化合物设计与合成
设计并合成靶向GPX4的疏水标签降解剂RS-1,以期通过降解GPX4诱导铁死亡。
基于RSL3与GPX4的分子对接,在溶剂暴露区连接C4烷基连接子和二苯基丁胺疏水标签,经6步反应合成RS-1,并通过NMR、MS、IR等表征。
RS-1: A Novel Hydrophobic Tagging GPX4 Degrader Inducing Ferroptosis and Suppressing Tumor Growth.
包含体外细胞实验(GPX4降解、细胞活力、ROS/MDA检测)、机制验证(MG-132、Fer-1)及体内4T1异种移植瘤模型,多个证据层级且明确功能与机制验证。
HT1080纤维肉瘤细胞 A549肺癌细胞 4T1小鼠乳腺癌细胞 4T1同种异体移植瘤小鼠模型
GPX4降解DC50为8.9 nM,在100 nM时降解>75% MG-132共处理完全挽救RS-1诱导的GPX4降解 Fer-1预处理使RS-1的细胞毒性降低约10倍 体内实验剂量:16、33、66 μmol/kg,每日腹腔注射,连续10天 细胞活力实验:HT1080、A549、4T1细胞以4000/孔接种于96孔板,处理48小时
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
设计并合成靶向GPX4的疏水标签降解剂RS-1,以期通过降解GPX4诱导铁死亡。
基于RSL3与GPX4的分子对接,在溶剂暴露区连接C4烷基连接子和二苯基丁胺疏水标签,经6步反应合成RS-1,并通过NMR、MS、IR等表征。
验证RS-1是否诱导GPX4降解及其降解动力学和机制。
在HT1080细胞中,用不同浓度RS-1处理24小时,通过Western blot检测GPX4水平;用0.1 μM RS-1处理不同时间检测降解动力学;用MG-132共处理验证蛋白酶体依赖性。
评估RS-1对肿瘤细胞的增殖抑制作用,并确认铁死亡是主要死亡机制。
采用MTT法测定RS-1在HT1080、A549、4T1细胞中的IC50;用Fer-1预处理2小时,观察对RS-1细胞毒性的影响。
检测RS-1处理后细胞内ROS和MDA水平,验证铁死亡特征。
用DCFH-DA探针通过流式细胞术检测ROS水平;用MDA检测试剂盒测定MDA含量。
在小鼠4T1同种异体移植瘤模型中评价RS-1的抗肿瘤活性和耐受性。
将4T1细胞皮下接种至BALB/c小鼠乳腺脂肪垫,待肿瘤体积约25 mm3时,分组给予溶剂、RSL3(66 μmol/kg)或RS-1(16、33、66 μmol/kg)每日腹腔注射,连续10天,测量肿瘤体积和体重。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI 1640培养基 | Pricella | PM15010A |
| 胎牛血清 | Pricella | -- | |
| 细胞活力实验 | MTT | Servicebio | GC307004 |
| Western blot | RIPA裂解液 | Servicebio | G2002 |
| BCA蛋白定量试剂盒 | Servicebio | G026-200T | |
| SDS-PAGE凝胶 | Servicebio | G2032-10 | |
| PVDF转印膜 | Servicebio | WGPVDF22 | |
| 脱脂奶粉 | Servicebio | GC310001 | |
| TBST缓冲液 | Servicebio | G0004 | |
| ECL化学发光试剂 | Servicebio | G2014 | |
| 抗β-actin抗体 | Abcam | ab23787 | |
| 抗GPX4抗体 | Abcam | ab41787 | |
| GPX4降解实验 | MG-132 | MedChemExpress | HY-13259 |
| 细胞活力实验 | Ferrostatin-1 | MedChemExpress | HY-100579 |
| 活性氧检测 | DCFH-DA荧光探针 | Beyotime | S0033S |
| MDA检测 | 脂质过氧化MDA检测试剂盒 | Nanjing Jiancheng | A003-4-1 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源、培养基种类(RPMI 1640)、血清浓度(10%)、培养条件(37°C,5% CO2) 阅读提示:Materials and Methods, Section 5.3 |
| GPX4降解实验 | 细胞接种密度(5×10^5/孔于6孔板)、RS-1浓度梯度、处理时间(24 h)、MG-132浓度和共处理时间(18 h) 阅读提示:Materials and Methods, Section 5.5; Results Section 2.2; Figure 3 |
| 细胞活力实验 | 细胞接种密度(4000/孔于96孔板)、RS-1浓度范围、处理时间(48 h)、MTT浓度(5 mg/mL) 阅读提示:Materials and Methods, Section 5.4 |
| ROS检测 | RS-1浓度和处理时间(48 h)、DCFH-DA浓度(10 μM)和孵育时间(30 min) 阅读提示:Materials and Methods, Section 5.6; Figure 5A |
| MDA检测 | RS-1浓度(0.5、1.0、2.0 μM)和处理时间(24 h) 阅读提示:Materials and Methods, Section 5.7; Figure 5B |
| 体内动物实验 | 小鼠品系和性别(雌性BALB/c)、年龄(6-8周)、肿瘤细胞接种量(5×10^5)、给药剂量(16、33、66 μmol/kg)和给药频率(每日腹腔注射,连续10天)、分组、样本量(n=10) 阅读提示:Materials and Methods, Section 5.9 |