谱系追踪确定Tbx1表达细胞
确定Tbx1在脑发育中的表达细胞类型及分布模式
使用Tbx1Cre/+;RosamTmG小鼠进行谱系追踪,通过免疫染色检测GFP标记的Tbx1表达细胞与内皮细胞标志物KDR或GLUT1的共定位。
VEGFR3 modulates brain microvessel branching in a mouse model of 22q11.2 deletion syndrome.
包含基因表达谱系追踪、遗传互作实验、体外Matrigel实验和转基因过表达拯救实验,多层次功能验证。
小鼠胚胎脑 HUVEC细胞 bEND5细胞
Tbx1Cre/+;Vegfr3flox/+胚胎的脑切片分支点和丝状伪足密度 Vegfr3+/−胚胎的脑切片分支点和丝状伪足密度 HUVEC中转染siRNA-TBX1和pcDNA3-Vegfr3后的微管分支 TgVegfr3;Tbx1Cre/+和TgVegfr3;Tbx1Cre/lacZ胚胎的脑血管密度 Tbx1Cre/+;RosamTmG胚胎中Tbx1谱系细胞分布
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定Tbx1在脑发育中的表达细胞类型及分布模式
使用Tbx1Cre/+;RosamTmG小鼠进行谱系追踪,通过免疫染色检测GFP标记的Tbx1表达细胞与内皮细胞标志物KDR或GLUT1的共定位。
寻找TBX1-VEGFR3相互作用的潜在位点
对Tbx1Cre/+;RosamTmG胚胎的脑切片进行GFP和VEGFR3共染色,分析共定位情况,特别关注尖端细胞。
检验Vegfr3杂合缺失对Tbx1突变表型的影响
将Tbx1Cre/+和Vegfr3flox/+小鼠杂交,在E18.5胚胎脑切片中定量分支点密度和丝状伪足密度。
评估Vegfr3表达变化对内皮细胞微管分支的影响
在HUVECs中敲低或过表达Vegfr3,并在Matrigel中培养,定量微管分支点。
验证Tbx1驱动Vegfr3过表达是否挽救Tbx1突变体的脑血管异常
将Tbx1Cre/+与TgVegfr3小鼠杂交,在E18.5胚胎脑切片中定量血管密度和丝状伪足密度。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 免疫荧光 | 抗GLUT1抗体 | Abcam | ab40084 |
| 抗GFP抗体 | Abcam | ab13970 | |
| 抗VEGFR3/FLT4抗体 | eBioscience | 14-5988-85 | |
| 抗VEGFR3/FLT4抗体 | Elabscience | 36398 | |
| 抗VEGFR2/KDR抗体 | BD Pharmingen | 550549 | |
| 细胞培养 | 人脐静脉内皮细胞 | Lonza | -- |
| bEND5细胞 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| RNA干扰 | ON-TARGETplus SMARTpool siRNA | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 过表达 | pcDNA3-Vegfr3质粒 | GeneCopoeia | -- |
| pcDNA3-TBX1质粒 | -- | -- | |
| Matrigel分析 | Matrigel基质胶 | BD Bioscience | -- |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | GIBCO | -- |
| 胎牛血清 | GIBCO | -- | |
| 显微镜 | Leica DMI6000B显微镜 | Leica | -- |
| 尼康共聚焦显微镜A1 | Nikon | -- | |
| Leica Thunder成像系统 | Leica Microsystems | -- | |
| Olympus CKX41图像分析仪 | Olympus | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 谱系追踪 | Tbx1Cre/+;RosamTmG胚胎的阶段(E9.5-E18.5)、脑切片方向(冠状)、免疫染色抗体(抗KDR或抗GLUT1)及共定位分析。 阅读提示:Methods: Immunofluorescence on brain sections; Figure 1 and 2 legends |
| 遗传互作 | Tbx1Cre/+;Vegfr3flox/+和Vegfr3+/−胚胎的脑切片分支点和丝状伪足密度。 阅读提示:Methods: Quantitative analysis of vascular anomalies; Figure 4 legend |
| 体外实验 | HUVECs的转染条件(siRNA浓度、质粒用量)、Matrigel培养时间和分支点定量方法。 阅读提示:Methods: Cell manipulations, Matrigel assays; Figure 5 legend |
| 转基因拯救 | TgVegfr3;Tbx1Cre/+和TgVegfr3;Tbx1Cre/lacZ胚胎的脑切片血管密度和丝状伪足密度。 阅读提示:Methods: Quantitative analysis of vascular anomalies; Figure 6 legend |
| qRT-PCR | Vegfr3基因表达水平,内参基因(PECAM1和GAPDH)的选择。 阅读提示:Figure S5 legend; Methods: Cell manipulations |