铁死亡相关LncRNA特征的鉴定与验证作为结肠癌的新型预后模型

背景 铁死亡是一种新定义的程序性细胞死亡形式，在许多癌症中发挥重要作用。然而，参与结肠癌调控的铁死亡相关lncRNA（FRLs）尚未被全面了解。本研究旨在鉴定结肠癌中具有预后价值的FRL特征，并探讨其潜在的分子功能。 方法 从癌症基因组图谱（TCGA）数据库获取RNA-seq数据及相关临床信息，并从FerrDb网站提取铁死亡相关基因列表。使用R软件中的'limma'包进行差异表达FRLs分析。通过共表达分析和单变量Cox分析，我们鉴定了具有预后价值的FRLs。使用带最小绝对收缩和选择算子（LASSO）算法的Cox回归分析，我们构建了基于4个FRLs的预后模型。我们使用Kaplan-Meier（K-M）生存曲线分析和受试者工作特征（ROC）曲线分析评估了该模型的预后能力。此外，还探讨了该特征与免疫景观、体细胞突变和药物敏感性之间的关系。最后，进行了体外实验以验证AP003555.1和AC000584.1的功能。 结果 构建了一个4-FRL特征。根据该特征计算的风险评分将患者分为两个风险组。基于特征的風險評分在结肠癌患者中的生存预测能力优于传统临床病理特征。此外，我们观察到两组之间的免疫细胞（如CD4+和CD8+ T细胞以及巨噬细胞）存在显著差异。此外，高风险组对某些化疗药物（如顺铂、多西他赛、博来霉素或阿昔替尼）表现出较低的IC50值。最后，体外实验表明，敲低AP003555.1和AC000584.1后铁死亡过程被抑制。 结论 所提出的4-FRL特征是预测结肠癌患者临床结果和治疗反应的有前景的生物标志物。