建立恩杂鲁胺耐药细胞模型
在体外模拟前列腺癌恩杂鲁胺耐药的发展过程。
将LNCaP和C4-2细胞逐步暴露于递增浓度的恩杂鲁胺(初始5μM,每10代增加5μM,直至40μM并传代10次),获得耐药细胞系LNCaP-EnzR和C4-2-EnzR。
UHRF1 regulates AR ubiquitination to promote the loss of AR signaling and enzalutamide resistance in progression of prostate cancer.
包含体外细胞模型(LNCaP、C4-2及耐药株)、体内异种移植瘤模型、临床样本和公共数据库分析,并有功能验证(敲低/过表达)和机制验证(泛素化、Co-IP)。
LNCaP细胞系及耐药株LNCaP-EnzR C4-2细胞系及耐药株C4-2-EnzR C4-2-EnzR异种移植瘤模型(裸鼠) 临床前列腺癌患者样本及公共数据库队列
细胞系LNCaP、C4-2、22Rv1、PC3,耐药株LNCaP-EnzR和C4-2-EnzR的建立及培养条件 恩杂鲁胺处理浓度(5μM递增至40μM)和时间(7天) UHRF1敲低或过表达对AR蛋白和mRNA水平的影响 MG132处理(48小时)对AR降解的影响 体内实验中恩杂鲁胺给药方式(腹腔注射)和剂量(文中未明确说明)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
在体外模拟前列腺癌恩杂鲁胺耐药的发展过程。
将LNCaP和C4-2细胞逐步暴露于递增浓度的恩杂鲁胺(初始5μM,每10代增加5μM,直至40μM并传代10次),获得耐药细胞系LNCaP-EnzR和C4-2-EnzR。
探究UHRF1在耐药细胞中的表达水平及其与AR信号和神经内分泌标志物的关系。
通过Western blot和qPCR检测耐药细胞中AR、UHRF1、SYP、NSE的表达,并利用RNA-seq和主成分分析比较转录组差异。
验证UHRF1是否维持细胞对恩杂鲁胺的耐药性。
在LNCaP-EnzR和C4-2-EnzR细胞中敲低UHRF1,通过CCK-8和克隆形成实验检测细胞活力,并分析凋亡和周期变化。
确定UHRF1是否通过泛素-蛋白酶体途径降解AR。
在细胞中敲低或过表达UHRF1,检测AR蛋白和mRNA水平;使用MG132抑制蛋白酶体,评估AR降解;通过Co-IP检测UHRF1与AR相互作用及AR泛素化水平;使用环己酰亚胺追踪AR半衰期。
阐明UHRF1调控的转录程序及其对谱系可塑性的作用。
RNA-seq分析UHRF1敲低细胞转录组,鉴定差异表达基因,进行GO/KEGG通路富集和GSEA;检测UHRF1敲低或过表达对AR下游靶基因及神经内分泌/干性标志物的影响;用双氢睾酮刺激评估AR通路活性。
在动物模型中验证UHRF1敲低联合恩杂鲁胺对耐药肿瘤的抑制作用。
将C4-2-EnzR NC和shUHRF1细胞皮下注射裸鼠,建立异种移植瘤模型,分组处理后测量肿瘤体积和重量,并通过免疫组化检测Ki67和UHRF1表达。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | RPMI-1640培养基 | -- | -- |
| 胎牛血清 | ExCellBio | -- | |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| 药物处理 | 恩杂鲁胺 | MedChemExpress | -- |
| MG132 | MedChemExpress | -- | |
| 质粒构建 | Q5®定点突变试剂盒 | -- | -- |
| 细胞活力实验 | CCK-8试剂盒 | -- | -- |
| 酶标仪 | Tecan | -- | |
| 克隆形成实验 | 结晶紫 | -- | -- |
| 免疫共沉淀 | 琼脂糖蛋白A+G | Santa Cruz Biotechnology | -- |
| Western blot | AR抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-7305 |
| AR抗体 | Cell Signaling Technology | 5153S | |
| UHRF1抗体 | Proteintech | 21402-1-AP | |
| 泛素抗体 | ZenBio | 382766 | |
| NSE抗体 | Proteintech | 10149-1-AP | |
| SYP抗体 | Proteintech | 17785-1-AP | |
| Flag抗体 | Vazyme Biotech | RA1003-01 | |
| GAPDH抗体 | Santa Cruz Biotechnology | sc-47724 | |
| RNA提取和qRT-PCR | TRIzol试剂 | Invitrogen | -- |
| HiScript® III逆转录预混液 | Vazyme Biotech | -- | |
| 2×SYBR Green预混液 | Vazyme Biotech | -- | |
| RNA测序 | BGISEQ-500测序仪 | -- | -- |
| 小鼠实验 | 基质胶 | -- | -- |
| 免疫组织化学 | Ki67抗体 | Servicebio | GB111499 |
| 全景切片扫描仪 | 3DHISTECH | -- | |
| 流式凋亡分析 | FITC Annexin V凋亡检测试剂盒 | KeyGEN BioTECH | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(Procell)、培养条件(RPMI-1640或DMEM+10%FBS)、支原体检测阴性 阅读提示:Materials and methods: Cell lines and cell culture |
| 耐药细胞建立 | 恩杂鲁胺浓度递增方案(5μM起始,每10代增加5μM至40μM)、传代次数 阅读提示:Materials and methods: Generation of LNCaP-EnzR and C4-2-EnzR cells |
| 细胞活力实验 | 细胞接种密度(1×10³/well)、恩杂鲁胺浓度梯度、处理时间(24-72h)、CCK-8孵育时间(1-4h) 阅读提示:Materials and methods: Cell viability assay |
| Western blot | 抗体品牌、货号、稀释比例(AR、UHRF1、Ub、NSE、SYP、Flag、GAPDH) 阅读提示:Materials and methods: Western blot |
| 动物实验 | 小鼠品系(裸鼠)、周龄(4周)、性别(雄性)、细胞接种量(1×10⁶)、恩杂鲁胺给药方式(腹腔注射)和剂量(文中未明确说明) 阅读提示:Materials and methods: Mouse models |