miR-10b在OSCC组织和细胞系中的表达分析
验证miR-10b在OSCC中的表达水平是否升高。
通过miRNA微阵列和RT-qPCR检测20对OSCC组织及癌旁组织中miR-10b表达;RT-qPCR检测OSCC细胞系(TCA-8113, SCC-15, SCC-25, CAL-27)和HOK细胞中的miR-10b表达。
The microRNA-10b-Bim axis promotes cancer progression through activating autophagy in oral squamous cell carcinoma.
包含临床样本、体外细胞、体内异种移植模型及机制验证(双荧光素酶报告基因、自噬检测、挽救实验等)。
口腔鳞状细胞癌(OSCC)临床组织样本(20对肿瘤及癌旁组织) 人OSCC细胞系(TCA-8113、SCC-15、SCC-25、CAL-27) 人正常口腔角质形成细胞(HOK) BALB/c裸鼠异种移植瘤模型
miR-10b在OSCC组织和细胞系中的表达上调(RT-qPCR验证) miR-10b mimics/inhibitor转染SCC-25细胞效率(RT-qPCR验证) 自噬标志物LC3-II、p62及ATG5蛋白表达(Western blot) Bim作为miR-10b直接靶点(双荧光素酶报告基因) 裸鼠异种移植瘤生长(LV-ANTI-miR-10b干预,肿瘤体积和重量)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证miR-10b在OSCC中的表达水平是否升高。
通过miRNA微阵列和RT-qPCR检测20对OSCC组织及癌旁组织中miR-10b表达;RT-qPCR检测OSCC细胞系(TCA-8113, SCC-15, SCC-25, CAL-27)和HOK细胞中的miR-10b表达。
探究miR-10b对OSCC细胞迁移、侵袭、增殖和凋亡的作用。
将miR-10b mimics或inhibitor转染SCC-25细胞,进行划痕实验、Transwell迁移和侵袭实验、集落形成实验、CCK-8增殖实验和流式细胞术凋亡检测。
验证miR-10b是否调节OSCC细胞的自噬。
通过Western blot检测自噬标志蛋白LC3-II、p62和ATG5;透射电镜观察自噬体;使用sensGFP-stubRFP-LC3腺病毒检测自噬流;动物实验中通过IHC检测LC3和p62。
证明自噬是miR-10b促进OSCC进展所必需的。
使用si-ATG5抑制自噬,结合miR-10b mimics,检测迁移、侵袭、增殖和凋亡的变化。
确定miR-10b在OSCC中的直接靶基因。
使用TargetScan、miRDB、microT_CDS和EIMMo数据库预测靶基因,通过RT-qPCR筛选候选基因,双荧光素酶报告基因验证miR-10b与Bim 3'UTR的相互作用。
验证Bim对OSCC细胞功能的抑制作用及miR-10b的逆转效应。
将Bim过表达质粒单独或与miR-10b mimics共转染SCC-25细胞,检测迁移、侵袭、增殖和凋亡。
阐明miR-10b-Bim轴调控OSCC自噬的分子机制。
Western blot检测Bim、LC3-II、p62、Beclin-1、Bcl-2、Bax表达;透射电镜观察自噬体;免疫荧光和sensGFP-stubRFP-LC3检测自噬流。
验证miR-10b在体内对OSCC肿瘤生长和自噬的作用。
将LV-ANTI-miR-10b或LV-control处理的SCC-25细胞皮下注射到裸鼠,监测肿瘤体积和重量,并通过IHC检测LC3和p62。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞转染 | Lipofectamine3000 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RNA提取与PCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | Prime Script RT试剂盒 | Takara | -- |
| SYBR Green PCR Master Mix | Takara | -- | |
| CFX96实时荧光定量PCR检测系统 | Bio-Rad | -- | |
| 细胞增殖 | CCK-8试剂盒 | Solarbio | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC | -- | -- |
| 碘化丙啶(PI) | -- | -- | |
| Western blot | 聚偏二氟乙烯膜 | Millipore | -- |
| 抗p62抗体 | Proteintech | 18420-1-AP | |
| 抗LC3抗体 | Proteintech | 14600-1-AP | |
| 抗ATG5抗体 | Proteintech | 10181-2-AP | |
| 抗Bim抗体 | Cell Signaling Technology | #2933 | |
| 抗BCL-2抗体 | Proteintech | 12789-1-AP | |
| 抗Bax抗体 | Cell Signaling Technology | #14796 | |
| 抗GAPDH抗体 | Elabscience | E-AB-20072 | |
| 抗Beclin-1抗体 | Proteintech | 11306-1-AP | |
| 山羊抗兔IgG | Proteintech | 10285-1-AP | |
| 免疫组化 | 兔抗LC3抗体 | Proteintech | 14600-1-AP |
| 兔抗Bim抗体 | Proteintech | 22037-1-AP | |
| 兔抗p62抗体 | Proteintech | 18420-1-AP | |
| DAB显色剂 | Sangon Biotech | -- | |
| 免疫荧光 | 抗LC3抗体 | Proteintech | 14600-1-AP |
| 抗兔二抗 | Proteintech | SA00007-2 | |
| DAPI | Solarbio | -- | |
| 自噬检测 | stubRFP-sensGFP-LC3腺病毒 | Genechem | -- |
| 透射电镜 | 透射电子显微镜(JEM-1200) | Jeol | JEM-1200 |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 样本和细胞系 | OSCC组织样本来源(20对OSCC和配对癌旁组织),细胞系(TCA-8113, SCC-15, SCC-25, CAL-27, HOK)的来源及培养条件 阅读提示:Materials and methods: Patients and specimens, Cell culture and transfection |
| 转染实验 | miR-10b mimics/inhibitor浓度,转染试剂Lipofectamine3000用量,转染时间 阅读提示:Materials and methods: Cell culture and transfection |
| 自噬检测 | 氯喹(CQ)处理浓度(10 μM)和时间(2小时),Western blot检测LC3-II和p62的条件 阅读提示:Figure 6 legend, Materials and methods: Western blot analysis |
| 靶点验证 | Bim 3'UTR双荧光素酶报告基因实验的转染比例和检测时间(48小时) 阅读提示:Materials and methods: Luciferase reporter assay |
| 动物实验 | 裸鼠品系(BALB/c),细胞注射量(5×10^6),注射体积(100 μL),肿瘤测量频率(每7天)和时间(28天) 阅读提示:Materials and methods: Xenotransplantation |