体外培养细胞信号通路分析
确定candidalysin激活的MAPK通路及EGFR的作用
用TR146细胞,使用多种激酶抑制剂和candidalysin刺激,通过免疫印迹检测信号蛋白磷酸化。
The Candida albicans toxin candidalysin mediates distinct epithelial inflammatory responses through p38 and EGFR-ERK pathways.
包含体外培养细胞(TR146)通路抑制剂、siRNA敲低、免疫印迹、ELISA等验证,以及小鼠OPC模型体内实验和Fos条件敲除小鼠验证,多层级证据支持。
TR146人口腔上皮细胞 BALB/c小鼠OPC模型 C57BL/6小鼠OPC模型 FosK13上皮特异性c-Fos敲除小鼠
candidalysin处理浓度70 μM,处理时间30 min(信号)和24 h(细胞因子) BIRB796(10 μM)抑制p38,Gefitinib(2 μM)和PD153035(500 nM)抑制EGFR 小鼠OPC模型中BIRB796给药方案:50 mg/kg腹腔注射,感染前1天开始每12小时一次 FosK13小鼠与Il17ra-/-对照小鼠的感染实验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定candidalysin激活的MAPK通路及EGFR的作用
用TR146细胞,使用多种激酶抑制剂和candidalysin刺激,通过免疫印迹检测信号蛋白磷酸化。
明确各通路对candidalysin诱导的细胞因子释放的贡献
在抑制剂存在下用candidalysin处理TR146细胞24小时,使用Luminex和ELISA检测细胞因子。
鉴定candidalysin激活p38的上游激酶及其差异性输出
通过siRNA敲低MKK3/6、MKK4和Src抑制剂处理,评估p38磷酸化及下游信号。
评估p38和c-Fos在白色念珠菌感染中的功能相关性
使用BIRB796抑制p38或FosK13小鼠,感染白色念珠菌,评估真菌载量、炎症因子表达和组织病理。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | -- | |
| 信号通路抑制 | BIRB796 | Selleckchem | S1574 |
| SB203580 | Selleckchem | S1076 | |
| 吉非替尼 | -- | -- | |
| 曲美替尼 | -- | -- | |
| SP600125 | -- | -- | |
| 达沙替尼 | Selleckchem | S1021 | |
| PD153035 | Selleckchem | S6546 | |
| PP1 | Merck | 0040 | |
| 西妥昔单抗 | Merck KGaA | -- | |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | -- | -- |
| 蛋白酶抑制剂 | Merck | 05892791001 | |
| 磷酸酶抑制剂 | Merck | PHOSS-RO | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | ThermoFisher Scientific | 23227 | |
| 4-12% Bis-Tris凝胶 | Invitrogen | -- | |
| PVDF膜 | Merck Millipore | -- | |
| LI-COR Odyssey CLx成像仪 | LI-COR | -- | |
| 免疫沉淀 | Protein G磁珠 | Thermo Fisher Scientific | 10003D |
| 细胞因子检测 | 磁性Luminex人基础试剂盒A | R&D systems | LUHM000 |
| Bioplex 200 | -- | -- | |
| RNA干扰 | ON-TARGETplus siRNA | Dharmacon | -- |
| HiPerFect转染试剂 | QIAGEN | -- | |
| RT-qPCR | RNeasy试剂盒 | QIAGEN | 74014 |
| 无RNase DNase套装 | QIAGEN | 79254 | |
| NanoDrop 100分光光度计 | -- | -- | |
| M-MLV逆转录酶试剂盒 | Promega | M1701 | |
| PowerUp SYBR Green预混液 | ThermoFisher Scientific | A25742 | |
| QuantStudio 7实时荧光定量PCR系统 | -- | -- | |
| ELISA | 表皮调节素ELISA试剂盒 | ELabscience | -- |
| Epigen ELISA试剂盒 | LSBio | -- | |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Invitrogen | KHC0061 | |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Abcam | Ab178013 | |
| 转录因子结合检测 | TransAM转录因子ELISA系统 | Active Motif | -- |
| 动物实验 | Gentle MACS组织处理器 | Miltenyi Biotec | -- |
| RNeasy Plus Mini试剂盒 | QIAGEN | 74134 | |
| 免疫组织化学 | 抗S100A9抗体 | Abcam | ab105472 |
| Roche Ventana Discovery Ultra自动染色仪 | Roche | -- | |
| Zeiss Axio Scan.Z1玻片扫描仪 | Zeiss | -- | |
| 流式细胞术 | 抗小鼠CD45.2抗体 | Biolegend | -- |
| 抗小鼠CD11b抗体 | Biolegend | -- | |
| 抗小鼠Ly6G抗体 | Biolegend | -- | |
| 抗小鼠Ly6C抗体 | Biolegend | -- | |
| BD FACS Canto II流式细胞仪 | BD | -- | |
| 数据分析 | GraphPad Prism | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与刺激 | TR146细胞培养条件(DMEM/F12含10% FBS)、血清饥饿过夜、candidalysin浓度70 μM、抑制剂预处理1小时 阅读提示:Materials and Methods: Cell culture and treatment with candidalysin |
| 信号通路检测 | 检测时间点(30 min和2 h)、抗体(p-p38, p-EGFR, p-Hsp27)、抑制剂浓度(BIRB796 10 μM, Gefitinib 2 μM等) 阅读提示:Figure 1 legend |
| 细胞因子释放 | 处理时间(24 h)、检测方法(Luminex, ELISA)、抑制剂(BIRB796, SP600125, Trametinib, Gefitinib) 阅读提示:Figure 2 legend |
| siRNA敲低 | siRNA浓度20 nM、转染时间72 h、目标基因(MKK3, MKK6, Src等) 阅读提示:Materials and Methods: RNA Interference |
| 小鼠OPC模型 | 小鼠品系(BALB/c, C57BL/6)、感染剂量(10^7 cfu/ml)、BIRB796给药方案(50 mg/kg, i.p.)、FosK13小鼠 阅读提示:Materials and Methods: Murine oropharyngeal candidiasis model |
| 体内检测 | 真菌载量(tongue homogenates)、qPCR引物、免疫组化(S100A9, c-Fos) 阅读提示:Materials and Methods: Quantitative PCR for mouse samples, Immunohistochemistry |