抗真菌活性测定
评估PO对多种念珠菌株的抑制作用,并测定其MIC。
采用CLSI M27-A3指南的微量稀释法,检测PO对11株念珠菌的MIC。
Pogostone disrupts key virulence traits of Candida albicans: hyphal inhibition and biofilm suppression.
包含体外抗真菌活性、菌丝形态抑制、生物膜量化分析、细胞黏附侵袭实验及转录组测序结合qRT-PCR验证等多个证据层级。
白色念珠菌标准菌株(包括CMCC 98001等)及临床分离株 人阴道上皮细胞系VK2/E6E7
PO浓度(4、8、16、32 µg/mL)用于菌丝、生物膜、黏附侵袭实验 生物膜形成阶段(4h初始期、24h中间期、48h成熟期) 处理时间(24h和48h) qRT-PCR验证的毒力基因(HWP1、ECE1、ALS3、TPK2、EFG1) NC对照(DMSO ≤0.1% v/v)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估PO对多种念珠菌株的抑制作用,并测定其MIC。
采用CLSI M27-A3指南的微量稀释法,检测PO对11株念珠菌的MIC。
观察PO对白色念珠菌生长动力学的影响。
使用自动生长曲线分析仪监测OD600,评估不同浓度PO处理的生长曲线。
检测PO对白色念珠菌酵母-菌丝形态转变的抑制作用。
通过光学显微镜和SEM观察不同浓度PO处理后菌丝形态变化。
评估PO对白色念珠菌生物膜形成、代谢活性和生物量的影响。
构建生物膜模型,用XTT还原实验、CV染色和CSH测量评估不同阶段生物膜处理PO后的变化。
探究PO对白色念珠菌黏附和侵袭人阴道上皮细胞能力的影响。
将PO预处理的白色念珠菌与VK2/E6E7细胞共培养,测定黏附率和侵袭率。
揭示PO处理对白色念珠菌基因表达谱的影响,并探索其分子机制。
提取RNA并进行转录组测序,分析差异表达基因,进行GO和KEGG富集分析。
验证转录组结果中关键毒力基因的表达变化。
通过qRT-PCR检测PO处理后的HWP1、ECE1、ALS3、TPK2和EFG1的表达水平。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 药物处理 | 广藿香酮 | Chengdu Alfa Biotechnology Co., Ltd. | AZBI2314 |
| 两性霉素B | Shanghai Yuanye Bio-Technology Co., Ltd. | A08IS221735 | |
| 氟康唑 | Chengdu Alfa Biotechnology Co., Ltd. | AFDH1353 | |
| 真菌培养 | RPMI-1640培养基 | Sigma-Aldrich | -- |
| 细胞培养 | VK2/E6E7细胞专用培养基 | -- | -- |
| 细胞消化 | 0.25%胰蛋白酶-EDTA | -- | -- |
| 菌丝形态观察 | 尼康Eclipse Ti2显微镜 | Nikon | -- |
| 扫描电子显微镜(JSM-IT700HR) | JEOL | -- | |
| 生物膜代谢活性检测 | XTT试剂 | -- | -- |
| 生物膜染色 | 结晶紫 | -- | -- |
| 生物膜结构观察 | FUN-1染料 | -- | -- |
| 刀豆蛋白A | -- | -- | |
| 共聚焦激光扫描显微镜(Olympus FV1200) | Olympus | -- | |
| 细胞黏附侵袭实验 | Triton X-100 | -- | -- |
| 庆大霉素 | -- | -- | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Shanghai Bainite Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| 逆转录 | ExonScript RT SuperMix(含dsDNase) | Chengdu Exongen Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| qRT-PCR | UltraStart SYBR Green qPCR预混液 | Chengdu Exongen Biotechnology Co., Ltd. | -- |
| 转录组测序 | Illumina NovaSeq 6000测序平台 | Illumina | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 抗真菌活性测定 | PO浓度范围、菌株种类、接种浓度、培养时间 阅读提示:Materials and methods: Anti-Candida activity assays; Table 2 |
| 菌丝形态抑制实验 | PO浓度、处理时间、观察方法 阅读提示:Materials and methods: Hyphal morphogenesis assay; Figure 2 |
| 生物膜形成与抑制实验 | 生物膜培养时间、PO浓度、处理时间、检测方法 阅读提示:Materials and methods: Biofilm analysis methodologies; Figures 3-5 |
| 细胞黏附与侵袭实验 | 细胞系、PO浓度、预处理时间、共培养时间、检测终点 阅读提示:Materials and methods: Human vaginal epithelial (VK2/E6E7) cell adhesion and invasion assay; Figure 6 |
| 转录组测序 | PO浓度、差异表达基因筛选阈值、富集分析参数 阅读提示:Materials and methods: Transcriptomics sequencing; Figure 7 |
| qRT-PCR验证 | 基因列表(HWP1、ECE1、ALS3、TPK2、EFG1)、内参基因、分析方法 阅读提示:Materials and methods: Quantitative real-time PCR; Table 1; Figure 7H |