CST1在PTC组织和细胞系中的表达分析
验证CST1在PTC中的表达水平及其与预后的关系。
使用实时qPCR和western blot检测40对PTC组织和配对正常组织以及PTC细胞系(TPC-1、KTC-1、SW1736)和正常甲状腺上皮细胞系(Nthy-ori3-1)中CST1的表达;通过Kaplan-Meier生存分析评估预后。
Retracted: Silencing of cystatin SN abrogates cancer progression and stem cell properties in papillary thyroid carcinoma.
包含临床样本表达分析、体外功能获得/缺失实验、体内异种移植模型,以及功能与机制验证。
PTC细胞系TPC-1和KTC-1 正常甲状腺上皮细胞系Nthy-ori3-1 异种移植裸鼠模型
CST1在PTC组织和细胞中的表达水平(qPCR和Western blot验证) CST1过表达和敲低载体转染效率 CCK-8和集落形成实验检测细胞增殖 Annexin V-FITC/PI双染检测细胞凋亡 体内肿瘤生长监测(体积和重量)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证CST1在PTC中的表达水平及其与预后的关系。
使用实时qPCR和western blot检测40对PTC组织和配对正常组织以及PTC细胞系(TPC-1、KTC-1、SW1736)和正常甲状腺上皮细胞系(Nthy-ori3-1)中CST1的表达;通过Kaplan-Meier生存分析评估预后。
评估CST1对PTC细胞体外生长和体内肿瘤形成的影响。
构建CST1过表达和敲低载体转染TPC-1和KTC-1细胞,通过CCK-8和集落形成实验检测细胞增殖;通过异种移植裸鼠模型检测肿瘤生长。
检测CST1敲低是否诱导PTC细胞凋亡。
使用锥虫蓝染色评估细胞活力,Annexin V-FITC/PI双染检测细胞凋亡率,western blot检测凋亡相关蛋白cleaved caspase-3和Bax的表达。
评估CST1对PTC细胞运动性和EMT的影响。
使用Transwell侵袭实验和划痕愈合实验检测细胞侵袭和迁移能力;western blot检测EMT相关蛋白N-cadherin、Vimentin和MMP-9的表达。
验证CST1是否调节PTC细胞的干性。
通过实时qPCR和western blot检测干细胞标志物OCT4、SOX2、Nanog和ALDH1的表达,球体形成实验评估自我更新能力,并分析临床样本中CST1与这些标志物的相关性。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 达尔伯克改良伊格尔培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素和链霉素 | Gibco | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine RNAiMAX转染试剂 | Invitrogen | -- |
| RNA提取和qPCR | TRIzol试剂 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| 逆转录qPCR试剂盒 | Applied Biosystems | -- | |
| qPCR | Power SYBR Green qPCR SuperMix-UDG试剂盒 | Invitrogen | -- |
| Western blot | RIPA裂解缓冲液 | Beyotime | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Gibco | -- | |
| 聚偏二氟乙烯膜 | Millipore | -- | |
| 抗CST1抗体 | Abcam | -- | |
| 抗β-actin抗体 | Abcam | -- | |
| 抗cleaved caspase-3抗体 | Abcam | -- | |
| 抗Bax抗体 | Abcam | -- | |
| 抗N-cadherin抗体 | Abcam | -- | |
| 抗vimentin抗体 | Abcam | -- | |
| 抗OCT4抗体 | Abcam | -- | |
| 抗SOX2抗体 | Abcam | -- | |
| 抗Nanog抗体 | Abcam | -- | |
| 抗ALDH1抗体 | Abcam | -- | |
| 山羊抗兔IgG二抗 | Abcam | Ab6721 | |
| 增强化学发光试剂 | -- | -- | |
| Image Quant LAS 4000C成像系统 | Thermo CE | -- | |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂盒 | AbMole | -- |
| 细胞凋亡检测 | 凋亡检测试剂盒 | Elabscience Biotechnology | -- |
| Annexin V-FITC | -- | -- | |
| 碘化丙啶 | -- | -- | |
| 流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| 细胞侵袭检测 | Matrigel基质胶 | Corning Incorporated | -- |
| 细胞迁移检测 | 显微镜 | Olympus | -- |
| 细胞成球实验 | MammoCult培养基 | Stem Cell Technologies | -- |
| 增殖添加剂 | Stem Cell Technologies | -- | |
| 免疫组化 | 抗Ki67抗体 | Abcam | -- |
| 统计分析 | SPSS 18.0软件 | IBM | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养条件:TPC-1、KTC-1、SW1736和Nthy-ori3-1,培养基DMEM+10%FBS,37°C,5%CO2 阅读提示:Materials and methods, Cell culture and vectors transfection |
| 基因操作 | CST1过表达载体(LV5-GFP)和siRNA序列(siCST1-#1和#2),转染试剂Lipofectamine RNAiMAX 阅读提示:Materials and methods, Cell culture and vectors transfection; Table 1 |
| qPCR检测 | RNA提取试剂TRIzol,逆转录试剂盒,引物序列(Table 2),内参β-actin,25μL反应体系 阅读提示:Materials and methods, Real-time qPCR; Table 2 |
| Western blot | 抗体稀释比例(CST1 1:1500, β-actin 1:2000等),二抗(Ab6721 1:2000),蛋白上样量和SDS-PAGE条件 阅读提示:Materials and methods, Western blot analysis |
| 细胞增殖实验 | CCK-8试剂盒,96孔板,450nm吸收值;集落形成实验:6孔板1000细胞/孔,培养2周,结晶紫染色 阅读提示:Materials and methods, Cell Counting Kit-8 assay and Colony formation assay |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI双染,流式细胞仪型号,细胞密度2×10^6/mL 阅读提示:Materials and methods, Annexin V-FITC/PI double-staining assay |
| 侵袭和迁移实验 | Matrigel浓度20μg/well,Transwell小室,24小时;划痕实验:200μL枪头划痕,观察24小时 阅读提示:Materials and methods, Transwell invasion assay and Wound healing assay |
| 成球实验 | MammoCult培养基,添加增殖添加剂,培养10天 阅读提示:Materials and methods, Spheroid formation assay |
| 动物实验 | C57/BL小鼠,每组5只,皮下注射2×10^6细胞,肿瘤体积公式,30天处死 阅读提示:Materials and methods, Xenograft mouse models |