细胞系筛选与脂肪生成诱导
筛选对脂肪生成转分化最敏感的PDAC细胞系并验证诱导可行性
对七种人PDAC细胞系(AsPC-1, Capan-1, CFPAC-1, Mia PaCa-2, PANC-1, PaTu 8988t, SW-1990)和正常胰腺细胞系HPDE6.C7应用10天脂肪生成诱导方案,包括胰岛素、地塞米松、罗格列酮和BMP2;通过油红O染色、qRT-PCR和免疫细胞化学评估成脂转化效率。
Adipogenic transdifferentiation reprograms EMT-high PDAC cells into a post-mitotic adipocyte-like state and limits metastasis.
包含体外细胞系筛选、表型与功能验证、ATAC-seq和RNA-seq多组学机制分析,以及原位和肝转移小鼠模型的体内验证。
AsPC-1细胞系 CFPAC-1细胞系 HPDE6.C7正常胰腺细胞系 BALB/c裸小鼠原位PDAC模型 BALB/c裸小鼠肝转移模型
细胞系:AsPC-1(人PDAC细胞系) 诱导方案:含胰岛素(5 μg/ml)、罗格列酮(2 μM)、地塞米松(1 μM)和BMP2(200 ng/ml)的10天脂肪生成诱导方案 体内给药:罗格列酮(16 mg/kg)和BMP2(5 μg/kg)腹腔注射,隔日一次 动物模型:原位注射1×10^6 AsPC-1细胞,肝转移模型采用脾内注射后进行脾切除 对照:使用含等量DMSO的培养基(体外)或PBS(体内)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选对脂肪生成转分化最敏感的PDAC细胞系并验证诱导可行性
对七种人PDAC细胞系(AsPC-1, Capan-1, CFPAC-1, Mia PaCa-2, PANC-1, PaTu 8988t, SW-1990)和正常胰腺细胞系HPDE6.C7应用10天脂肪生成诱导方案,包括胰岛素、地塞米松、罗格列酮和BMP2;通过油红O染色、qRT-PCR和免疫细胞化学评估成脂转化效率。
验证诱导后AsPC-1细胞是否获得脂肪细胞样功能和表型,并评估增殖、迁移和侵袭能力变化
检测诱导后AsPC-1细胞的脂联素分泌、脂肪分解响应、增殖曲线、细胞周期分布、迁移和侵袭能力,以及EMT标志物和转录因子的表达变化。
在基因组水平揭示诱导后AsPC-1细胞的染色质可及性和转录组变化,探究机制
对诱导和对照AsPC-1细胞进行ATAC-seq和RNA-seq分析,包括差异可及性区域、差异表达基因、GSEA、GO分析和TOBIAS足迹分析。
评估脂肪生成诱导在体内对PDAC肿瘤生长和转移的抑制作用
建立原位PDAC模型和肝转移模型,进行体内脂肪生成诱导,比较肿瘤重量、体积、转移负荷(生物发光成像)以及瘤内脂肪生成标志物和EMT标志物表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | -- | -- |
| IMDM培养基 | -- | -- | |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| L15培养基 | -- | -- | |
| 脂肪生成诱导 | 胰岛素 | -- | -- |
| 罗格列酮 | -- | -- | |
| 地塞米松 | -- | -- | |
| 骨形态发生蛋白2 | -- | -- | |
| 脂滴染色 | 油红O染色试剂盒 | OriLeaf | R23104 |
| BODIPY | ThermoFisher | D3922 | |
| 免疫染色 | CEBPA抗体 | Proteintech | 12968-1-AP |
| FABP4抗体 | Proteintech | 12801-1-AP | |
| PPARG抗体 | Proteintech | 16643-1-AP | |
| Ki-67抗体 | Servicebio | GB1514499 | |
| 同型对照 | Abcam | ab37415 | |
| HRP标记二抗 | Abmart | M21002S | |
| SignalStain DAB底物试剂盒 | Cell Signaling Technology | 8059 | |
| 免疫荧光 | 二抗(Ab6564) | Abcam | Ab6564 |
| 含DAPI的抗淬灭封片剂 | Beyotime | P0131 | |
| 蛋白质印迹 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| GAPDH抗体 | ThermoFisher | MA5-15738 | |
| lumiQ电化学发光试剂 | ShareBio | SB-WB012 | |
| ChemiDoc XRS+凝胶成像系统 | BioRad | -- | |
| RNA提取 | RNAiso PLUS | Takara | 9109 |
| 逆转录 | HyperScript逆转录预混液 | APExBIO | K1074 |
| qRT-PCR | 2×通用SYBR Green qPCR预混液 | ShareBio | SB-Q204 |
| ViiA 7实时荧光定量PCR系统 | Applied Biosystems | -- | |
| 脂联素分泌检测 | 脂联素ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0002 |
| 脂肪分解分析 | 脂肪分解比色分析试剂盒 | Elabscience | E-BC-K798-M |
| 细胞增殖 | CCK-8试剂盒 | ShareBio | SB-CCK8 |
| 细胞周期 | 细胞周期与凋亡检测试剂盒 | ShareBio | SB-C6031 |
| 流式分析 | LSRFortessa流式细胞仪 | BD Biosciences | -- |
| Transwell | 无LDEV的基质胶 | Corning | 354234 |
| 6.5mm Transwell,8.0µm孔径聚碳酸酯膜 | Corning | 3433 | |
| 结晶紫 | Beyotime | C0121 | |
| 体内成像 | D-荧光素钾盐 | ShareBio | SB-D1009 |
| IVIS Spectrum小动物活体成像系统 | PerkinElmer | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞系培养 | 细胞系来源、培养基种类及添加物(如MIA PaCa-2需额外添加马血清) 阅读提示:Methods: Cell culture |
| 脂肪生成诱导 | 诱导剂浓度(胰岛素5 μg/ml、罗格列酮2 μM、地塞米松1 μM、BMP2 200 ng/ml)、处理时间(10天)及换液频率(每隔一天) 阅读提示:Methods: Pharmacologically forced adipogenesis |
| 细胞功能检测 | 脂联素分泌检测归一化到GAPDH;脂肪分解检测中异丙肾上腺素浓度(100 nM)和刺激时间(30分钟);细胞增殖检测初始接种密度(1×10^4/孔)和连续监测天数(6天);细胞周期检测固定条件(75%乙醇,-20℃过夜) 阅读提示:Methods: Adiponectin secretion, Lipolysis analysis, Cell proliferation assay, Cell cycle assay |
| 迁移和侵袭检测 | Transwell上室细胞数(1×10^5)、基质胶包被、培养时间(24小时) 阅读提示:Methods: Transwell migration and invasion assays |
| 动物模型 | 小鼠品系(BALB/c裸鼠)、性别(雄性)、年龄(6-8周)、细胞接种数量(1×10^6)、接种部位(原位:胰腺尾部,肝转移:脾内)、脾切除步骤、药物剂量(罗格列酮16 mg/kg、BMP2 5 μg/kg)、给药频率(隔日一次) 阅读提示:Methods: Murine models, Pharmacologically forced adipogenesis |