体外抗肿瘤活性评估
验证B28对PAAD细胞生长的抑制作用。
使用RTCA实时监测细胞生长,集落形成实验评估克隆形成能力,流式细胞术分析细胞周期和凋亡。
A synthesized olean-28,13β-lactam targets YTHDF1-GLS1 axis to induce ROS-dependent metabolic crisis and cell death in pancreatic adenocarcinoma.
包含体外细胞实验(RTCA、集落形成、流式凋亡、蛋白印迹)、转录组测序、海马能量分析、机制验证(敲低/过表达、ROS清除剂)及体内异种移植瘤模型。
PANC-1细胞 Miapaca-2细胞 CFPAC-1细胞 PANC-1异种移植裸鼠模型
B28处理浓度(0.125-1 μM)和处理时间(6-24小时) ROS清除剂NAC的使用条件(5 mM预处理) GLS1和YTHDF1敲低及过表达验证 体内实验B28给药剂量(6 mg/kg,腹腔注射) 海马分析OCR和ECAR检测的细胞密度和试剂浓度
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证B28对PAAD细胞生长的抑制作用。
使用RTCA实时监测细胞生长,集落形成实验评估克隆形成能力,流式细胞术分析细胞周期和凋亡。
探究B28处理后PAAD细胞中基因表达和通路的变化。
PANC-1细胞经B28处理24小时,提取RNA进行RNA-seq,并利用GO和KEGG富集分析差异表达基因。
评估B28对线粒体呼吸和糖酵解的影响。
使用海马分析仪测量OCR和ECAR,并检测线粒体复合物亚基和糖酵解酶的表达。
确定B28是否诱导ROS产生并影响线粒体功能。
使用DCFH-DA探针测量总ROS,JC-1染色检测线粒体膜电位,MitoTracker Red染色观察线粒体形态。
验证B28的抗肿瘤效应是否依赖ROS。
使用ROS清除剂NAC预处理细胞,评估细胞活力、凋亡、线粒体功能及生物能量学指标。
验证GLS1和YTHDF1是否为B28的下游靶点。
通过慢病毒敲低或过表达GLS1或YTHDF1,检测细胞活力、ROS水平、OCR/ECAR及蛋白表达。
验证B28在动物模型中的抗肿瘤效果。
将PANC-1细胞皮下接种至裸鼠,B28腹腔注射给药,监测肿瘤体积和体重。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 | Beyotime | C0039 |
| 细胞周期分析 | 细胞周期分析试剂盒 | Beyotime | C1052 |
| 细胞凋亡检测 | FITC Annexin V凋亡检测试剂盒I | BD Biosciences | 556547 |
| Annexin V-FITC/7-AAD凋亡检测试剂盒 | Elabscience | E-CK-A212 | |
| Caspase 3活性检测 | Caspase 3活性检测试剂盒 | Beyotime | C1115 |
| ROS检测 | 活性氧检测试剂盒 | Beyotime | S0033S |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1线粒体膜电位检测试剂盒 | Beyotime | C2003S |
| 线粒体染色 | MitoTracker™ Red FM | Thermo Fisher Scientific | M22425 |
| 蛋白浓度检测 | BCA蛋白浓度检测试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 23225 |
| 蛋白质印迹 | Pierce ECL蛋白质印迹底物试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | 32132X3 |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | C11995500BT |
| 胎牛血清 | Gibco | 10099141 | |
| 青霉素-链霉素 | Beyotime | C0222 | |
| 细胞染色 | 结晶紫染色液 | Beyotime | C0121 |
| 细胞核染色 | DAPI染色液 | Beyotime | C1005 |
| 抑制剂处理 | MG-132 | Selleck | S2619 |
| 代谢物补充 | N-乙酰-L-半胱氨酸 | Beyotime | ST1546 |
| 2-NBDG | Anjiekai | 186689-07-6 | |
| 乳酸检测 | 乳酸检测试剂盒 | Biovision | K607-100 |
| 海马分析 | XF细胞线粒体压力测试试剂盒 | Agilent Technologies | 103010-100 |
| XF糖酵解压力测试试剂盒 | Agilent Technologies | 103017-100 | |
| RNA提取 | Trizol | Invitrogen | -- |
| 蛋白质印迹 | PVDF膜 | -- | -- |
| 蛋白裂解 | Triton X-100裂解液 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系(PANC-1、Miapaca-2、CFPAC-1)的来源和培养条件(DMEM、10% FBS、1%青霉素-链霉素) 阅读提示:Methods 2.2 Cell line and cell culture |
| B28处理 | B28的浓度(0.125-1 μM)和处理时间(6-24小时) 阅读提示:Methods 2.3 RTCA;Results 3.1;Figure legends |
| 海马分析 | 细胞密度、B28浓度(0.5,1 μM)和处理时间(6小时) 阅读提示:Methods 2.8 OCR and ECAR detection |
| ROS清除实验 | NAC浓度(5 mM)和预处理时间 阅读提示:Methods 2.15 Cell viability measurement;Figure 4 legend |
| 慢病毒感染 | 质粒(shRNA、过表达)、病毒包装和感染条件,筛选浓度 阅读提示:Methods 2.14 Lenti-virus package and RNA interfere |
| 体内实验 | 动物品系(5周龄雄性裸鼠)、细胞接种数(6×10^6)、给药剂量(6 mg/kg)和途径(腹腔注射) 阅读提示:Methods 2.16 Anti-tumor activity determination of B28 in vivo |