建立脂质沉积模型
验证油酸钠能否诱导NRK-52e细胞脂质沉积
用200 μmol/L油酸钠处理NRK-52e细胞24小时,油红O染色和检测CD36蛋白表达。
Phenolic Compounds from Mori Cortex Ameliorate Sodium Oleate-Induced Epithelial-Mesenchymal Transition and Fibrosis in NRK-52e Cells through CD36.
包含体外细胞模型(NRK-52e),功能验证(CD36沉默)和机制验证(分子对接),涉及脂质沉积、炎症、氧化应激、EMT和纤维化多个层面。
NRK-52e大鼠肾近端小管上皮细胞
油酸钠浓度:200 μmol/L 药物浓度:10 μmol/L CD36沉默(siCD36) 处理时间:24小时 细胞密度:约70%
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证油酸钠能否诱导NRK-52e细胞脂质沉积
用200 μmol/L油酸钠处理NRK-52e细胞24小时,油红O染色和检测CD36蛋白表达。
评估四种酚类化合物(Y-1至Y-4)对油酸钠诱导损伤的改善作用
在油酸钠刺激的同时给予10 μmol/L的Y-1、Y-2、Y-3或Y-4,检测脂质沉积、EMT和纤维化相关指标。
验证CD36是否为Y-1和Y-2发挥作用所必需
使用siRNA沉默CD36,比较沉默前后药物对炎症、氧化应激、脂质沉积、EMT和纤维化的改善作用。
预测Y-1、Y-2与CD36的结合位点和结合能力
使用AutoDock Tools进行分子对接,分析化合物与CD36(PDB ID: 5LGD)的相互作用。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 1898960 |
| 胎牛血清 | Zhejiang Tianhang Biotechnology | -- | |
| 药物处理 | 油酸钠 | Shanghai Maclean Biochemical | C10078860 |
| 油红O染色 | 油红O粉末 | Beijing Boao Tuoda Technology | O0625 |
| Western blot | SDS-PAGE凝胶配制试剂盒 | Bio-Rad | 64136301 |
| 抗CD31抗体 | Abcam | ab222783 | |
| 抗CD36抗体 | Abclonal | A1470 | |
| 抗α-SMA抗体 | Abclonal | A17910 | |
| 抗Snail1抗体 | Abclonal | A5243 | |
| GAPDH抗体 | Abclonal | A19056 | |
| 抗TGF-β抗体 | Proteintech | 21898-1-AP | |
| 抗ZEB1抗体 | Proteintech | 21544-1-AP | |
| 抗NF-κB-P65抗体 | Affinify | AF5006 | |
| 抗磷酸化NF-κB-P65抗体 | Affinify | AF2006 | |
| 抗IL-1β抗体 | Affinify | AF5103 | |
| 抗NOX1抗体 | Affinify | DF8684 | |
| 抗Nrf2抗体 | Affinify | AF0639 | |
| 抗Keap1抗体 | Affinify | AF5266 | |
| 细胞培养 | Lipo-2000转染试剂 | Invitrogen | 1952313 |
| 转染 | OPTI-MEM培养基 | CellWorld | 19571512 |
| 蛋白提取 | 细胞质膜提取试剂盒 | Beyotime | P0028 |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 |
| RNA提取 | 总RNA提取试剂盒 | Solarbio | R1200 |
| 逆转录 | BeyoRT III第一链cDNA合成试剂盒 | Beyotime | D7178M |
| qRT-PCR | ChamQ通用SYBR qPCR预混液 | Vazyme | L/N8E271E8 |
| ELISA | 大鼠肿瘤坏死因子α酶联免疫试剂盒 | Elabscience | E-ELER2856c |
| 氧化应激检测 | 丙二醛测试盒 | Nanjing Jiancheng Company | A003-1 |
| 超氧化物歧化酶测定试剂盒 | Nanjing Jiancheng Company | A001-3 | |
| ROS检测 | 活性氧检测试剂盒(DCFH-DA) | Solarbio | CA1410 |
| 高内涵成像 | DAPI溶液 | Solarbio | C0065 |
| Cy3标记山羊抗兔IgG(H+L) | Abclonal | AS007 | |
| 封闭用正常兔血清 | Beyotime | SL034 | |
| 细胞培养 | CO2培养箱 | Thermo | -- |
| 检测 | 酶标仪 | Bio-Tek | -- |
| qRT-PCR | 实时荧光定量PCR仪 | Applied Biosystems | -- |
| Western blot | Odyssey双色红外荧光成像系统 | Odyssey | -- |
| Mini-PROTEAN Tetra电泳槽 | Bio-Rad | -- | |
| TransBlot Turbo全能型蛋白转印仪 | Bio-Rad | -- | |
| 高内涵成像 | 高内涵成像分析系统 | PerkinElmer | -- |
| 称量 | AB204N精密分析天平 | Metler Toledo | -- |
| 流式细胞术 | FlowSight多维全景流式细胞仪 | Merck | -- |
| 样品保存 | -80°C超低温冰箱 | Haier | -- |
| -20°C低温冰箱 | Haier | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系:NRK-52e(购自中国科学院上海细胞库);培养基:高糖DMEM含10%胎牛血清;培养条件:5% CO2,37°C,饱和湿度 阅读提示:Materials and Methods 4.2.1 |
| 模型建立与给药 | 油酸钠浓度:200 μmol/L;药物浓度:10 μmol/L;处理时间:24小时;细胞密度约70%时开始干预 阅读提示:Materials and Methods 4.2.3 |
| CD36沉默 | 细胞密度约40%时转染;使用Lipo-2000;转染后6小时换液;siCD36序列(见表1) 阅读提示:Materials and Methods 4.2.4 |
| Western blot | 上样量:35 μg蛋白;SDS-PAGE凝胶浓度:10%;封闭:5% BSA;一抗孵育:4°C过夜;检测蛋白:CD36, NF-κB-P65, IL-1β, NOX1, Nrf2, Keap1, CD31, α-SMA, TGF-β, ZEB1, Snail1, GAPDH 阅读提示:Materials and Methods 4.2.5 |
| ROS检测 | DCFH-DA浓度:10 μmol/L;孵育时间:20分钟;孵育温度:37°C 阅读提示:Materials and Methods 4.2.8 |