构建基因缺失及互补菌株
研究inlB和LIPI-4的功能关系
利用同源重组构建ΔinlB、ΔLIPI-4-ΔinlB,并用pIMK2质粒构建互补株ΔinlB::inlB;通过PCR验证。
LIPI-4 as a Critical Modulator of InlB-Mediated Pathogenicity in Listeria monocytogenes.
研究包含基因敲除与互补株构建、体外细胞感染实验、体内小鼠感染实验,并进行功能与机制验证,证据层级独立。
Lm928野生型及突变株 Caco-2人结肠腺癌细胞 HTR-8人绒毛膜滋养层细胞 hCMEC/D3人脑微血管内皮细胞 L929小鼠成纤维细胞 昆明小鼠感染模型
菌株背景:Lm928及ΔLIPI-4 MOI:10,感染时间1小时 庆大霉素浓度:100 μg/mL(杀灭胞外菌)和10 μg/mL(维持) 小鼠感染剂量:约1×10^7 CFU,腹腔注射 统计方法:单因素方差分析及Tukey HSD事后检验,p<0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
研究inlB和LIPI-4的功能关系
利用同源重组构建ΔinlB、ΔLIPI-4-ΔinlB,并用pIMK2质粒构建互补株ΔinlB::inlB;通过PCR验证。
分析LIPI-4对inlB转录的影响
提取细菌RNA和感染宿主细胞RNA,进行qRT-PCR检测inlB表达水平。
排除生长差异对表型的影响
测定各菌株在BHI培养基中的生长曲线。
评估LIPI-4和inlB对生物膜形成的影响
在48孔板中静态培养细菌,结晶紫染色定量生物膜。
评估LIPI-4和inlB对细菌运动性的影响
在半固体培养基上接种细菌,测量迁移圈直径。
评估细胞间传播能力
在L929细胞单层上感染细菌,用琼脂糖覆盖,观察噬斑形成。
评估细菌与宿主细胞相互作用
在Caco-2、HTR-8、hCMEC/D3细胞中测定黏附、侵袭和胞内增殖情况。
评估在体毒力及器官定植差异
通过腹腔注射感染昆明小鼠,测定肝脏、脾脏、脑中的细菌载量。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 菌株构建 | pMD19-T(Simple)载体 | TaKaRa | -- |
| pKSV7质粒 | -- | -- | |
| pIMK2质粒 | -- | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| RPMI-1640培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Excell Bio | -- | |
| 细菌培养 | 脑心浸液培养基 | Qingdao Hi-Tech Park Haibo Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| 分子实验 | Pfu酶 | Beijing Quantype Gold Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| dNTPs | Beijing Quantype Gold Biotechnology Co., Ltd. | -- | |
| T4 DNA连接酶 | Promega | -- | |
| BamHI限制性内切酶 | TaKaRa | -- | |
| PstI限制性内切酶 | TaKaRa | -- | |
| XhoI限制性内切酶 | TaKaRa | -- | |
| 试剂 | 氯霉素 | Beijing Boaotuoda Technology Co., Ltd. | -- |
| 卡那霉素 | Beijing Boaotuoda Technology Co., Ltd. | -- | |
| 溶菌酶 | Beijing Boaotuoda Technology Co., Ltd. | -- | |
| HEPES | Beijing Boaotuoda Technology Co., Ltd. | -- | |
| RNA提取 | RNA提取试剂盒 | TransGen Biotech | -- |
| RT-qPCR | 反转录试剂盒 | Takara Bio | -- |
| PerfectStart® Green qPCR SuperMix | TransGen Biotech | -- | |
| LightCycler 96实时荧光定量PCR仪 | Roche | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 菌株构建 | 引物序列、限制性位点、同源臂长度、电转化参数、筛选抗性浓度 阅读提示:Methods 2.2.1,Table 1 |
| qPCR | MOI、感染时间、庆大霉素浓度、RNA提取方法 阅读提示:Methods 2.2.3,Figure 1图注 |
| 生物膜实验 | 初始OD600、培养时间、结晶紫浓度 阅读提示:Methods 2.2.6,Figure 3图注 |
| 运动性实验 | 培养基成分(NaCl、胰蛋白胨、琼脂浓度)、培养温度和时间 阅读提示:Methods 2.2.5,Figure 4图注 |
| 噬斑实验 | MOI、庆大霉素浓度、琼脂糖浓度、培养时间 阅读提示:Methods 2.2.7,Figure 5图注 |
| 黏附、侵袭和增殖实验 | MOI、感染时间、庆大霉素浓度、各时间点、细胞接种密度 阅读提示:Methods 2.2.8,Figures 6-8图注 |
| 小鼠感染实验 | 小鼠品系、周龄、接种剂量、感染时间、器官处理 阅读提示:Methods 2.2.9,Figure 9图注 |