构建高糖诱导的HMC DN细胞模型
在体外模拟糖尿病肾病环境,验证HG对HMC增殖、纤维化和氧化应激的影响。
HMC在含有25 mM HG的DMEM培养基中培养48小时,以NG(5 mM)作为对照。随后通过CCK8、EDU染色、Western blot和氧化应激检测评估细胞的增殖、纤维化标志物表达以及ROS、MDA和SOD水平。
LncRNA HOTAIR facilitates high glucose-induced mesangial cell proliferation, fibrosis and oxidative stress in diabetic nephropathy via regulating miR-147a/WNT2B axis.
该研究包括体外细胞模型、功能获得和功能丧失实验以及机制验证(双荧光素酶报告基因和RIP),但没有动物实验或患者样本验证。
高糖诱导的人肾小球系膜细胞(HMC) 293T细胞(用于双荧光素酶报告基因实验)
细胞系:HMC(BeNa Culture Collection)和293T 高糖浓度:25 mM HG处理48小时 转染试剂:Lipofectamine 3000 质粒和siRNA:si-lncRNA HOTAIR、miR-147a mimic/inhibitor、pcDNA-WNT2B等 检测指标:细胞活力(CCK8)、增殖(EDU)、蛋白表达(Western blot)、氧化应激(ROS、MDA、SOD)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在体外模拟糖尿病肾病环境,验证HG对HMC增殖、纤维化和氧化应激的影响。
HMC在含有25 mM HG的DMEM培养基中培养48小时,以NG(5 mM)作为对照。随后通过CCK8、EDU染色、Western blot和氧化应激检测评估细胞的增殖、纤维化标志物表达以及ROS、MDA和SOD水平。
探究lncRNA HOTAIR在HG诱导HMC增殖、纤维化和氧化应激中的作用。
使用si-lncRNA HOTAIR转染HMC,然后进行HG处理。通过CCK8、EDU染色、Western blot和氧化应激检测评估细胞增殖、纤维化标志物(fibronectin、collagen I、α-SMA)和氧化应激水平。
确认lncRNA HOTAIR是否作为miR-147a的海绵分子。
使用Lncbase2.0软件预测结合位点,通过双荧光素酶报告基因实验验证miR-147a mimic对lncRNA HOTAIR wt/mut载体荧光素酶活性的影响,并通过RIP实验检测Ago2沉淀中lncRNA HOTAIR和miR-147a的富集。同时检测si-lncRNA HOTAIR对miR-147a表达的影响以及HG处理下miR-147a的表达变化。
验证lncRNA HOTAIR对HG诱导HMC功能的影响是否依赖于miR-147a。
将si-lncRNA HOTAIR与miR-147a inhibitor共转染HMC,然后进行HG处理。检测miR-147a表达、细胞活力(CCK8)、增殖(EDU)、蛋白表达(PCNA、CyclinD1、fibronectin、collagen I、α-SMA)和氧化应激(ROS、MDA、SOD)。
确认miR-147a是否直接靶向WNT2B。
使用Starbase3.0软件预测结合位点,通过双荧光素酶报告基因实验验证miR-147a mimic对WNT2B 3'UTR wt/mut载体荧光素酶活性的影响,并通过qRT-PCR和Western blot检测HG处理下HMC中WNT2B的mRNA和蛋白表达水平。
验证miR-147a对HG诱导HMC功能的影响是否通过靶向WNT2B介导。
将miR-147a mimic与pcDNA-WNT2B共转染HMC,然后进行HG处理。通过qRT-PCR和Western blot验证WNT2B表达,并检测细胞活力(CCK8)、增殖(EDU)、蛋白表达(PCNA、CyclinD1、fibronectin、collagen I、α-SMA)和氧化应激(ROS、MDA、SOD)。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Invitrogen | -- | |
| D-葡萄糖 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 转染 | Lipofectamine 3000 | Invitrogen | -- |
| 细胞增殖检测 | CCK8试剂 | Dojindo | -- |
| EDU细胞增殖检测试剂盒 | Beyotime | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Elabscience | -- |
| BCA蛋白浓度检测试剂盒 | Elabscience | -- | |
| PVDF膜 | Roche | -- | |
| Western化学发光HRP底物 | Millipore | -- | |
| 抗PCNA抗体 | Abcam | ab18197 | |
| 抗CyclinD1抗体 | Abcam | ab226977 | |
| 抗纤连蛋白抗体 | Abcam | ab2413 | |
| 抗I型胶原抗体 | Abcam | ab34710 | |
| 抗α-SMA抗体 | Abcam | ab5694 | |
| 抗WNT2B抗体 | Abcam | ab203225 | |
| 抗β-actin抗体 | Abcam | ab5694 | |
| 山羊抗兔IgG | Abcam | ab205718 | |
| 氧化应激检测 | 细胞活性氧检测试剂盒 | Abcam | -- |
| 丙二醛检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- | |
| 超氧化物歧化酶检测试剂盒 | Sigma-Aldrich | -- | |
| qRT-PCR | Trizol试剂 | Invitrogen | -- |
| TaqMan逆转录试剂 | Invitrogen | -- | |
| miScript II逆转录试剂盒 | Qiagen | -- | |
| SYBR Green | Takara | -- | |
| 双荧光素酶报告基因实验 | 双荧光素酶分析试剂盒 | Beyotime | -- |
| RIP实验 | Magna RIP试剂盒 | Millipore | -- |
| 统计分析 | GraphPad Prism 7.0 | GraphPad | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与DN模型构建 | HMC细胞系来源(BeNa Culture Collection);高糖浓度(25 mM)和处理时间(48小时);正常糖浓度(5 mM)作为对照 阅读提示:参见Materials and methods中Cell culture, treatment and transfection部分 |
| 转染实验 | 转染试剂(Lipofectamine 3000);siRNA、mimic、inhibitor和过表达质粒序列及浓度;细胞密度(60%) 阅读提示:参见Materials and methods中Cell culture, treatment and transfection部分 |
| 细胞增殖检测 | 细胞接种密度(CCK8: 2×10^4 cells/well;EDU: 24孔板);CCK8孵育时间(4小时);EDU染色和DAPI染色步骤 阅读提示:参见Materials and methods中CCK8 assay和EDU staining部分 |
| Western blot分析 | 蛋白上样量(20 μg);抗体稀释比例及货号;内参(β-actin);封闭液(5%脱脂牛奶) 阅读提示:参见Materials and methods中Western blot部分 |
| 氧化应激检测 | ROS检测试剂盒(Abcam);MDA和SOD检测试剂盒(Sigma-Aldrich);检测波长或具体步骤 阅读提示:参见Materials and methods中Detection of oxidative stress部分 |
| qRT-PCR | 引物序列;内参(β-actin或U6);逆转录试剂盒;SYBR Green;2^-ΔΔCt方法 阅读提示:参见Materials and methods中Quantitative real-time PCR部分 |
| 双荧光素酶报告基因实验 | 报告载体(psiCHECK-2,lncRNA HOTAIR wt/mut和WNT2B 3'UTR wt/mut);共转染293T细胞;miR-147a mimic或mimic NC;孵育时间(48小时) 阅读提示:参见Materials and methods中Dual-luciferase reporter assay部分 |
| RIP实验 | 抗Ago2和抗IgG抗体;磁珠孵育时间(4小时);qRT-PCR检测富集 阅读提示:参见Materials and methods中RIP assay部分 |