体外细胞表型评估
评估PA对子宫内膜癌细胞恶性表型的影响
使用Ishikawa细胞,通过MTT、LDH、EdU、伤口愈合、Transwell侵袭、克隆形成、粘附、细胞周期和凋亡实验检测PA处理后的细胞活力、增殖、迁移、侵袭等。
Anti-cancer effect of palmitic acid against the endometrial cancer progression via inducing ferroptosis.
包含体外细胞功能实验(增殖、迁移、侵袭、凋亡等)、体内异种移植模型、转录组和代谢组分析及铁死亡多维度验证和Fer-1救援实验。
Ishikawa细胞(人子宫内膜癌细胞系) Ishikawa细胞皮下异种移植BALB/c裸鼠模型
PA处理浓度:200 μM(体外) PA给药剂量:50 mg/kg,皮下注射,每两天一次(体内) 细胞系:Ishikawa细胞 动物模型:雌性BALB/c裸鼠,5周龄,每组5只 铁死亡抑制剂:Fer-1(10 μM)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估PA对子宫内膜癌细胞恶性表型的影响
使用Ishikawa细胞,通过MTT、LDH、EdU、伤口愈合、Transwell侵袭、克隆形成、粘附、细胞周期和凋亡实验检测PA处理后的细胞活力、增殖、迁移、侵袭等。
验证PA在体内的抗肿瘤疗效
在雌性BALB/c裸鼠皮下接种Ishikawa细胞建立异种移植瘤模型,待肿瘤体积约100 mm³时给药,PA组皮下注射50 mg/kg PA,对照组注射等体积生理盐水,每两天一次,治疗15天后处死动物,测量肿瘤体积和重量,并进行HE、Tunnel和免疫荧光染色。
鉴定PA处理后的差异表达基因及相关通路
提取PA处理Ishikawa细胞的总RNA,进行RNA-seq,使用HISAT2比对、RSEM定量、DESeq2分析差异表达基因,并进行GO和KEGG富集分析。
鉴定PA处理后的差异代谢物及相关代谢通路
提取PA处理Ishikawa细胞的代谢物,使用亲水相互作用色谱-四极杆飞行时间质谱检测,结合数据库进行代谢物鉴定,筛选差异代谢物并进行KEGG通路富集分析。
验证PA是否诱导Ishikawa细胞发生铁死亡
检测PA处理后细胞的ROS水平、线粒体功能(MitoTracker、JC-1、TEM)、脂质过氧化(MDA)、GSH水平、铁含量、铁死亡相关蛋白(SLC7A11、GPX4)表达,并使用铁死亡抑制剂Fer-1进行救援实验。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM/F12培养基 | Biological Industries | -- |
| 胎牛血清 | Thermo Fisher Scientific | 10091148 | |
| 青霉素-链霉素 | Thermo Fisher Scientific | 15070063 | |
| 100毫米培养皿 | Corning | -- | |
| 药物处理 | 棕榈酸 | Sigma-Aldrich | P5585 |
| 杜氏磷酸盐缓冲液 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| 细胞活力检测 | MTT溶液 | Beyotime | C0009S |
| 二甲基亚砜 | Coolaber | -- | |
| LDH检测试剂盒 | Beyotime | C0017 | |
| 增殖检测 | EdU染色试剂盒 | Beyotime | C0071S |
| 细胞核染色 | DAPI溶液 | Solarbio | C0065 |
| 侵袭实验 | 结晶紫 | Beyotime | C0121 |
| 细胞周期分析 | 细胞周期分析试剂盒 | Meilunbio | MA0334 |
| 凋亡检测 | Annexin V-FITC溶液 | Solarbio | CA1020 |
| HE染色 | HE染色试剂盒 | Solarbio | G1120 |
| TUNEL染色 | TUNEL染色试剂盒 | Servicebio | G1502 |
| 免疫荧光封闭 | 牛血清白蛋白 | Solarbio | SW3015 |
| RNA提取 | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| RNA测序 | NEBNext Ultra RNA文库制备试剂盒 | New England Biolabs | -- |
| RNA质量检测 | Agilent 2100生物分析仪 | Agilent Technologies | -- |
| ROS检测 | DCFH-DA染色试剂盒 | Beyotime | S0033 |
| 线粒体功能检测 | MitoTracker染色溶液 | Beyotime | C1049 |
| 线粒体膜电位检测 | JC-1溶液 | Beyotime | C2006 |
| 铁死亡检测 | GSH检测试剂盒 | Beyotime | S0052 |
| MDA检测试剂盒 | Beyotime | S0131 | |
| 铁含量检测 | 铁含量检测试剂盒 | Solarbio | BC5315 |
| DNA损伤检测 | 抗γH2A抗体 | Abcam | ab81299 |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Transgen | DE101 |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Solarbio | PC0020 |
| SDS-PAGE | SDS-PAGE凝胶 | Solarbio | P1200 |
| 转膜 | PVDF膜 | Millipore | PVH00010 |
| 通透处理 | Triton X-100溶液 | Solarbio | T8200 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系:Ishikawa;培养基:DMEM/F12;血清:10% FBS;抗生素:100 U/mL青霉素-链霉素;培养条件:37°C,5% CO2 阅读提示:Materials and methods 2.2 Cell culture |
| PA处理 | PA浓度:200 μM;处理时间:24小时(体外) 阅读提示:Materials and methods 2.3 PA treatment and cell proliferation assessment;Results 3.1 |
| 体内异种移植模型 | 动物品系:BALB/c裸鼠,雌性,5周龄;细胞接种量:5×10^5;给药剂量:50 mg/kg PA,皮下注射,每两天一次;治疗时间:15天;对照组:等量生理盐水 阅读提示:Materials and methods 2.11 Animals and In vivo xenograft model |
| 铁死亡验证 | PA浓度:200 μM;Fer-1浓度:10 μM;检测指标:ROS、MitoTracker、JC-1、MDA、GSH、铁含量、SLC7A11、GPX4 阅读提示:Materials and methods 2.17 Ferroptosis assessment;Results 3.4 |