体外验证SIX2对小胶质细胞极化的影响
探究SIX2是否调控LPS诱导的BV2小胶质细胞M1/M2极化。
在BV2细胞中敲低或过表达SIX2,并用LPS刺激24小时,检测M1/M2标志物表达、细胞形态及细胞因子分泌。
SIX2-Mediated Microglial M2 Polarization and Exosomal miR-3470b Delivery Protect Dopaminergic Neurons in Parkinson's Disease.
涵盖细胞和动物模型,包含功能获得/丧失验证、分子机制(ChIP、RNA-seq)、外泌体功能和行为学测试等多个证据层级。
BV2小胶质细胞 MES23.5多巴胺能细胞 MPTP诱导的急性帕金森病小鼠模型 LPS诱导的神经炎症小鼠模型
BV2细胞中SIX2敲低和过表达,LPS处理浓度100 ng/mL,时间24小时 MPTP小鼠模型:MPTP剂量30 mg/kg/day,腹腔注射,连续5天 外泌体处理浓度10 μg/mL AAV-SIX2注射坐标:前囟后-3.3 mm,侧方1.2 mm,腹背-4.6 mm Cx3cr1-CreERT2小鼠使用他莫昔芬(0.2 mg/g体重)诱导重组
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
探究SIX2是否调控LPS诱导的BV2小胶质细胞M1/M2极化。
在BV2细胞中敲低或过表达SIX2,并用LPS刺激24小时,检测M1/M2标志物表达、细胞形态及细胞因子分泌。
检测SIX2调控的小胶质细胞是否通过条件培养基影响多巴胺能细胞的活力。
将LPS处理的BV2细胞条件培养基施加到MES23.5细胞24小时,通过TUNEL和CCK-8检测细胞凋亡和活力。
在LPS诱导的神经炎症模型中验证SIX2过表达是否促进小胶质细胞M2极化并抑制炎症。
在Cx3cr1-CreERT2小鼠中通过AAV-SIX2特异性过表达小胶质细胞SIX2,注射LPS后检测小胶质细胞数量和M1/M2标志物表达。
确定SIX2是否直接结合DDIT4启动子并调控其表达,以及DDIT4在M2极化中的必要性。
通过RNA-seq和ChIP-qPCR确定SIX2结合位点,并利用siRNA沉默DDIT4检测其对SIX2介导的极化效应的影响。
验证DDIT4是否通过抑制mTOR激活自噬来促进M2极化。
检测DDIT4敲低对mTOR磷酸化和自噬标志物LC3、P62的影响,并使用自噬抑制剂3-MA和BafA1验证自噬的必要性。
探究SIX2过表达的小胶质细胞是否通过外泌体保护多巴胺能细胞。
使用GW4869抑制外泌体,分离外泌体并表征,将外泌体与MES23.5细胞共培养,检测细胞活力和凋亡。
确定外泌体中关键的miRNA及其下游靶基因。
通过miRNA测序筛选差异miRNA,验证miR-3470b;预测并验证GREM1为miR-3470b的靶基因。
在体内验证外泌体miR-3470b是否通过抑制GREM1保护多巴胺能神经元和运动功能。
向小鼠SNpc注射sh-GREM1慢病毒,尾静脉注射外泌体,并腹腔注射MPTP,检测TH+神经元数量, 相关蛋白表达和行为学。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | 高糖DMEM培养基 | KeyGEN Bio TECH | -- |
| F12培养基 | KeyGEN Bio TECH | -- | |
| 胎牛血清 | Clark | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Beyotime Biotechnology | -- | |
| 药物处理 | 脂多糖 | Sigma-Aldrich | L6529 |
| 3-甲基腺嘌呤 | MCE | HY-19312 | |
| 巴弗洛霉素A1 | MCE | HY-100558 | |
| 细胞培养 | 嘌呤霉素 | Meilunbio | -- |
| 动物实验 | 他莫昔芬 | MCE | -- |
| 1-甲基-4-苯基-1,2,3,6-四氢吡啶 | -- | -- | |
| 外泌体分离 | Optima XPN-100超速离心机 | Beckman Coulter | -- |
| 外泌体表征 | Zetaview纳米颗粒分析仪 | -- | -- |
| Tecnai G2 Spirit Twin透射电子显微镜 | -- | -- | |
| 外泌体标记 | PKH26红色荧光染料 | Sigma-Aldrich | -- |
| RT-qPCR | TIANGEN试剂盒 | TIANGEN | -- |
| SYBR Green快速qPCR预混液 | Vazyme | -- | |
| 蛋白质提取 | RIPA裂解液 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 蛋白酶和磷酸酶抑制剂混合物 | Vicmed | -- | |
| 蛋白质分离 | PAGE凝胶快速制备试剂盒 | Yeasen | -- |
| 蛋白质转移 | 硝酸纤维素膜 | PALL/Bolida | -- |
| 封闭 | 脱脂牛奶 | Solarbio | -- |
| Western blot | Odyssey成像系统 | LI-COR | -- |
| ELISA | IL-10和IL-6 ELISA试剂盒 | Elabscience | E-EL-M0046c |
| 细胞活力检测 | CCK-8试剂盒 | Vicmed | -- |
| 酶标仪 | Synergy 2 | -- | |
| TUNEL | TUNEL凋亡检测试剂盒 | Vazyme | -- |
| ChIP | 染色质免疫沉淀试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| 抗SIX2抗体 | Proteintech | 11,562-1-AP | |
| 兔IgG对照抗体 | Proteintech | 30,000-0-AP | |
| 磁珠 | MCE | HY-K0204 | |
| 双荧光素酶报告基因 | 双荧光素酶报告基因检测试剂盒 | Beyotime Biotechnology | -- |
| pGL3 Basic荧光素酶报告质粒 | Sangon Biotech | -- | |
| 免疫荧光 | 抗Iba-1抗体 | Asis Biofarm | OB-RB029 |
| 抗TNF-α抗体 | Santa Cruz | sc-24,723 | |
| 抗CD206抗体 | Proteintech | 60,143-1-Ig | |
| 抗酪氨酸羟化酶抗体 | Proteintech | 25,859-1-AP | |
| 山羊抗兔二抗 | Abcam | ab150080 | |
| 山羊抗小鼠二抗 | Abcam | ab150113 | |
| Western blot | 抗p62抗体 | Proteintech | 18,420-1-AP |
| 抗CD63抗体 | Proteintech | 60,232-1-Ig | |
| 抗CD9抗体 | Proteintech | 60,232-1-Ig | |
| 抗酪氨酸羟化酶抗体 | Proteintech | 25,859-1-AP | |
| 抗TSG101抗体 | Proteintech | 28,283-1-AP | |
| 抗GRASP65抗体 | Proteintech | 10,747-2-AP | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66,009-1-Ig | |
| 抗GREM1抗体 | Affinity Biosciences | DF15419 | |
| 抗TGF-β抗体 | biorbyt | orb89934 | |
| 抗SIX2抗体 | Abcam | ab111827 | |
| 抗mTOR抗体 | Abcam | ab32028 | |
| 抗磷酸化mTOR抗体 | Abcam | ab109268 | |
| 抗DDIT4抗体 | ABclonal | A14135 | |
| 抗iNOS抗体 | Cell Signaling Technology | 13,120 | |
| 抗ARG-1抗体 | Cell Signaling Technology | 93,668 | |
| 抗LC3A/B抗体 | Cell Signaling Technology | 4108 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养与小胶质细胞极化实验 | BV2细胞培养条件(DMEM高糖或F12含10% FBS)、LPS浓度(100 ng/mL)、处理时间(24小时)、SIX2敲低/过表达方法(shRNA/过表达载体) 阅读提示:Methods 4.5、4.7、4.8,图1图注 |
| 外泌体分离与功能实验 | 外泌体分离方法(超速离心)、外泌体浓度(10 μg/mL)、GW4869浓度(10 μM)、PKH26标记方法 阅读提示:Methods 4.9、4.10,图5图注 |
| 动物模型构建与处理 | Cx3cr1-CreERT2小鼠他莫昔芬剂量(0.2 mg/g体重)、AAV注射体积(300 nL)、LPS剂量(0.25 mg/kg)、MPTP剂量(30 mg/kg/day)及给药方式 阅读提示:Methods 4.2、4.3、4.4,图2A和图8A |
| 机制分析 | ChIP引物序列(-901 bp至-886 bp和-618 bp至-603 bp)、3-MA浓度(5 mM)、BafA1浓度(100 nM)、miR-3470b靶点序列 阅读提示:Methods 4.16,图3C,图4D |
| 行为学检测 | 转棒实验初始速度5 rpm、加速至40 rpm、爬杆实验杆高50 cm、训练时间 阅读提示:Methods 4.18、4.19,图8G,H |