检测eWAT中精氨酸甲基化与进食/禁食的关系
确定精氨酸甲基化是否随进食状态波动
收集小鼠在不同时间点的eWAT,通过Western blot检测MMA、ADMA、SDMA水平;对比自由进食、禁食36小时和再喂食3-6小时的情况;并检测SAMe浓度。
PRMT3-mediated post-translational adaptation to fasting regulates metabolic flexibility.
包含体外细胞实验、动物模型、人类样本和组学分析,并进行了功能验证和机制验证。
小鼠(C57BL/6N) 小鼠eWAT来源的原代脂肪细胞 HEK293T细胞 人类内脏脂肪组织
PRMT3蛋白水平在eWAT中的昼夜节律变化(Fig. 2d, e) SGC707抑制PRMT3对ADMA水平的影响(Fig. 2h, i) SLC25A1在eWAT中的表达受进食和胰岛素-pAKT信号调节(Fig. 6) Slc25a1脂肪细胞特异性敲除对高脂饮食诱导肥胖的影响(Fig. 8e-h) 16:8限时进食对eWAT中PRMT3和SLC25A1表达的影响(Fig. 7a, b)
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
确定精氨酸甲基化是否随进食状态波动
收集小鼠在不同时间点的eWAT,通过Western blot检测MMA、ADMA、SDMA水平;对比自由进食、禁食36小时和再喂食3-6小时的情况;并检测SAMe浓度。
鉴定在脂肪组织中响应营养状态的特异性PRMT
在分化的脂肪细胞中检测Prmt基因表达;在禁食小鼠中敲低或抑制候选PRMT(如PRMT1、PRMT3)并检测ADMA水平;用SGC707抑制PRMT3观察效果。
探究上游信号对PRMT3的调节机制
对禁食小鼠注射胰岛素或再喂食,检测PRMT3和pAKT水平;使用MK-2206抑制AKT验证其对PRMT3的调控;在293T细胞中过表达PRMT3并进行免疫共沉淀和磷酸化检测。
确定PRMT3在生理条件下的功能
给高脂饮食诱导的肥胖小鼠注射SGC707,测量体重、体成分、葡萄糖耐量、胰岛素敏感性、代谢率(VO2、RER)、脂肪组织重量和组织学;同时分离eWAT前脂肪细胞分化后检测糖酵解相关基因和代谢物。
明确PRMT3发挥功能的下游靶点
通过免疫共沉淀验证PRMT3与SLC25A1的相互作用;用ADMA抗体检测SLC25A1的甲基化;突变SLC25A1的R282/R285位点观察甲基化和相互作用的变化;通过CHX实验检测SLC25A1稳定性。
确证SLC25A1对代谢表型的影响
构建脂肪细胞特异性Slc25a1敲除小鼠,喂食高脂饮食,检测体重、糖代谢、能量消耗;分离原代脂肪细胞,用CTPI-2抑制SLC25A1,检测糖酵解能力;对eWAT进行RNA-seq分析差异表达基因。
探索TRF是否通过调节该轴发挥作用
对正常饮食或高脂饮食的小鼠实施16:8限时进食,检测eWAT中PRMT3、SLC25A1和ADMA水平;测量体重、代谢参数和糖耐量。
确证SLC25A1是PRMT3的关键下游效应因子
在DIO小鼠eWAT中通过AAV9-Fabp4-Slc25a1过表达SLC25A1,再给予SGC707处理,检测葡萄糖耐量、ΔRER和糖酵解相关基因。
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 动物实验 | SGC707 | MaoKang Biotechnology | S7832 |
| 细胞培养 | CTPI-2 | MaoKang Biotechnology | S2968 |
| MK-2206 2HCL | MaoKang Biotechnology | S1078 | |
| DMEM培养基 | Gibco | -- | |
| 胎牛血清 | Gibco | -- | |
| 青霉素/链霉素 | Gibco | 15140-122 | |
| 溶组织梭菌胶原酶 | Sigma-Aldrich | C0130-5G | |
| 胰岛素 | Pricella Biotechnology | PB180432 | |
| 地塞米松 | Sigma-Aldrich | D4902 | |
| IBMX | Sigma-Aldrich | 410957 | |
| 罗格列酮 | Sigma-Aldrich | 557366-M | |
| 三碘甲状腺原氨酸 | Sigma-Aldrich | T2877 | |
| 胰岛素 | WISENT Inc. | -- | |
| 罗格列酮 | Yeasen Biotechnology Co., Ltd. | -- | |
| 地塞米松 | Yeasen Biotechnology Co., Ltd. | -- | |
| RNA提取 | Trizol试剂 | Invitrogen | 15596026 |
| RT-qPCR | HiScript IV逆转录酶 | vazyme | R423-01 |
| ChamQ通用型SYBR qPCR预混液 | vazyme | Q711 | |
| QuantStudio 3实时荧光定量PCR系统 | Thermo Fisher Scientific | -- | |
| RNA-seq | NEBNext UltraTM RNA文库制备试剂盒 | NEB | -- |
| AMPure XP纯化系统 | Beckman Colter | -- | |
| Agilent Bioanalyzer 2100 | Agilent Technologies | -- | |
| 免疫沉淀 | 蛋白酶抑制剂混合物 | Bimake | B14001 |
| 磷酸酶抑制剂混合物 | Bimake | B15001 | |
| Western blot | BCA蛋白定量试剂盒 | Thermo Fisher Scientific | A55864 |
| PVDF膜 | Merck Millipore | IPVH00010 | |
| 脱脂牛奶 | BioFroxx | 1172GR500 | |
| SuperPico ECL化学发光试剂盒 | Vazyme | E422, E423 | |
| 抗单甲基精氨酸抗体 | Cell Signaling Technology | 8015 | |
| 抗ADMA抗体 | Cell Signaling Technology | 13522 | |
| 抗SDMA抗体 | Cell Signaling Technology | 13222 | |
| 抗磷酸化Akt抗体 | Cell Signaling Technology | 4060 | |
| 抗AKT抗体 | Cell Signaling Technology | 9272 | |
| 抗PRMT4抗体 | Cell Signaling Technology | 3379 | |
| 抗PRMT5抗体 | Cell Signaling Technology | 79998 | |
| 抗PKM1/2抗体 | Cell Signaling Technology | 3106 | |
| 抗ATGL抗体 | Proteintech | 55190-1-AP | |
| 抗HSL抗体 | Proteintech | 17333-1-AP | |
| 抗HSP90抗体 | Proteintech | 13171-1-AP | |
| 抗PRMT3抗体 | Proteintech | 17628-1-AP | |
| 抗β-肌动蛋白抗体 | Proteintech | 66009-1-Ig | |
| 抗GAPDH抗体 | Proteintech | 60004-1-Ig | |
| 抗α-微管蛋白抗体 | Proteintech | 66031-1-Ig | |
| 抗SLC25A1抗体 | Proteintech | 15235-1-AP | |
| 抗FLAG-M2抗体 | Sigma | F1804 | |
| 抗FLAG抗体 | Sigma | SAB4301135 | |
| 抗HA抗体 | Sigma | H6908 | |
| 抗MYC抗体 | Sigma | C3956 | |
| 抗MYC抗体 | Sigma | M4439 | |
| 山羊抗小鼠二抗 | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 115-035-003 | |
| 山羊抗兔二抗 | Jackson ImmunoResearch Laboratories | 711-035-152 | |
| 葡萄糖耐量试验 | Accu-Chek Active血糖仪 | Roche | -- |
| 代谢分析 | Oxymax间接测热系统 | Columbus Instruments | -- |
| 体成分分析 | Minispec LF50体成分分析仪 | Bruker | -- |
| 血液生化分析 | 临床生化分析仪 | Hitachi | 7100 |
| 靶向代谢组学 | 超高效液相色谱-三重四极杆质谱系统 | Waters | -- |
| ACQUITY-I UPLC / Xevo TQ-S | Waters | -- | |
| BB24均质器 | Next Advance, Inc. | -- | |
| Microfuge 20R离心机 | Beckman Colter, Inc. | -- | |
| Labconco浓缩仪 | Labconco | -- | |
| ECAR检测 | XF96分析仪 | Seahorse Bioscience | -- |
| 鱼藤酮 | Selleck Chemicals | S2348 | |
| 2-脱氧-D-葡萄糖 | Selleck Chemicals | S4701 | |
| 寡霉素A | Selleck Chemicals | S1478 | |
| 吲哚美辛 | Selleck Chemicals | S1723 | |
| 药物分析 | 高效液相色谱-四极杆飞行时间质谱系统 | Agilent | -- |
| Hypersil GOLD aQ C18色谱柱 | Thermo | -- | |
| ADMA定量 | 超高效液相色谱系统 | Shimadzu | -- |
| 亲水相互作用色谱柱 | Waters | -- | |
| AB Sciex 6500 QTrap质谱仪 | AB Sciex | -- | |
| d7-ADMA | Cambridge Isotope Laboratories | -- | |
| ADMA标准品 | targetMol | -- | |
| 细胞培养 | HEK293T细胞 | ATCC | CRL-3216 |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 动物模型与饮食 | 小鼠品系(C57BL/6N)、年龄(6-8周)、性别(雄性)、饮食类型(正常饮食或HFD)、饮食干预时间(如16:8 TRF的ZT13-21) 阅读提示:Methods 'Animal care and mouse strains' 和 'Feeding schedule and diets' |
| 药物处理 | SGC707剂量(30mg/kg)、给药方式(腹腔注射)、给药频率(隔日)、给药时间(ZT0或ZT12)、溶剂对照(DMSO) 阅读提示:Methods 'Drug treatments' |
| 细胞培养与分化 | 前脂肪细胞来源(eWAT或iWAT)、分化培养基成分(地塞米松、IBMX、胰岛素、罗格列酮)、分化时间 阅读提示:Methods 'HEK293T, primary adipocyte and porcine adipocyte culture' |
| 代谢表型分析 | GTT禁食时间(14小时)、ITT禁食时间(6小时)、葡萄糖剂量(2g/kg)、胰岛素剂量(0.03μg/kg)、间接测热法适应时间(24小时) 阅读提示:Methods 'Glucose and insulin tolerance test' 和 'Indirect calorimetry and body composition measurement' |
| 蛋白质检测 | 抗体来源和货号(如PRMT3、SLC25A1抗体)、蛋白提取裂解液成分、Western blot封闭液、ECL试剂盒 阅读提示:Methods 'Immunoblotting' |