检测BRG1表达变化
评估BRG1在心肌梗死心脏及TGF-β1刺激的成纤维细胞中是否上调。
通过qRT-PCR、Western blot和免疫荧光检测MI小鼠心脏梗死区及TGF-β1处理CFs中BRG1的表达水平。
BRG1 exacerbates myocardial fibrosis after myocardial infarction by interacting with ZEB1.
包含体内小鼠MI模型(AAV9-shRNA敲低)、体外CFs功能实验(增殖、迁移、胶原合成)、机制验证(Co-IP、ChIP、双荧光素酶报告实验、PP2A活性测定)及人CFs验证,功能验证与机制验证兼备。
小鼠心肌梗死模型 小鼠原代心脏成纤维细胞 人心脏成纤维细胞 HEK-293细胞
AAV9-shRNA敲低BRG1后,评估心功能(EF、FS)、梗死面积及纤维化程度 TGF-β1刺激浓度和时间(20 ng/mL,24小时)及BRG1表达变化 BRG1与ZEB1的相互作用及其受TGF-β1增强 Ppp2r1a启动子区域的ZEB1结合位点(-121至-10 bp)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估BRG1在心肌梗死心脏及TGF-β1刺激的成纤维细胞中是否上调。
通过qRT-PCR、Western blot和免疫荧光检测MI小鼠心脏梗死区及TGF-β1处理CFs中BRG1的表达水平。
验证BRG1敲低能否减轻MI后心肌纤维化并改善心脏功能。
通过尾静脉注射AAV9-BRG1-shRNA或NC-shRNA,建立MI模型,4周后通过超声心动图、Masson染色和分子检测评估纤维化和心功能。
确定BRG1对CFs增殖、迁移和胶原合成的影响。
在CFs中转染BRG1过表达质粒或siRNA,检测Col-I和FN1表达、EdU增殖、CCK-8活力和伤口愈合迁移。
确认BRG1与ZEB1在CFs中是否存在物理互作,并受TGF-β1调节。
通过免疫荧光共定位、Co-IP(双向)检测内源互作,并分析TGF-β1对互作的增强作用。
探究ZEB1是否介导BRG1诱导的CFs激活和胶原合成。
在CFs中共转染BRG1过表达质粒和siZEB1,检测Col-I、FN1、增殖和迁移。
阐明BRG1-ZEB1复合物如何影响PP2A活性及Smad3磷酸化。
通过PP2A活性测定、qRT-PCR筛选亚基、双荧光素酶报告实验和ChIP实验,确定Ppp2r1a为靶基因,并通过siPpp2r1a和冈田酸进行功能挽救。
评估BRG1在人CFs中是否具有相似的促纤维化作用。
在人CFs中转染人特异性siBRG1,检测BRG1、Col-I、FN1表达及增殖。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物麻醉 | 2,2,2-三溴乙醇 | Sigma | -- |
| MI模型建立 | AAV9-BRG1-shRNA | FluidicLab | -- |
| AAV9-NC-shRNA | FluidicLab | -- | |
| 细胞分离 | 0.25%胰蛋白酶 | Solarbio | -- |
| II型胶原酶 | Invitrogen | -- | |
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Biosharp | -- |
| 成纤维细胞培养基 | ScienCell | #2301 | |
| 胎牛血清 | -- | -- | |
| 细胞转染 | Lipofectamine 2000转染试剂 | Invitrogen | -- |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RT-qPCR | SYBR Green Master Mix | -- | -- |
| ABI 7500 Fast实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| Western blot | RIPA裂解液 | Beyotime | -- |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Beyotime | -- | |
| 硝酸纤维素膜 | Millipore | -- | |
| 快速封闭液 | GenScript | -- | |
| 抗BRG1抗体 | Sigma-Aldrich | 1:500 | |
| 抗I型胶原抗体 | Proteintech | 1:1000 | |
| 抗FN1抗体 | Proteintech | 1:1000 | |
| 抗ZEB1抗体 | Wanleibio | 1:1000 | |
| 抗Ppp2r1a抗体 | ABclonal | 1:1000 | |
| 抗磷酸化Smad3抗体 | Affinity | 1:500 | |
| 抗总Smad3抗体 | Affinity | 1:500 | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 1:1000 | |
| DyLight 800山羊抗兔IgG | Abbkine | 1:10000 | |
| ODYSSEY成像系统 | LI-COR | -- | |
| Co-IP | 免疫沉淀裂解液 | Beyotime | -- |
| 蛋白A/G磁珠 | MedChemExpress | -- | |
| EdU | Cell-Light EdU Apollo 567体外试剂盒 | RiboBio | -- |
| EdU | -- | -- | |
| 免疫荧光 | Triton X-100 | Biotopped | -- |
| DAPI | Beyotime | -- | |
| 荧光显微镜 | 荧光显微镜 | Carl Zeiss | -- |
| 免疫荧光 | 抗BRG1抗体 | Proteintech | 1:100 |
| 抗Smad3抗体 | Affinity | 1:300 | |
| 抗ZEB1抗体 | Invitrogen | 1:1000 | |
| 荧光素-488或594抗体 | -- | -- | |
| 超声心动图 | Vevo 2100高分辨率成像系统 | Visual Sonics | -- |
| Masson染色 | Masson三色染色试剂盒 | Solarbio | -- |
| ChIP | ChIP检测试剂盒 | Thermo Scientific | -- |
| 抗BRG1抗体 | Proteintech | -- | |
| 抗ZEB1抗体 | Invitrogen | -- | |
| 兔IgG | Cell Signaling Technology | -- | |
| 双荧光素酶报告基因 | pGL4.10[luc2]载体 | Promega | -- |
| Opti-MEM培养基 | Invitrogen | -- | |
| 双荧光素酶报告基因检测系统 | Promega | -- | |
| CCK-8 | CCK-8试剂 | Beyotime | -- |
| 酶标仪 | BioTek | -- | |
| PP2A活性检测 | 孔雀绿磷酸盐检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| 药物处理 | 冈田酸 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型 | 小鼠品系(C57BL/6,雄性,8周龄)、体重22-25 g、MI诱导方法(LAD结扎)、AAV9-shRNA剂量(7.5×10^10病毒基因组)及给药途径(尾静脉) 阅读提示:见Materials and Methods - 2.1 Animals 和 2.2 AAV9感染和MI模型 |
| 细胞培养 | 成纤维细胞分离方法(0.25%胰蛋白酶、II型胶原酶)、培养条件(DMEM,37°C,5% CO2)、人CFs来源(ScienCell,#2301)及HEK-293细胞来源(Procell,#CL-0001) 阅读提示:见Materials and Methods - 2.3 细胞分离和转染 |
| 体外功能实验 | TGF-β1刺激浓度(10或20 ng/mL)和时间(24小时)、转染试剂(Lipofectamine 2000)、siRNA序列(siBRG1-1) 阅读提示:见Results - 3.1, 3.3, 3.4 及Methods - 2.3, 2.4 |
| 机制验证 | BRG1/ZEB1抗体、Co-IP条件、ChIP片段范围(-121至-10 bp)、双荧光素酶报告基因构建(Ppp2r1a启动子1.5kb)、PP2A活性测定(孔雀绿试剂盒)、冈田酸浓度(10 nM) 阅读提示:见Materials and Methods - 2.7, 2.12, 2.13, 2.15 及Results - 3.6 |
| 体内功能评估 | 超声心动图参数(EF、FS、LVIDd、LVIDs)、Masson染色定量方法(Image-Pro Plus)、梗死面积测量 阅读提示:见Materials and Methods - 2.10, 2.11 及Results - 3.2 |