构建ABA诱导的EV装载系统
筛选能够实现ABA依赖的货物蛋白装载的EV支架蛋白
将PYL1与候选支架蛋白(BASP1、CD9、PTGFRN、PTGFRNΔ687)融合,将ABI1与货物蛋白(EGFP、荧光素酶、Cas9)融合,共转染HEK293T细胞,并进行ABA处理。
ABA-Induced Cargo Proteins Loading in Extracellular Vesicles for Gene Editing.
包含体外细胞实验、EV表征(TEM、NTA、Western blot)、功能验证(荧光素酶活性、EGFP递送、Cas9基因编辑)及多重复统计分析,证据层级独立且完整。
HEK293T细胞(EV生产者) HeLa细胞(受体细胞) HepG2细胞(受体细胞)
ABA浓度:100 μM 载体构建:BASP1-PYL1融合蛋白 EV分离方法:PEG沉淀和超滤 递送比例:颗粒与细胞比10,000:1 统计方法:独立实验三次,单样本t检验
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
筛选能够实现ABA依赖的货物蛋白装载的EV支架蛋白
将PYL1与候选支架蛋白(BASP1、CD9、PTGFRN、PTGFRNΔ687)融合,将ABI1与货物蛋白(EGFP、荧光素酶、Cas9)融合,共转染HEK293T细胞,并进行ABA处理。
确认ABA装载不影响EV的基本特性
采用PEG沉淀或超滤法分离EV,通过TEM观察形态、NTA分析粒径、Western blot检测标志物(CD63、syntenin-1、CD9)和阴性标志物(Calnexin)。
定量评估ABA诱导的货物装载效率
通过Western blot分析EV中货物蛋白和支架蛋白的表达,计算货物/支架蛋白比值和货物/EV标志物比值,比较ABA处理与对照的差异。
确认装载的货物蛋白具有生物活性并能递送至受体细胞
将装载EGFP的EV与HepG2细胞共孵育,观察荧光信号;将装载Cas9的EV与预先转染sgRNA的HeLa细胞共孵育,检测TERT基因编辑效率。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 质粒构建 | BamHI限制性内切酶 | Takara | 1010 |
| HindIII限制性内切酶 | Takara | 1615 | |
| T4 DNA连接酶 | Thermo Fisher | EL0011 | |
| Q5高保真DNA聚合酶 | NEB | M0491 | |
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | ProCell | PM150210 |
| 胎牛血清 | Sigma | 12003C | |
| 青霉素-链霉素 | Gibco | 15140122 | |
| 胰蛋白酶-EDTA | Sigma | T4049 | |
| Lipo8000转染试剂 | Beyotime | C0533 | |
| 药物处理 | 脱落酸 | Beyotime | BS951 |
| EV分离 | 聚乙二醇8000 | Sigma | 92897 |
| 100 kDa截留分子量超滤管 | Millipore | UFC910096 | |
| 蛋白提取 | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| 蛋白酶抑制剂混合物 | Roche | 11697498001 | |
| 蛋白定量 | BCA蛋白定量试剂盒 | Biosharp | BL521A |
| Western blot | ECL化学发光试剂盒 | Biosharp | BL520A |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| 凝胶成像系统(Tanon 5200) | Tanon | -- | |
| NTA | ZetaView PMX 110纳米颗粒分析仪 | Particle Metrix | -- |
| 功能验证 | 双荧光素酶报告基因检测系统 | Kaiji | KGE3308 |
| PKH26细胞膜荧光染料 | Beyotime | C2071M | |
| 显微镜 | 共聚焦激光扫描显微镜 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与转染 | HEK293T细胞系(ATCC CRL-3216),转染试剂Lipo8000,DNA与转染试剂比例1:0.8,质粒共转染比例1:1 阅读提示:Section 2.2 Cell Culture, Transient Transfection and ABA-Induced EV Production |
| ABA诱导 | ABA浓度100 μM,处理时间48小时,对照为乙醇(vehicle) 阅读提示:Section 2.2 Cell Culture, Transient Transfection and ABA-Induced EV Production |
| EV分离 | PEG沉淀或超滤法,超滤使用100 kDa MWCO,离心条件(6500×g, 1h) 阅读提示:Section 2.3 Extracellular Vesicles Isolation and Purification |
| EV递送 | 受体细胞HeLa和HepG2,EV与细胞比例10,000:1,孵育时间24小时(EGFP)或48小时(Cas9) 阅读提示:Section 2.7 EV Delivery and Functional Assay |
| 统计分析 | 三次独立实验,单样本t检验,p<0.05为显著 阅读提示:Section 2.8 Statistical Analysis |