筛选TAMs中差异表达的DUBs
鉴定在结肠癌TAMs中特异性上调的DUBs。
建立MC38皮下移植瘤模型,分离TAMs和BMDMs(M1/M2极化),通过qPCR筛选68个DUB相关基因。
Targeting USP14 enhances immunotherapy response by reprogramming tumor-associated macrophages in colon cancer.
包含体外细胞实验(BMDM极化、siRNA敲低)和体内动物模型(MC38荷瘤小鼠)双重证据,并进行了功能验证(巨噬细胞耗竭)和机制验证(RNA-seq、MAPK通路)。
MC38小鼠结肠癌皮下移植瘤模型 骨髓来源巨噬细胞(BMDMs) 肿瘤相关巨噬细胞(TAMs)
MC38细胞皮下注射剂量(2×10^6)及模型建立时间 IU1给药剂量(20 mg/kg)和给药方案(第6、9、12、15天) 抗PD-1抗体给药剂量(7.5 mg/kg)和给药方案(第7、9、11、13天) 巨噬细胞耗竭剂氯膦酸盐脂质体的使用方案(首日150 μL,之后每三天100 μL,共四次) BMDM极化条件(IL-4/IL-13 20 ng/mL 或 LPS 50 ng/mL)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
鉴定在结肠癌TAMs中特异性上调的DUBs。
建立MC38皮下移植瘤模型,分离TAMs和BMDMs(M1/M2极化),通过qPCR筛选68个DUB相关基因。
验证USP14是否调控M2巨噬细胞极化。
使用USP14抑制剂IU1处理TAMs和M2-BMDMs,检测CD206表达;使用siRNA敲低USP14,检测CD206表达。
评估USP14抑制在体内的抗肿瘤作用及对肿瘤微环境的影响。
MC38荷瘤小鼠给予IU1(20 mg/kg,腹腔注射)或对照,监测肿瘤生长,并通过流式细胞术分析免疫细胞比例和细胞因子。
验证IU1的抗肿瘤效应和T细胞激活是否依赖于巨噬细胞。
使用氯膦酸盐脂质体耗竭巨噬细胞,比较IU1单独或与耗竭联合的效果,检测肿瘤生长和IFN-γ+CTLs比例。
阐明USP14抑制诱导M1极化的分子机制。
对IU1处理组和对照组的TAMs进行RNA-seq,分析差异表达基因和KEGG通路;在M2-BMDMs中验证MAPK通路磷酸化,并使用MAPK抑制剂进行功能验证。
评估USP14抑制与PD-1阻断联合治疗的协同抗肿瘤效果。
MC38荷瘤小鼠分为四组:对照、IU1单药、抗PD-1单药和联合治疗,监测肿瘤生长和生存期,并通过免疫荧光检测M2巨噬细胞和CD8+ T细胞。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | 12100061 |
| 胎牛血清 | Gibco | A5670701 | |
| 动物实验 | IU1 | MedChemExpress | HY-13817 |
| 细胞培养 | 重组小鼠白细胞介素-4 | Biolegend | 574304 |
| 重组小鼠白细胞介素-13 | Biolegend | 575904 | |
| 重组小鼠巨噬细胞集落刺激因子 | Biolegend | 576404 | |
| 脂多糖 | Biosharp | BS464 | |
| 免疫荧光 | Opal 7色手动免疫组化试剂盒 | Akoya Biosciences | NEL861001KT |
| 动物实验 | 抗PD-1抗体 | Invitrogen | MA5-48236 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型建立 | MC38细胞皮下注射数量和体积 阅读提示:Methods: Experimental model and study participant details, Animals |
| 药物处理 | IU1剂量、给药途径和频率 阅读提示:Methods: Animal experiments |
| 药物处理 | 抗PD-1抗体剂量、给药途径和频率 阅读提示:Methods: Animal experiments |
| 巨噬细胞耗竭 | 氯膦酸盐脂质体给药方案 阅读提示:Methods: Animal experiments |
| BMDM极化 | 极化因子浓度和刺激时间 阅读提示:Methods: Primary cell cultures |