人类芽囊原虫分离株的分子分型
鉴定有症状患者的芽囊原虫亚型及亚型内遗传变异。
从350例有胃肠道症状患者粪便中分离芽囊原虫,经培养后通过PCR鉴定STs,并用PCR/HRM区分ST3亚型内变异(野生型、突变型、杂合型)。
Levels of Genetic Variants Among Symptomatic Blastocystis Subtypes and their Relationship to Mucosal Immune Surveillance in the Precancerous Colons of Experimentally Infected Rats.
包含人类分离株分子分型(PCR/HRM)、大鼠体内感染模型、组织病理学、免疫组化、免疫细胞计数、sIgA检测及TEM等多层级实验验证。
大鼠(Sprague-Dawley)实验感染模型 人芽囊原虫分离株
人类粪便样本分离株的亚型鉴定(PCR)及ST3亚型内变异(PCR/HRM) 大鼠感染剂量:7×10^4个芽囊原虫包囊,4日龄无菌培养 感染确认后8周处死大鼠,进行组织病理学检查 MUC2免疫组化评分系统(弱反应:0-2分,强反应:3-4分) 免疫细胞计数(杯状细胞、IELs、肥大细胞)每10个绒毛隐窝单位(VCU)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定有症状患者的芽囊原虫亚型及亚型内遗传变异。
从350例有胃肠道症状患者粪便中分离芽囊原虫,经培养后通过PCR鉴定STs,并用PCR/HRM区分ST3亚型内变异(野生型、突变型、杂合型)。
评估不同芽囊原虫亚型/亚型内变异在体内诱导癌前息肉的能力。
将各亚型/亚型内变异口服感染4周龄雄性Sprague-Dawley大鼠,感染后第3、7天检查粪便确认感染,8周后处死大鼠,检查结肠息肉形成。
检测感染大鼠结肠中与息肉形成相关的黏膜免疫指标变化。
通过免疫组化检测MUC2表达,通过PAS染色计数杯状细胞,通过Giemsa染色计数IELs,通过甲苯胺蓝染色计数肥大细胞,并测量组织sIgA水平。
观察芽囊原虫对结肠黏膜的侵袭程度及其与息肉形成的关系。
对感染大鼠结肠组织进行透射电镜检查,观察寄生虫在肠腔和黏膜层的位置及侵袭情况。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 粪便样本处理 | 卢戈碘液 | -- | -- |
| 福尔马林-乙酸乙酯沉淀法 | -- | -- | |
| 改良抗酸三色染色 | -- | -- | |
| 沙门-志贺琼脂 | -- | -- | |
| 麦康凯琼脂 | -- | -- | |
| 寄生虫培养 | 改良Jones培养基 | -- | -- |
| 马血清 | -- | -- | |
| 链霉素 | -- | 57-92-1 | |
| 青霉素 | -- | 61-33-6 | |
| DNA提取 | QIAamp DNA微型试剂盒 | Qiagen | -- |
| PCR | Taq DNA聚合酶 | -- | -- |
| PCR/HRM | SYBR Green 1染料 | Roche | -- |
| Fast Star Taq DNA聚合酶 | Applied Biosystems | -- | |
| LightCycler 480实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- | |
| 组织固定 | 10%中性缓冲福尔马林 | -- | -- |
| 免疫组化 | MUC2抗体(克隆Ccp58) | Novocastra | -- |
| 柠檬酸盐缓冲液 | -- | -- | |
| DAKO EnVision+检测系统 | DAKO | -- | |
| 组织化学染色 | 希夫试剂 | -- | -- |
| 吉姆萨染液 | -- | -- | |
| 甲苯胺蓝 | -- | 92-31-9 | |
| 透射电镜 | EPON树脂 | -- | -- |
| 醋酸铀 | -- | 541-09-3 | |
| 柠檬酸铅 | -- | 512-26-5 | |
| UC6超薄切片机 | Leica | -- | |
| JEOL JEM-1400透射电子显微镜 | JEOL | -- | |
| sIgA测量 | ELISA试剂盒 | Wuhan Elabscience Biotechnology Co., Ltd | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 人类分离株分型 | 样本选择标准:仅纳入芽囊原虫为唯一肠道病原体的样本;PCR引物序列;HRM分析条件。 阅读提示:Methods 中 'The Source of the Blastocystis Isolates'、'Molecular Characterization of Human Blastocystis' 部分 |
| 动物实验 | 大鼠品系、年龄、性别、体重;感染剂量(7×10^4包囊);感染时长(8周);动物数量。 阅读提示:Methods 中 'Experimental Study' 部分 |
| 组织学与免疫组化 | 组织固定方法;MUC2抗体克隆及稀释度;评分系统;细胞计数方法。 阅读提示:Methods 中 'Immunohistochemistry'、'Light Microscopy Tissue Examination' 部分 |
| 透射电镜 | 组织处理步骤(固定、脱水、包埋)、切片厚度、观察电压。 阅读提示:Methods 中 'Transmission Electron Microscopy (TEM) Examination of Tissues' 部分 |
| sIgA测量 | 组织处理(超声破碎参数)、ELISA试剂盒品牌及操作步骤。 阅读提示:Methods 中 'Measurement of sIgA in the Different Groups of Blastocystis-Infected Rats' 部分 |