细胞增殖抑制评估
评估LIE、ISO和NEF对乳腺癌细胞增殖的抑制作用
使用CCK-8试剂盒检测不同浓度(3, 10, 30, 60, 100 μM)处理48小时后对HCC1954、MDA-MB-468和MDA-MB-231细胞增殖的影响。
Molecular Mechanisms Underlying the Anti-Tumor Activity of Lotus-Derived Alkaloids in Breast Cancer.
包含CCK-8增殖抑制、流式细胞术凋亡和细胞周期分析、RNA-seq转录组学、Western blot蛋白验证等多个独立实验层级,并涉及多种乳腺癌细胞系。
HCC1954人乳腺癌细胞系(HER2阳性) MDA-MB-468人三阴性乳腺癌细胞系 MDA-MB-231人三阴性乳腺癌细胞系
处理浓度:60 μM(凋亡和细胞周期实验)与30 μM(转录组和Western blot) 处理时间:24小时(凋亡、细胞周期、转录组和Western blot)或48小时(CCK-8) 细胞系:HCC1954、MDA-MB-468和MDA-MB-231 统计学方法:单因素或双因素ANOVA,事后Dunnett检验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估LIE、ISO和NEF对乳腺癌细胞增殖的抑制作用
使用CCK-8试剂盒检测不同浓度(3, 10, 30, 60, 100 μM)处理48小时后对HCC1954、MDA-MB-468和MDA-MB-231细胞增殖的影响。
确定LIE、ISO和NEF是否诱导乳腺癌细胞凋亡
使用Annexin V-APC/PI双染和流式细胞术检测60 μM处理24小时后细胞凋亡情况。
评估LIE、ISO和NEF是否影响细胞周期分布
通过PI染色和流式细胞术分析60 μM处理24小时后细胞周期分布。
揭示LIE、ISO和NEF处理后的基因表达变化及信号通路扰动
对HCC1954细胞进行30 μM处理24小时后,提取RNA进行RNA-seq,分析差异表达基因(DEGs),并进行KEGG和GO富集分析。
验证转录组发现的MAPK和AKT信号通路在蛋白水平的变化
通过Western blot检测30 μM处理24小时后HCC1954和MDA-MB-468细胞中p-AKT、p-ERK蛋白表达水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 莲心碱 | MedChemExpress | 2586-96-1 |
| 异莲心碱 | MedChemExpress | 6817-41-0 | |
| 甲基莲心碱 | MedChemExpress | 2292-16-2 | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- |
| RPMI-1640培养基 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 青霉素-链霉素 | -- | -- | |
| 细胞增殖检测 | 细胞计数试剂盒-8 | ACE Biotechnology | -- |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC/PI凋亡检测试剂盒 | MedChemExpress | HY-K1073 |
| 流式细胞术 | BD FACSCanto II流式细胞仪 | BD | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RNA质检 | Agilent 2100生物分析仪 | Agilent | -- |
| 文库构建 | MGIEasy通用文库转换试剂盒 | APP-A | APP-A |
| 测序 | DNBSEQ-T7测序平台 | -- | -- |
| Western blot | Tanon 5200化学发光成像系统 | Tanon | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞增殖抑制评估 | 细胞系、处理浓度(0-100 μM)、处理时间(48小时)、种板密度(3000细胞/孔) 阅读提示:参见材料与方法4.3节 CCK-8 Assay |
| 凋亡检测 | 细胞系、处理浓度(60 μM)、处理时间(24小时)、种板密度(2e5细胞/孔)、凋亡试剂盒型号 阅读提示:参见材料与方法4.4节 Apoptosis Assay |
| 细胞周期分析 | 细胞系、处理浓度(60 μM)、处理时间(24小时)、种板密度(2e5细胞/孔)、固定和染色步骤 阅读提示:参见材料与方法4.5节 Cell Cycle Analysis |
| 转录组测序 | 细胞系(HCC1954)、处理浓度(30 μM)、处理时间(24小时)、RNA提取方法、文库构建试剂盒、测序平台、DEGs阈值 阅读提示:参见材料与方法4.6节 RNA Sequencing |
| Western blot | 细胞系(HCC1954和MDA-MB-468)、处理浓度(30 μM)、处理时间(24小时)、抗体信息、化学发光检测系统 阅读提示:参见材料与方法4.7节 Western Blot Analysis |