化疗药物处理及细胞活力检测
评估ADM对Jurkat和HL-60细胞的毒性作用及其剂量依赖性
用不同浓度ADM处理细胞24小时,CCK8检测细胞活力;随后用rHMGB1预处理后加ADM,评估细胞活力变化。
Extracellular HMGB1 interacts with RAGE and promotes chemoresistance in acute leukemia cells.
包含体外细胞实验(自噬、凋亡、耐药蛋白检测)、RAGE敲低/回补验证、信号通路抑制剂干预及T-ALL小鼠异种移植模型体内验证,功能与机制验证完整。
Jurkat人急性淋巴细胞白血病细胞系 HL-60人急性髓系白血病细胞系 T-ALL NOD/SCID小鼠异种移植模型
ADM处理浓度(0-0.8 µM)和处理时间(24 h)对细胞活力、自噬和凋亡的影响 rHMGB1预处理浓度(0-100 ng/mL)和时间(24 h)对自噬和凋亡的保护作用 RAGE敲低(shRNA)或抑制剂FPS-ZM1对自噬、凋亡及细胞活力的影响 信号通路抑制剂(PD98059、Rapamycin、Pifithrin-β、PDTC)的浓度和处理时间 T-ALL小鼠模型中ADM剂量(1 mg/kg)和给药频率(隔天腹腔注射)及终点判定
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估ADM对Jurkat和HL-60细胞的毒性作用及其剂量依赖性
用不同浓度ADM处理细胞24小时,CCK8检测细胞活力;随后用rHMGB1预处理后加ADM,评估细胞活力变化。
确定ADM和细胞外HMGB1对自噬及凋亡的影响
通过Western blot检测LC3II/I、P62、PARP、Bcl-2、Bax、cleaved caspase-3等蛋白表达;使用mRFP-GFP-LC3腺病毒和透射电镜观察自噬流。
验证RAGE在HMGB1诱导的自噬和凋亡中的必要性
使用慢病毒shRNA敲低RAGE,或用FPS-ZM1抑制剂处理;检测自噬和凋亡相关蛋白变化;并在RAGE敲低细胞中回补RAGE,观察能否恢复表型。
阐明HMGB1/RAGE调控自噬和凋亡的下游信号通路
检测ERK、mTOR、P53的磷酸化水平;使用PD98059(ERK抑制剂)、Rapamycin(mTOR抑制剂)、Pifithrin-β(P53抑制剂)处理细胞,观察自噬和凋亡变化;使用PDTC(NF-κB抑制剂)处理,检测药物外排蛋白表达。
验证阻断HMGB1/RAGE轴在体内是否能增强化疗敏感性
将稳定转染shRNA-NC、shRNA-RAGE或shRNA-突变乙酰化位点HMGB1的Jurkat细胞注射入NOD/SCID小鼠,低剂量ADM处理,观察生存期、脾脏病理、骨髓中白血病细胞比例及自噬水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| 胎牛血清 | Gibco; Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- | |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Dojindo Molecular Technologies, Inc. | -- |
| RNA提取 | RNA快速纯化试剂盒 | Yishan Biotech Inc. | -- |
| RT-qPCR | SYBR Premix ExTaq试剂盒 | Takara Bio Inc. | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime Institute of Biotechnology | -- | |
| PVDF膜 | EMD Millipore | -- | |
| 增强化学发光试剂 | EMD Millipore | -- | |
| G:BOX XT4成像系统 | Syngene | -- | |
| ELISA | HMGB1 ELISA试剂盒 | Elabscience Biotechnology Co, Ltd. | -- |
| 流式细胞术 | Annexin V APC-A | ThermoFisher Scientific | -- |
| APC-Cy7-A | ThermoFisher Scientific | -- | |
| FACSCalibur流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 透射电子显微镜 | HITACHI (HT7700) 电子显微镜 | HITACHI | -- |
| Western blot | GAPDH抗体 | Cell Signaling Technology | 5172S |
| β-actin抗体 | Cell Signaling Technology | 3700S | |
| HMGB1抗体 | Cell Signaling Technology | 6893S | |
| LC3抗体 | Cell Signaling Technology | 3868S | |
| Bax抗体 | Cell Signaling Technology | 5023S | |
| Bcl-2抗体 | Cell Signaling Technology | 15071S | |
| NF-κB p65抗体 | Cell Signaling Technology | 8242S | |
| 磷酸化p65抗体 | Cell Signaling Technology | 3033S | |
| ERK抗体 | Cell Signaling Technology | 9102S | |
| 磷酸化ERK抗体 | Cell Signaling Technology | H9539 | |
| P62抗体 | Abcam | ab56416 | |
| RAGE抗体 | Abcam | ab3611 | |
| P-gp抗体 | Abcam | ab170904 | |
| Cleaved caspase-3抗体 | Abcam | ab32042 | |
| 磷酸化mTOR抗体 | Abcam | ab137133 | |
| mTOR抗体 | Abcam | ab134903 | |
| 磷酸化P53抗体 | Abcam | ab33889 | |
| P53抗体 | Abcam | ab32389 | |
| PUMA抗体 | Abcam | ab33906 | |
| MRP抗体 | Absin Bioscience, Inc. | abs116285 | |
| PARP抗体 | ABclonal Technology, Inc. | A0942 | |
| 山羊抗小鼠IgG-HRP | Beijing Ray Antibody Biotech | RM3001 | |
| 山羊抗兔IgG-HRP | Beijing Ray Antibody Biotech | RM3002 | |
| 药物处理 | 重组人HMGB1/高迁移率族蛋白B1 | Absin Bioscience, Inc. | abs04694 |
| 阿霉素 | MedChemExpress | -- | |
| FPS-ZM1 | MedChemExpress | -- | |
| 细胞筛选 | 嘌呤霉素 | Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基和血清类型、培养条件(温度、CO2浓度) 阅读提示:Materials and methods - Subjects and cell culture |
| 药物处理 | ADM浓度梯度、处理时间、rHMGB1预处理浓度和时间、抑制剂浓度和处理时间 阅读提示:Materials and methods - Drug treatment |
| RAGE敲低与回补 | 慢病毒载体、shRNA序列、感染复数、筛选浓度(嘌呤霉素)、回补效率验证 阅读提示:Materials and methods - Lentivirus infection |
| 自噬检测 | mRFP-GFP-LC3腺病毒感染条件、药物处理方案、固定和成像参数 阅读提示:Materials and methods - Detection of autophagic flux 和 - Transmission electron microscopy |
| 凋亡检测 | 处理浓度和时间、Annexin V和7-AAD染色步骤、流式细胞仪设置 阅读提示:Materials and methods - Flow cytometry |
| 体内实验 | 细胞注射数量、途径、ADM剂量和频率、终点指标、样本处理(脾脏和骨髓) 阅读提示:Materials and methods - Animal study 和 Figure 7 legend |
| 细胞活力检测 | 细胞接种密度、药物处理时间、CCK-8孵育时间、检测波长 阅读提示:Materials and methods - Cell viability assay |
| qPCR | 引物序列、RNA提取和逆转录方法、PCR循环条件、内参基因 阅读提示:Materials and methods - Quantitative real-time PCR |
| Western blot | 蛋白提取和定量方法、上样量、凝胶浓度、抗体稀释比例、检测系统 阅读提示:Materials and methods - Western blot analysis |
| ELISA | 样本稀释倍数、孵育时间、标准曲线 阅读提示:Materials and methods - HMGB1 Elisa kit |