细胞活力与形态评估
评估TCS对Neuro-2a细胞活力及形态的影响,确定后续实验浓度。
使用MTT比色法检测细胞活力,AO/EB双染观察细胞形态和死亡类型。
Triclosan-induced neuroinflammation develops caspase-independent and TNF-α signaling pathway associated necroptosis in Neuro-2a cells.
实验包括细胞活力、自噬、线粒体、坏死性凋亡和tau蛋白检测,但缺乏动物模型和患者样本验证,且部分机制研究存在缺口。
小鼠神经母细胞瘤Neuro-2a细胞系
TCS浓度:1、10、30、50 µM 处理时间:24小时 阳性对照:temsirolimus(0.2 µM)用于自噬,CCCP(20 µM)用于线粒体 坏死性凋亡抑制剂:Nec-1(0.1 µM) 细胞系:Neuro-2a(NCCS, India)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估TCS对Neuro-2a细胞活力及形态的影响,确定后续实验浓度。
使用MTT比色法检测细胞活力,AO/EB双染观察细胞形态和死亡类型。
检测TCS是否影响自噬过程,包括自噬标志物表达、自噬小体形成及自噬通量。
通过RT-qPCR和Western blot检测LC3B、ATG7、p62表达;使用MDC染色、EGFP-LC3 puncta和LysoTracker染色观察自噬小体和自噬溶酶体。
评估TCS对线粒体完整性的影响。
使用JC-1荧光探针检测线粒体膜电位变化。
探究TCS是否诱导CASP8非依赖性坏死性凋亡,并验证TNF-α信号通路。
使用DNA片段化分析、RT-qPCR和Western blot检测TNF-α、RIPK1、RIPK3、MLKL及其磷酸化水平,并使用Nec-1抑制RIPK1活性。
评估TCS是否诱导tau蛋白表达和磷酸化,提示神经退行性变风险。
通过RT-qPCR和Western blot检测tau和p-tau表达水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Himedia | AT-007 |
| 胎牛血清 | Gibco | 11573397 | |
| 抗生素-抗真菌溶液 | Gibco | 15240062 | |
| 药物处理 | 三氯生 | Tokyo Chemical Industry | T1872 |
| 溶剂对照 | 二甲基亚砜 | Himedia | TC185 |
| 细胞活力检测 | MTT染料 | Himedia | TC191 |
| FLOUstar optima酶标仪 | BMG labtech | -- | |
| 染色 | 吖啶橙 | Sigma | 318337 |
| 溴化乙锭 | Sigma | E28751 | |
| 荧光显微 | EVOS FL细胞成像系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 自噬分析 | 替西罗莫司 | Sigma | PZ0020 |
| 单丹磺酰尸胺 | Sigma | D4008 | |
| LC3-puncta assay | EGFP-LC3质粒 | ADDgene | 11546 |
| Ultra293转染试剂 | GeneDireX | MB056 | |
| 共聚焦激光扫描显微镜LSM 780 | Carl Zeiss | -- | |
| 溶酶体染色 | 溶酶体红色荧光探针DND99 | Thermo Fisher Scientific | L7528 |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1荧光探针 | Abbkine Scientific | KTA4001 |
| RNA提取 | RNA X-Press试剂 | Himedia | MB601 |
| RT-qPCR | RevertAid第一链cDNA合成试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | K1621 |
| PowerUp SYBR Green预混液 | Applied Biosystems | A25742 | |
| QuantStudio 5实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解缓冲液 | Himedia | TC131 |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Himedia | ML051 | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Sigma | 71258-M |
| Western blot | PVDF膜 | -- | -- |
| 牛血清白蛋白 | -- | -- | |
| ECL试剂盒 | Bio-Rad Laboratories | 17506061 | |
| ImageJ软件 | NIH | -- | |
| Western blot - 一抗 | ATG7抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-376212 |
| MAP LC3β抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-271625 | |
| p62抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-48402 | |
| CASP8抗体 | CST | 4927 | |
| CASP3抗体 | Elabscience | E-AB-13815 | |
| TNF-α抗体 | Elabscience | E-AB-40015 | |
| RIPK3抗体 | Elabscience | E-AB-60962 | |
| MLKL抗体 | Elabscience | E-AB-61022 | |
| P-MLKL (Ser358)抗体 | GeneTex | GTX00973 | |
| Tau抗体 | GeneTex | GTX112981 | |
| P-Tau (Ser198)抗体 | GeneTex | GTX130456 | |
| β-Actin抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47778 | |
| 坏死性凋亡抑制 | 坏死抑素-1 | -- | -- |
| DNA片段化检测 | 琼脂糖 | -- | -- |
| 溴化乙锭 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞活力检测 | 细胞密度(5000 cells/well)、TCS浓度(1-50 µM)、处理时间(24小时)、MTT孵育时间(4小时)、吸收波长(570 nm) 阅读提示:见Methods 2.2节 |
| 自噬功能分析 | TCS浓度(10、30、50 µM)、阳性对照temsirolimus浓度(0.2 µM)、处理时间(24小时)、转染质粒(EGFP-LC3 2 µg)、染色浓度和时间(MDC 0.5 mM,30分钟) 阅读提示:见Methods 2.5-2.7节以及图3、图4 |
| 线粒体膜电位检测 | TCS浓度(10、30、50 µM)、阳性对照CCCP浓度(20 µM,30分钟)、处理时间(24小时)、JC-1染色时间(30分钟) 阅读提示:见Methods 2.8节 |
| 坏死性凋亡通路验证 | TCS浓度(10、30、50 µM)、Nec-1浓度(0.1 µM)、处理时间(24小时)、蛋白检测抗体稀释度 阅读提示:见Methods 2.3、2.9、2.10节及图6、图7 |
| tau病理分析 | TCS浓度(10、30、50 µM)、处理时间(24小时)、tau和p-tau抗体稀释度(1:1000) 阅读提示:见Methods 2.9、2.10节和图8 |