SP感染条件优化
确定稳定的SP感染模型条件,以诱导持续的细胞损伤。
将FCA-L2细胞暴露于不同浓度(0.02或0.05 McF)的SP不同时间(2或4小时),随后用7.5 µg/ml多西环素处理18小时,通过LDH释放评估损伤。
Multi-omics analysis of glutamine and fish collagen peptides in alleviating post-antibiotic Streptococcus pneumoniae injury in feline lung cells.
包含体外细胞感染模型、功能验证(LDH、凋亡、氧化应激)和多组学分析,但缺乏动物实验和患者样本验证。
猫肺间质细胞系FCA-L2
SP感染浓度:0.05 McF SP感染时间:4小时 多西环素浓度:7.5 µg/ml 多西环素处理时间:18小时 GLU剂量:40 mM FCP剂量:500 µg/ml
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定稳定的SP感染模型条件,以诱导持续的细胞损伤。
将FCA-L2细胞暴露于不同浓度(0.02或0.05 McF)的SP不同时间(2或4小时),随后用7.5 µg/ml多西环素处理18小时,通过LDH释放评估损伤。
确定GLU和FCP的安全有效浓度,以减轻SP诱导的细胞毒性。
使用CCK-8法检测不同浓度GLU(0-80 mM)和FCP(0-1000 µg/ml)对细胞活力的影响,并基于LDH释放评估其保护作用。
评估GLU和FCP对SP诱导的炎症、紧密连接破坏、凋亡和氧化应激的影响。
检测培养上清中IL-1β、TNF-α和IL-8水平,细胞内紧密连接蛋白表达,细胞形态和凋亡,以及MDA、SOD、GPX、T-AOC和TOS等氧化应激指标。
揭示GLU和FCP保护作用的分子机制。
对NC、SP、GLU_SP和FCP_SP组进行RNA测序和非靶向代谢组学分析,通过GSEA和联合通路分析识别受影响的通路。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 药物处理 | 盐酸多西环素 | Shanghai Macklin Biochemical Co., Ltd. | -- |
| L-谷氨酰胺 | Shanghai Macklin Biochemical Co., Ltd. | -- | |
| 鱼鳞胶原肽 | Hainan Huayan Collagen Technology Co., Ltd. | -- | |
| 细胞活力检测 | 细胞计数试剂盒-8 (CCK-8) | Beyotime Biotechnology | -- |
| LDH释放检测 | LDH释放检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | C0017 |
| 细胞因子检测 | IL-1β ELISA试剂盒 | Shanghai Enzyme-linked Biotechnology Co., Ltd. | ml023097-2 |
| IL-8 ELISA试剂盒 | Shanghai Enzyme-linked Biotechnology Co., Ltd. | ml023094-2 | |
| TNF-α ELISA试剂盒 | Shanghai Enzyme-linked Biotechnology Co., Ltd. | ml035852-2 | |
| 紧密连接蛋白检测 | E-钙粘蛋白ELISA试剂盒 | Shanghai Enzyme-linked Biotechnology Co., Ltd. | ml680120 |
| Occludin ELISA试剂盒 | Shanghai Enzyme-linked Biotechnology Co., Ltd. | ml847159 | |
| Claudin ELISA试剂盒 | Shanghai Enzyme-linked Biotechnology Co., Ltd. | ml847222 | |
| ZO-1 ELISA试剂盒 | Shanghai Enzyme-linked Biotechnology Co., Ltd. | ml847150 | |
| 氧化应激检测 | MDA检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | S0131S |
| SOD活性检测试剂盒(WST-8) | Beyotime Biotechnology | S0101S | |
| GPX活性检测试剂盒 | Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd. | BC1195 | |
| T-AOC检测试剂盒(FRAP法) | Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd. | BC1315-100T/96S | |
| TOS检测试剂盒 | Beijing Solarbio Science & Technology Co., Ltd. | BC6245-100T/96S | |
| 蛋白浓度测定 | Pierce BCA蛋白测定试剂盒 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| 形态学染色 | 结晶紫溶液 | Qingdao Hope Bio-technology Co., Ltd. | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC | Beyotime Biotechnology | -- |
| 碘化丙啶 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Beyotime Biotechnology | -- |
| RNA测序 | Fast RNA-seq文库构建试剂盒V2 | ABclonal Biotech Co., Ltd. | RK20306 |
| oligo(dT)磁珠 | ABclonal Biotech Co., Ltd. | RK20257 | |
| 代谢组学 | Q Exactive™ HF质谱仪 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
| Hypersil GOLD C18色谱柱 | Thermo Fisher Scientific, Inc. | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| SP感染模型建立 | SP浓度(0.05 McF)、感染时间(4小时)、多西环素浓度(7.5 µg/ml)、多西环素处理时间(18小时) 阅读提示:Materials and methods: LDH release assay for SP-infected lung cells; Results: Optimization of SP infection conditions |
| 药物处理 | GLU浓度(40 mM)、FCP浓度(500 µg/ml)、处理时间(18小时) 阅读提示:Materials and methods: Evaluation of pharmacological intervention |
| 细胞功能检测 | 细胞因子检测方法(ELISA)、紧密连接蛋白检测方法、凋亡染色方法、氧化应激指标检测方法 阅读提示:Materials and methods: Measurement of cytokines in culture supernatants, Measurement of tight junction proteins, Measurement of oxidative stress markers, Analysis of cell morphology and apoptosis |
| 转录组分析 | RNA提取方法、文库构建试剂盒、测序平台(Illumina NovaSeq 6000)、差异表达基因筛选标准(padj≤0.05, |FC|≥1.2) 阅读提示:Materials and methods: RNA isolation and library preparation, Differential expression analysis |
| 代谢组学分析 | 样品提取方法(80%甲醇)、LC-MS/MS条件(色谱柱、流动相、梯度)、差异代谢物筛选标准(VIP≥1, P<0.05, FC≥1.5或≤0.67) 阅读提示:Materials and methods: Untargeted metabolomics analysis |