靶向关系验证
验证circ-find-0001774与miR-153-3p和let-7a-5p的靶向关系。
将野生型和突变型circ-find-0001774双荧光素酶报告质粒与miR-153-3p mimic、let-7a-5p mimic及mimic NC共转染293T细胞,48小时后检测荧光素酶活性。
Circ-find-0001774 Modulates Parkinson's Disease via miR-153-3p: Mechanistic Insights and Therapeutic Implications.
包含双荧光素酶靶向验证、细胞功能实验(增殖、凋亡、自噬蛋白)、动物模型行为学与组织学验证,以及qPCR和Western blot机制验证。
MN9D多巴胺能神经元细胞系 MPTP诱导的C57BL/6小鼠帕金森病模型
双荧光素酶报告基因验证circ-find-0001774与miR-153-3p直接结合 circ-find-0001774过表达载体及腺病毒转染/注射效率验证 MPP+处理MN9D细胞浓度100 µmol/L及时间24h MPTP处理小鼠剂量18 mg/kg及时间7天 行为学测试(爬杆实验和悬挂实验)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证circ-find-0001774与miR-153-3p和let-7a-5p的靶向关系。
将野生型和突变型circ-find-0001774双荧光素酶报告质粒与miR-153-3p mimic、let-7a-5p mimic及mimic NC共转染293T细胞,48小时后检测荧光素酶活性。
在MN9D细胞中建立PD模型并评估circ-find-0001774过表达对细胞增殖和凋亡的影响。
用100 µmol/L MPP+碘化物处理MN9D细胞24小时,转染circ-find-0001774过表达载体后,使用CCK-8检测增殖,流式细胞术检测凋亡。
检测circ-find-0001774过表达对miR-153-3p和自噬相关蛋白LC3Ⅱ/Ⅰ表达的影响。
通过qPCR检测circ-find-0001774和miR-153-3p表达,Western blot检测LC3Ⅱ/Ⅰ蛋白水平。
建立小鼠PD模型并实现circ-find-0001774在黑质区域的过表达。
雄性C57BL/6小鼠分为Control、Model、Model+OE NC、Model+OE circ-0001774四组,通过立体定位注射腺病毒至SNc区,随后每日腹腔注射18 mg/kg MPTP连续7天。
评估circ-find-0001774过表达对PD小鼠运动功能和黑质病理的影响。
在最后一次MPTP注射后第三天进行爬杆实验和悬挂实验评估运动功能;通过HE染色观察黑质神经元形态。
检测circ-find-0001774过表达对小鼠中脑miR-153-3p和β-catenin蛋白表达的影响。
通过qPCR检测中脑组织miR-153-3p表达,Western blot检测β-catenin蛋白水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Beyotime | RG027 |
| 细胞培养 | DMEM完全培养基 | KeyGen Biotec | KGM12800S |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 10565018 | |
| 细胞模型诱导 | MPP+碘化物 | MCE | HY-W008719 |
| 细胞增殖检测 | CCK-8试剂 | -- | -- |
| 酶标仪 | Beijing Liuyi | WD-2012B | |
| 流式凋亡检测 | Annexin V-FITC | MULTI SCIENCES | AP101-100-kit |
| 碘化丙啶 | MULTI SCIENCES | AP101-100-kit | |
| 流式细胞仪 | Acea Biosciences | NovoCyte | |
| 动物模型诱导 | MPTP | Shanghai YuanYe | S31504 |
| HE染色 | 伊红 | Solarbio | G1100 |
| 显微镜 | Olympus | BX43 | |
| RNA提取 | Trizon试剂 | CWBIO | CW0580S |
| RNA提取试剂盒 | CWBIO | CW0581M | |
| RNA质量检测 | NanoPhotometer分光光度计 | -- | NP80 |
| 逆转录 | HiScript II逆转录酶 | Vazyme | R223-01 |
| qPCR扩增 | CFX Connect™实时荧光定量PCR检测系统 | Bio-Rad | -- |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | -- | -- |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Elabscience | E-BC-K318-M |
| Western blot检测 | 增强化学发光试剂 | Thermo Fisher | RJ239676 |
| Western blot成像 | 化学发光成像系统 | Shanghai Tanon | Tanon-5200 |
| Western blot抗体 | 小鼠抗β-Actin抗体 | TransGen Biotech | HC201 |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG (H+L) | Service | GB23301 | |
| 兔抗LC3A/B抗体 | ABclonal | A7198 | |
| 兔抗Beclin-1抗体 | Proteintech | 11306-1-AP | |
| 兔抗细胞色素C抗体 | Abcam | ab133504 | |
| 兔抗裂解Caspase-3抗体 | CST | 9664 | |
| 兔抗Wnt3a抗体 | Affinity | DF6113 | |
| 小鼠抗β-catenin抗体 | Proteintech | 66379-1-Ig | |
| HRP标记的山羊抗兔IgG (H+L) | Servicebio | GB23303 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 靶向关系验证 | 双荧光素酶报告质粒类型(野生型/突变型)及共转染的mimic种类(miR-153-3p、let-7a-5p、NC) 阅读提示:Materials and Methods: Dual-Luciferase Reporter Assay |
| 细胞模型建立 | MN9D细胞处理浓度100 µmol/L MPP+,处理时间24h;细胞培养基为DMEM完全培养基(10% FBS,1%青霉素-链霉素) 阅读提示:Materials and Methods: Cell Culture and Treatment |
| 细胞功能检测 | CCK-8试剂孵育时间2小时,检测波长450nm;流式检测细胞数1×10^6,染色试剂Annexin V-FITC 5µL和PI 10µL,室温避光孵育10分钟 阅读提示:Materials and Methods: CCK-8 Cell Proliferation Assay; Flow Cytometry for Apoptosis Detection |
| 动物模型建立 | 小鼠品系C57BL/6,性别雄性,周龄9-10周;立体定位注射腺病毒4µL至SNc区,留针5分钟;MPTP腹腔注射剂量18 mg/kg,每日一次,连续7天 阅读提示:Materials and Methods: Animal Handling and Treatment |
| 行为学测试 | 测试时间(最后一次MPTP注射后第三天);爬杆实验参数(杆长50cm,直径1cm,球径1.5cm,三次取平均),悬挂实验参数(金属丝离地30cm,记录跌落时间) 阅读提示:Materials and Methods: Behavioral Tests |
| 分子表达检测 | qPCR内参基因(β-actin和U6),引物序列参见表;Western blot抗体稀释比例(如β-Actin 1:2000,LC3A/B 1:1000等),蛋白上样量及曝光时间未明确说明 阅读提示:Materials and Methods: Quantitative Real-Time PCR; Western Blot Analysis |