临床样本检测circACSL1表达
评估circACSL1在MC患者中的表达水平及其与疾病进展的关系。
收集MC、对照和DCM患者外周血,提取白细胞RNA,通过qRT-PCR检测circACSL1表达,并分析其与临床指标的相关性。
Circular RNA circACSL1 aggravated myocardial inflammation and myocardial injury by sponging miR-8055 and regulating MAPK14 expression.
研究包含临床样本检测、细胞功能实验(过表达/敲低)、机制验证(荧光素酶报告、RNA pull-down、FISH)及救援实验,但缺少动物体内模型验证。
人心肌细胞系AC16 心肌炎患者外周血样本 扩张型心肌病(DCM)患者外周血样本
LPS诱导浓度:10 μg/ml 慢病毒感染复数:MOI=20 嘌呤霉素筛选浓度:5 μg/mL 临床样本量:MC组22例,对照组20例,DCM组25例 统计分析:至少三次独立重复实验,p<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估circACSL1在MC患者中的表达水平及其与疾病进展的关系。
收集MC、对照和DCM患者外周血,提取白细胞RNA,通过qRT-PCR检测circACSL1表达,并分析其与临床指标的相关性。
建立体外心肌炎症模型,用于研究circACSL1的功能。
HCM细胞(AC16)经LPS处理诱导炎症,检测炎症因子、心肌损伤标志物、细胞活力和凋亡。
验证circACSL1对心肌炎症、心肌损伤和凋亡的影响。
通过慢病毒过表达或shRNA敲低circACSL1,检测细胞活力(CCK-8)、炎症因子和心肌损伤标志物(qRT-PCR、ELISA)及凋亡(流式)。
验证circACSL1是否通过海绵吸附miR-8055调控MAPK14。
通过RNA pull-down、FISH、双荧光素酶报告基因等实验验证circACSL1与miR-8055的结合,以及miR-8055与MAPK14 3'UTR的结合。
验证circACSL1通过miR-8055/MAPK14轴发挥功能。
共转染circACSL1和miR-8055或MAPK14,观察能否逆转circACSL1敲低或过表达的效果。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 杜氏改良Eagle培养基 | Invitrogen | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素-链霉素 | HyClone | -- | |
| 药物处理 | 脂多糖 | Sigma | -- |
| 慢病毒转染 | 嘌呤霉素 | -- | -- |
| RNA提取 | SparkZol试剂 | SparkJade | -- |
| TRIzol试剂 | -- | -- | |
| 反转录 | Evo M-MLV反转录预混液 | ACCURATE BIOTECHNOLOGY | AG11706 |
| Mir-XTM miRNA第一链合成试剂盒 | Takara | -- | |
| qPCR | SYBR Green预混液Pro Taq HS qPCR试剂盒 | ACCURATE BIOTECHNOLOGY | AG11701 |
| LightCycler480系统 | Roche Diagnostics | -- | |
| 细胞增殖检测 | 细胞计数试剂盒(CCK)-8 | Dojindo | -- |
| 酶标仪 | Bio-Tek Instruments | EL340 | |
| 流式凋亡检测 | Annexin V-PE/7AAD试剂盒 | BD Biosciences | -- |
| BD LSRFortessaTM流式细胞仪 | BD Biosciences | -- | |
| ELISA | ELISA试剂盒 | BD Biosciences | -- |
| ELISA试剂盒 | Elabscience | -- | |
| RNA-FISH | RNA-FISH试剂盒 | GenePharma | -- |
| 荧光显微镜 | OLYMPUS | BX63 | |
| 双荧光素酶报告实验 | 双荧光素酶检测试剂盒 | Promega | E1910 |
| RNA pull-down | RNA反义纯化试剂盒 | Bersin Bio | -- |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Solarbio | -- | |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | -- | |
| 兔抗MAPK14抗体 | Abcam | -- | |
| 兔抗微管蛋白抗体 | CST | -- | |
| 辣根过氧化物酶标记的山羊抗兔IgG二抗 | Proteintech | -- | |
| RNase R实验 | RNase R | Geneseed Biotech | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 临床样本采集 | 患者纳入标准、样本类型、样本量 阅读提示:Materials and methods- Patients and peripheral blood samples |
| 细胞培养与炎症诱导 | 细胞系、培养基、LPS浓度和处理时间 阅读提示:Materials and methods- Cell culture and construction of cell inflammatory model |
| 慢病毒转染 | MOI、转染时间、筛选浓度 阅读提示:Materials and methods- Lentiviral transduction |
| 基因表达检测 | 引物序列、内参基因、定量方法 阅读提示:Materials and methods- RNA extraction and qRT-PCR analysis, 补充文件6 |
| 机制验证 | 探针序列、载体构建、检测方法 阅读提示:Materials and methods- RNA FISH, Dual-luciferase reporter assay, RNA pull-down |