细胞模型建立与验证
验证Ang II刺激能否诱导VSMCs从收缩表型向合成表型转化,并确认炎症反应。
使用A7R5细胞系,以1×10^-7 mol/L Ang II刺激24小时,通过qPCR检测AT1R、MMP2、MMP9和VCAM1的mRNA表达水平。
The Metabolite Differences in Vascular Smooth Muscle Cells of Abdominal Aortic Aneurysm Revealed by Untargeted Metabolomics.
包含细胞模型和动物模型两个独立证据层级,但功能验证仅检测了mRNA表达,缺乏蛋白水平或机制干预实验,属于中等实验完整度。
A7R5大鼠血管平滑肌细胞系 Ang II诱导的ApoE−/−小鼠腹主动脉瘤模型
细胞实验使用A7R5细胞系(Procell, cat. CL-0316), 第5-7代 Ang II刺激浓度:1×10^-7 mol/L,处理24小时 动物模型:8周龄雄性ApoE−/−小鼠,植入Alzet渗透泵(model 2004)释放Ang II(1000 ng/kg/min)28天,高脂饮食(XT108C) 代谢组学分析:每组3个生物学重复,细胞实验每组n=3,动物实验每3只小鼠合并为一个样本,n=3(每组9只小鼠) qPCR验证基因包括AT1R、MMP2、MMP9、VCAM1,使用2^-ΔΔCT法
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
验证Ang II刺激能否诱导VSMCs从收缩表型向合成表型转化,并确认炎症反应。
使用A7R5细胞系,以1×10^-7 mol/L Ang II刺激24小时,通过qPCR检测AT1R、MMP2、MMP9和VCAM1的mRNA表达水平。
鉴定Ang II刺激后VSMCs中差异表达的代谢物及其相关代谢通路。
收集处理后的细胞样本,采用LC-MS/MS进行非靶向代谢组学分析,经数据处理和统计筛选差异代谢物,并进行KEGG和MSEA富集分析。
在动物水平验证Ang II能否诱导AAA形成,并获取主动脉组织用于代谢组学分析。
对ApoE−/−小鼠植入释放Ang II的渗透泵,持续28天,并给予高脂饮食;处死后解剖主动脉,确认动脉瘤形成,并取肾上腹主动脉进行后续分析。
鉴定Ang II诱导的小鼠主动脉组织中差异代谢物及其相关代谢通路。
对主动脉组织进行样品制备和LC-MS/MS分析,数据处理与细胞样本类似,筛选差异代谢物并进行KEGG和MSEA富集分析。
整合细胞和组织代谢组学结果,识别共有的差异代谢物和通路,并验证肉碱水平。
比较两组差异代谢物和富集通路,确定共有的代谢物和通路;使用肉碱检测试剂盒对细胞和组织样本中游离和总肉碱进行定量验证。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | A7R5细胞 | Procell | CL-0316 |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 血管紧张素II | MedChemExpress | -- | |
| 磷酸盐缓冲液 | -- | -- | |
| 胰蛋白酶 | Gibco | -- | |
| qPCR | FastPure 细胞/组织总RNA提取试剂盒 V2 | Vazyme | -- |
| HiScript III All-in-one RT SuperMix | Vazyme | -- | |
| ChamQBlue Universal SYBR qPCR预混液 | Vazyme | -- | |
| 动物实验 | Alzet渗透泵 | Alzet | 2004 |
| 高脂饮食 | Jiangsu Xietong Pharmaceutical Biological Engineering Co., Ltd. | XT108C | |
| 代谢组学分析 | Thermo Vanquish超高效液相色谱系统 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| Q Exactive HF-X质谱仪 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| ACQUITY Premier HSS T3色谱柱 | Waters Corporation | -- | |
| 靶向肉碱验证 | 游离肉碱/总肉碱含量检测试剂盒 | Solarbio | BC0675 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与处理 | 细胞系A7R5,代数5-7,DMEM+10%FBS,Ang II浓度1×10^-7 mol/L,处理24小时,每组3个生物学重复,独立重复3次 阅读提示:Methods 2.1.1,Ang II浓度参见 [20,21,22] |
| qPCR验证 | 引物序列(见表1),包括AGTR1a、MMP2、MMP9、VCAM1和β-ACTIN,使用2^-ΔΔCT法 阅读提示:Methods 2.1.2,表1 |
| 动物模型 | 8周龄雄性ApoE−/−小鼠,体重20-22g,Ang II释放速率1000 ng/kg/min,Alzet泵型号2004,28天,高脂饮食,每组9只小鼠(每3只合并为一个样本) 阅读提示:Methods 2.1.3,图4A |
| 非靶向代谢组学样本制备 | 细胞样本:加入500 µL甲醇-水内标提取液,冻融循环,离心条件;组织样本:液氮研磨取20 mg,加400 µL 70%甲醇水内标提取液,离心条件 阅读提示:Methods 2.2.1 |
| LC-MS/MS分析 | 色谱柱ACQUITY Premier HSS T3 (1.8 µm, 2.1×100 mm),流动相0.1%甲酸水/乙腈,柱温40°C,流速0.4 mL/min,进样量细胞4 µL、组织3 µL,质谱参数见表S2 阅读提示:Methods 2.2.2,补充表S1和S2 |