临床样本关联分析
评估STARD10表达与脂肪变性及IRI严重程度的相关性
收集10例正常和10例脂肪变性供肝移植受者的活检样本,分析STARD10表达水平与移植后肝功能指标、组织学损伤评分的相关性,并利用公共scRNA-seq数据集分析其细胞分布。
Targeting STARD10 Alleviates Steatotic Liver Injury by Suppressing YBX1/ACSL1-Mediated Ferroptosis.
包含临床样本、小鼠模型、细胞实验、多组学分析及功能验证,明确验证了机制链路。
人脂肪变性供肝样本 HFD诱导的MASLD小鼠模型 AML12细胞(PA诱导脂肪变性) STARD10敲除(SKO)小鼠
STARD10表达水平与人供肝脂肪变性和移植后IRI严重程度的相关性 AAV8-shSTARD10敲低效率(8周后显著降低) Fer-1(5 mg/kg)给药方案(缺血前1小时腹腔注射) PA诱导AML12细胞脂肪变性的浓度(300 μM)和时间(24小时) RSL3(2 μM)和Fer-1(4 μM)处理浓度
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估STARD10表达与脂肪变性及IRI严重程度的相关性
收集10例正常和10例脂肪变性供肝移植受者的活检样本,分析STARD10表达水平与移植后肝功能指标、组织学损伤评分的相关性,并利用公共scRNA-seq数据集分析其细胞分布。
建立HFD诱导的MASLD模型并诱导肝IRI,模拟脂肪肝移植情境
C57BL/6小鼠喂食HFD 18周建立脂肪肝模型,随后进行1小时缺血和6或24小时再灌注,评估肝损伤。
验证STARD10在脂肪肝IRI中的功能作用
通过AAV8-shSTARD10敲低或AAV8-OE-STARD10过表达,然后诱导IRI,评估肝损伤、炎症、ROS和凋亡。
探究STARD10敲低后的脂质重塑和转录变化,寻找潜在机制
对STARD10敲低和对照小鼠肝脏进行非靶向脂质组学和转录组学测序,分析差异脂质和差异表达基因。
验证STARD10通过YBX1-ACSL1调控铁死亡
在AML12细胞中敲低/过表达STARD10,进行PA诱导脂肪变性,HR处理,检测铁死亡相关表型,并通过co-IP、ChIP-qPCR等验证分子机制。
验证ACSL1在STARD10敲除保护效应中的必要性
使用SKO小鼠,通过AAV8过表达ACSL1,诱导IRI,评估肝损伤和铁死亡指标。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | DMEM培养基 | Gibco | -- |
| 细胞活力检测 | CellTiter-Glo发光法细胞活力检测试剂盒 | Promega | -- |
| 细胞死亡检测 | SYTOX Orange染料 | Thermo | -- |
| 细胞核染色 | Hoechst染料 | Beyotime | -- |
| 铁离子检测 | 铁离子检测试剂盒 | Abcam | -- |
| MDA检测 | 脂质过氧化MDA检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| 脂质过氧化检测 | C11-BODIPY 581/591探针 | Thermo | -- |
| ROS检测 | 超氧阴离子ROS检测试剂盒 | Beyotime | -- |
| DCFH-DA探针 | -- | -- | |
| 凋亡检测 | TUNEL检测试剂盒 | Servicebio | -- |
| Annexin V-APC/7-AAD凋亡检测试剂盒 | Procell | -- | |
| 生化分析 | 日立7180全自动生化分析仪 | Hitachi | -- |
| 成像 | 奥林巴斯显微镜 | Olympus | -- |
| 蔡司LSM800共聚焦显微镜 | Zeiss | -- | |
| 流式细胞术 | 索尼MA900流式细胞分选仪 | Sony | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 小鼠模型 | 小鼠品系、性别、年龄(C57BL/6,雄性,6-8周龄);HFD喂养时间(18周);缺血再灌注参数(缺血1小时,再灌注24小时) 阅读提示:Methods: Mice; Results: 图2 |
| AAV处理 | AAV8-shSTARD10和AAV8-OE-ACSL1的滴度(1.4×10^12和1.8×10^12 vg/ml);注射时间(8周前) 阅读提示:Methods: AAV treatment |
| 细胞模型 | AML12细胞培养条件;PA浓度(300 μM)和处理时间(24小时);缺氧复氧时间(缺氧5小时,复氧8小时) 阅读提示:Methods: Steatotic cell HR model; Results: 图6 |
| 药物处理 | Fer-1剂量(5 mg/kg腹腔注射;细胞实验4 μM);RSL3浓度(2 μM);给药时机(缺血前1小时) 阅读提示:Methods: 药物处理相关;Results: 图5, 图S2, 图S4 |
| 分子检测 | ChIP-qPCR中YBX1抗体;co-IP中STARD10和YBX1抗体;Western blot抗体信息(见表S5) 阅读提示:Methods: ChIP-qPCR, Co-immunoprecipitation; Table S5 |