高通量筛选NF-κB抑制剂
鉴定能抑制NF-κB激活的化合物
使用Prestwick化学库(1270种FDA批准药物)处理U2OS细胞,通过免疫荧光检测NEMO斑点形成,筛选出4种命中物,其中Auranofin效果最强。
The FDA-approved drug Auranofin has a dual inhibitory effect on SARS-CoV-2 entry and NF-κB signaling.
包含高通量筛选、体外抗病毒实验、机制研究(NF-κB信号、内吞、ACE2扩散)等多层级验证。
U2OS细胞 Vero E6细胞 A549-hACE2细胞 Calu-3细胞
Auranofin作用浓度:5μM预处理90分钟用于NF-κB实验,2.5μM用于SARS-CoV-2感染实验 SARS-CoV-2感染实验:MOI 0.05,感染48小时(Calu-3)或MOI 0.01,感染48小时(其他细胞) 抗病毒活性检测:RT-qPCR检测E基因,MTS法检测细胞活力 内吞实验:使用CTxB-FITC、EGF-Alexa555和Transferrin-A488,在4℃结合后转37℃内吞
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定能抑制NF-κB激活的化合物
使用Prestwick化学库(1270种FDA批准药物)处理U2OS细胞,通过免疫荧光检测NEMO斑点形成,筛选出4种命中物,其中Auranofin效果最强。
确认Auranofin对NF-κB信号传导的抑制作用及其作用位点
用Auranofin预处理U2OS细胞,然后刺激IL-1、TNF-α或LPS,通过Western blot检测IKK磷酸化和IκBα降解,并通过免疫沉淀检测NEMO募集和泛素化。
检测Auranofin是否抑制SARS-CoV-2复制
在Vero E6、A549-hACE2和Calu-3细胞中,先用Auranofin预处理2小时,然后感染SARS-CoV-2(MOI 0.01),48小时后通过RT-qPCR检测病毒RNA,并用MTS法评估细胞活力。
确定Auranofin抑制SARS-CoV-2进入的机制
通过使用荧光标记的病毒样颗粒(VLP)进行内吞实验,以及用CTxB、EGF和转铁蛋白检测内吞途径,同时用FCS测量ACE2的扩散系数。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 金诺芬 | Sigma Aldrich | A6733 |
| 瑞德西韦 | TEBU | 282T7766 | |
| 甲磺酸卡莫司他 | Sigma Aldrich | SML0057 | |
| 小白菊内酯 | Sigma Aldrich | P0667 | |
| ML120B | Sigma Aldrich | 783348-36-7 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | Gibco Life Technologies | 11560636 | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco Life Technologies | 11548876 | |
| Western blot | 抗NEMO抗体 | Santa Cruz Biotechnology Inc | sc8330 |
| 抗磷酸化IKKα/β抗体 | Cell Signaling Technology | 16A6 | |
| 抗IκBα抗体 | Becton Dickinson | 610690 | |
| 抗β-微管蛋白抗体 | Sigma-Aldrich | T4026 | |
| 抗ACE2抗体 | R&D | AF3437 | |
| 细胞培养 | A549-hACE2细胞 | ECACC | -- |
| Vero E6细胞 | ECACC | -- | |
| Calu-3细胞 | Elabscience | EP-CL-0054 | |
| U2OS细胞 | ATCC | HTB-96 | |
| RT-qPCR | Luna细胞裂解模块 | New England Biolabs | E3032S |
| 细胞活力检测 | MTS检测 | Promega | G5421 |
| 胆固醇检测 | Amplex Red胆固醇检测试剂盒 | Life Technologies | A12216 |
| 内吞实验 | 霍乱毒素-FITC | Merck | C1655 |
| 转铁蛋白Alexa 488 | Thermo Fisher | T13342 | |
| 生物素化EGF/链霉亲和素Alexa 555 | Thermo Fisher | E35350 | |
| 细胞融合实验 | HEK 293T细胞 | -- | -- |
| 脂质分析 | NR12S | Tocris Bioscience | 1221739-85-0 |
| 共聚焦显微镜 | LSM780共聚焦显微镜 | Zeiss | -- |
| 高内涵筛选 | Opera Phenix高内涵筛选系统 | Perkin Elmer | -- |
| 流式细胞术 | LSRFortessa流式细胞分析仪 | Becton-Dickinson Biosciences | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| NF-κB抑制实验 | Auranofin浓度和预处理时间;刺激物(IL-1, TNF-α, LPS)浓度和刺激时间 阅读提示:图2及方法部分'Cell lysis, immunoprecipitation and immunoblotting' |
| SARS-CoV-2感染实验 | 细胞系;MOI;感染时间;Auranofin浓度;病毒RNA检测方法(RT-qPCR) 阅读提示:图3及方法部分'Assessment of antiviral activity' |
| 内吞实验 | Auranofin浓度;标记物浓度(CTxB, EGF, Transferrin);结合温度和时间;内吞时间 阅读提示:图6及方法部分'Endocytosis assays' |