谱系追踪与表型鉴定
验证Sox9表达细胞在正常及辐射损伤后的分布和动态变化。
构建Sox9CreER; RosatdTomato小鼠,注射他莫昔芬诱导标记,照射后不同时间点收集肺组织进行免疫荧光和免疫组化分析。
Sox9-expressing cells promote regeneration after radiation-induced lung injury via the PI3K/AKT pathway.
包含谱系追踪、细胞消融动物模型、单细胞转录组分析、AKT抑制剂/激动剂体内干预等多层级验证。
Sox9CreER; RosatdTomato小鼠 Sox9CreER; RosatdTomato; RosaDTA小鼠 C57BL/6小鼠全胸照射模型 GSE102580数据集(小鼠气管上皮细胞)
他莫昔芬诱导剂量:0.08 mg/g体重,连续三天腹腔注射 辐射剂量:单次16 Gy全胸照射 AKT抑制剂perifosine剂量:250 mg/kg/周,灌胃 AKT激动剂SC79剂量:5 mg/kg/周,灌胃 观察时间点:照射后3、7、14、30天
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Sox9表达细胞在正常及辐射损伤后的分布和动态变化。
构建Sox9CreER; RosatdTomato小鼠,注射他莫昔芬诱导标记,照射后不同时间点收集肺组织进行免疫荧光和免疫组化分析。
通过特异性消融Sox9+细胞,检测其在辐射后肺再生中的必要性。
生成Sox9CreER; RosatdTomato; RosaDTA小鼠,利用他莫昔芬诱导DTA表达清除Sox9+细胞,比较消融组与对照组在辐射后的组织学变化及增殖、凋亡、炎症和纤维化指标。
探究Sox9+细胞在肺再生中可能激活的信号通路。
分析在线数据集GSE102580,比较Sox9+与Sox9-循环基底角质形成细胞中的差异表达基因,并进行KEGG通路富集。
验证PI3K/AKT通路在Sox9+细胞介导的再生中的功能作用。
对辐射后的Sox9CreER; RosatdTomato小鼠给予AKT抑制剂perifosine或激动剂SC79,分析肺组织病理、增殖、凋亡及谱系追踪变化。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物模型建立 | 他莫昔芬 | Sigma | T5648-1G |
| 药物处理 | 哌立福辛 | Beyotime | SC0227 |
| SC79 | Beyotime | SF2730 | |
| 组织化学染色 | Masson三色染色试剂盒 | Solarbio | G1343 |
| 免疫组化 | SOX9抗体 | Millipore | AB5535 |
| Ki67抗体 | Novus | NB500170 | |
| CD45抗体 | Santa Cruz | sc-53665 | |
| α-SMA抗体 | CST | 19245S | |
| PDPN抗体 | abcam | ab256559 | |
| CC10抗体 | Santa Cruz | sc-365992 | |
| Caspase-3抗体 | CST | 9661S | |
| SOX2抗体 | abcam | ab97959 | |
| Oct3/4抗体 | BD | BD611203 | |
| Klf4抗体 | CST | 12173S | |
| cMyc抗体 | CST | 5605S | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Sigma | -- |
| DyLight 488 | Invitrogen | -- | |
| Fluor 594 | Invitrogen | -- | |
| DAPI | -- | -- | |
| 生化检测 | eNOs ELISA试剂盒 | Elabscience Biotechnology | -- |
| NO检测试剂盒 | Jiancheng | -- | |
| 辐射设备 | X射线辐照仪Rs2000 | -- | -- |
| 统计软件 | GraphPad Prism 8.0 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 他莫昔芬诱导谱系追踪 | 他莫昔芬给药剂量0.08 mg/g体重,连续3天腹腔注射;诱导时间点:照射前。 阅读提示:见Materials and methods, Mouse models |
| 辐射模型建立 | C57BL/6小鼠6-8周龄,全胸单次16 Gy照射(另一处提及15 Gy);麻醉方式:氯胺酮/甲苯噻嗪混合液0.1 mL/20 g体重。 阅读提示:见Materials and methods, Mouse radiation experiments |
| 细胞消融实验 | Sox9CreER; RosatdTomato; RosaDTA小鼠与对照组,每组4只;他莫昔芬诱导DTA表达;观察时间点:3, 7, 14, 30天。 阅读提示:见Materials and methods, Mouse models;Results, Fig. 2 legend |
| AKT通路药物干预 | AKT抑制剂perifosine剂量250 mg/kg/周,灌胃;AKT激动剂SC79剂量5 mg/kg/周,灌胃;照射后给药,处理3, 7, 14天;每组3或5只。 阅读提示:见Materials and methods, Mouse models;Results, Fig. 4, 5 legends |
| 单细胞数据分析 | 数据集GSE102580,小鼠气管上皮细胞,共7662个细胞;使用Seurat R包进行差异表达分析和KEGG通路富集。 阅读提示:见Materials and methods, Single-cell analysis |