化合物合成与结构表征
合成新型吡咯烷-查尔酮衍生物并确认其结构
合成了24个新型衍生物,并利用1H NMR、13C NMR和HR-MS进行表征。
A novel pyrrolidine-chalcone derivative exhibits synergistic anti-cervical cancer activity by dual-targeting MDM2-p53 axis and ferroptosis pathway.
包含体外细胞活性筛选、细胞功能实验、蛋白表达检测、转录组测序及分子模拟,但缺乏动物体内实验验证。
HeLa宫颈癌细胞系 SiHa宫颈癌细胞系 C-33A宫颈癌细胞系 H8正常宫颈上皮细胞系
细胞系:HeLa、SiHa、C-33A、H8(来源:Procell Life Science and Technology Co., Ltd.) 处理浓度:B1处理浓度0.11、0.22、0.44 μM(B1-L/M/H) 处理时间:凋亡实验48 h,周期实验24 h,迁移/侵袭实验48 h 阳性对照:顺铂(Cisplatin)、Nutlin-3a 统计:至少三次独立重复,p < 0.05
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
合成新型吡咯烷-查尔酮衍生物并确认其结构
合成了24个新型衍生物,并利用1H NMR、13C NMR和HR-MS进行表征。
筛选对宫颈癌细胞具有高效、低毒的化合物
采用CCK-8法测定化合物对HeLa、SiHa、C-33A和H8细胞的IC50值,并与顺铂、Nutlin-3a和查尔酮比较。
验证B1是否诱导HeLa细胞凋亡
Annexin V/FITC和PI双染后流式细胞术分析凋亡率。
检测B1对细胞周期分布的影响
PI/RNase染色后流式细胞术分析G2/M期细胞比例。
评估B1对HeLa细胞迁移和侵袭能力的影响
划痕愈合实验检测迁移,Matrigel Transwell实验检测侵袭。
预测B1与MDM2的结合模式及稳定性
通过AutoDock Vina和Gromacs进行对接和100 ns的分子动力学模拟。
验证B1对MDM2和p53蛋白表达的影响
Western blot检测MDM2和p53的表达,免疫荧光检测MDM2荧光强度。
揭示B1处理后的差异表达基因及相关通路
对B1处理的HeLa细胞进行mRNA-seq,分析DEGs、GO和KEGG富集,并进行GSEA。
验证B1是否诱导铁死亡
检测GSH、MDA、Fe2+水平、ROS和线粒体膜电位,以及SLC7A11和GPX4蛋白表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 化学合成 | Bide Pharmatech有限公司 | -- | -- |
| 天津新博特化工有限公司 | -- | -- | |
| 细胞培养 | 武汉普诺赛生命科技有限公司 | -- | -- |
| 细胞凋亡实验 | 膜联蛋白V/异硫氰酸荧光素 | BD Biosciences Pharmingen | -- |
| 碘化丙啶 | BD Biosciences Pharmingen | -- | |
| 细胞周期实验 | PI/RNase染色液 | BD Biosciences Pharmingen | -- |
| 侵袭实验 | 基质胶 | Corning | -- |
| Western blot | 抗MDM2抗体 | bsm | 62661R |
| 抗p53抗体 | Servicebio | GB15627 | |
| 抗GPX4抗体 | Abmart | T56959 | |
| 抗SLC7A11抗体 | Abmart | T57046 | |
| 二抗 | Proteintech | SA00001-2 | |
| ECL Prime蛋白质印迹检测试剂盒 | GE Healthcare | -- | |
| Image Quant LAS 500成像系统 | GE Healthcare | -- | |
| 铁死亡标志物检测 | MDA检测试剂盒 | Servicebio | GM1134 |
| Fe2+比色检测试剂盒 | Servicebio | GM3052 | |
| 还原型GSH检测试剂盒 | Servicebio | GM1139 | |
| 分子模拟 | AutoDock Vina 1.5.6 | -- | -- |
| Gromacs 2022 | -- | -- | |
| PyMOL | -- | -- | |
| 转录组测序 | Illumina NovaSeq 6000测序仪 | Illumina | -- |
| DNBSEQ-T7测序仪 | MGI | -- | |
| 数据处理 | fastp v0.23.2 | -- | -- |
| HISAT2 v2.2.1 | -- | -- | |
| StringTie v2.2.1 | -- | -- | |
| DESeq2 v1.40.0 | -- | -- | |
| SPSS 26 | IBM | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源和培养条件(培养基、血清浓度、CO2浓度) 阅读提示:见Experimental section 4.2.1 Cell culture,但培养基类型和FBS浓度未明确说明。 |
| 抗增殖活性 | 细胞接种密度、处理浓度范围、处理时间、CCK-8孵育时间 阅读提示:见Experimental section 4.2.2 Antiproliferative activity。 |
| 细胞凋亡 | 处理浓度、处理时间、Annexin V/PI染色步骤 阅读提示:见Experimental section 4.2.3 Cell apoptosis。 |
| 细胞周期 | 处理浓度、处理时间、PI/RNase染色步骤 阅读提示:见Experimental section 4.2.4 Cell cycle arresting effect。 |
| 迁移和侵袭 | 处理浓度、观察时间点、Matrigel稀释比例、细胞数量 阅读提示:见Experimental section 4.2.5 Migration effect 和4.2.6 Invasion effect。 |
| Western blot | 抗体信息(品牌、货号、稀释比例)、蛋白裂解方法、电泳和转膜条件 阅读提示:见Experimental section 4.2.8 Western blotting assay。 |
| 转录组测序 | 处理浓度、处理时间、测序平台、分析参数 阅读提示:见Experimental section 4.2.9 Transcriptome sequencing analysis。 |
| 铁死亡标志物 | 处理浓度、处理时间、试剂盒信息 阅读提示:见Experimental section 4.2.10 MDA, Fe2+, and GSH assays。 |