |
| 细胞转染 | CD13或NAB1过表达质粒(Lipofectamine 3000转染,24小时) 阅读提示:Methods中的Cell Transfection |
| 迁移和侵袭检测 | Transwell实验细胞密度3×10^5 cells/mL,无血清预处理10小时,Matrigel稀释比例1:8,孵育24小时;伤口愈合实验细胞密度5×10^5 cells/孔,划痕后加入乌苯美司 阅读提示:Methods中的Transwell Assays和Wound Healing Assays |
| 蛋白表达检测 | 使用RIPA裂解液和PMSF、磷酸酶抑制剂,BCA定量,10% SDS-PAGE,PVDF膜,一抗孵育过夜,二抗室温1.5小时 阅读提示:Methods中的Western Blot Assays |