检测PEAK1在PCa细胞中的表达及DTX长期处理的影响
评估PEAK1在PCa细胞中的基础表达水平,以及长期DTX处理是否影响其表达
通过RT-PCR和Western blot检测四种PCa细胞系(LNCaP、PC3、DU145、VCaP)中PEAK1 mRNA和蛋白表达;用1 nM DTX处理PC3和DU145细胞0、10、20、30天,检测PEAK1蛋白水平变化
PEAK1 promotes prostate cancer progression and docetaxel resistance by mediating the polarization of tumor-associated macrophages.
包含细胞增殖、迁移、EMT、药物敏感性、共培养、异种移植等多层级验证,并进行机制通路和体内T细胞浸润分析。
PCa细胞系(LNCaP、PC3、DU145、VCaP) THP-1巨噬细胞共培养模型 裸鼠异种移植模型
PC3和DU145细胞中PEAK1过表达和敲低模型的建立及验证 DTX处理浓度和时间(1 nM处理30天)对PEAK1表达的影响 共培养体系中PEAK1对THP-1细胞M2极化的影响 体内实验中DTX给药剂量(10 mg/kg, 每周一次)和肿瘤体积测量 PEAK1调控HIF-1α/STAT3/NF-κB通路激活的验证
提炼研究问题、关键发现与证据,快速把握文章的核心贡献。
按研究推进顺序梳理实验设计、验证步骤与关键观察。
评估PEAK1在PCa细胞中的基础表达水平,以及长期DTX处理是否影响其表达
通过RT-PCR和Western blot检测四种PCa细胞系(LNCaP、PC3、DU145、VCaP)中PEAK1 mRNA和蛋白表达;用1 nM DTX处理PC3和DU145细胞0、10、20、30天,检测PEAK1蛋白水平变化
验证PEAK1对PCa细胞增殖、迁移、EMT和体内生长的影响
在PC3和DU145细胞中转染PEAK1过表达质粒或siRNA,通过CCK-8、EdU染色、Transwell、Western blot检测细胞增殖、迁移和EMT标志物;通过裸鼠异种移植实验评估体内肿瘤生长
评估PEAK1对PCa细胞对DTX和恩杂鲁胺敏感性的影响
用CCK-8测定PC3和DU145细胞对DTX的IC50,LNCaP细胞对恩杂鲁胺的IC50;通过集落形成和Western blot检测凋亡相关蛋白(Bcl-2、Bax、c-Casp3)
探究PEAK1是否通过调节巨噬细胞极化影响PCa进展
使用Transwell共培养系统,将PEAK1-oe或NC PC3/DU145细胞与THP-1细胞共培养72小时,检测THP-1细胞M2标志物(IL-10、TGF-β、CCL2、Arg1、CD163、CD206)表达,及CCL2、IL-6分泌水平;并评估M2巨噬细胞对PCa细胞增殖、迁移和DTX敏感性的影响
验证PEAK1对肿瘤生长和免疫细胞浸润的影响
在裸鼠异种移植模型中,通过免疫组化检测肿瘤组织中CD45、iNOS、CD163、CD8、PD-L1、Granzyme B、IFN-γ等免疫标志物的表达
验证PEAK1是否通过HIF-1α/STAT3/NF-κB通路发挥作用
Western blot检测PEAK1过表达和敲低细胞中HIF-1α、PD-L1、p-STAT3、p-p65表达;使用抑制剂LW6、Stattic、Bay 11-7082处理,观察通路蛋白变化
按研究目的归类文中使用的方法,便于定位所需技术。
| 实验环节 | 名称 | 品牌 | 货号 |
|---|---|---|---|
| 细胞培养 | Ham's F-12K培养基 | -- | -- |
| DMEM培养基 | -- | -- | |
| RPMI-1640培养基 | -- | -- | |
| 胎牛血清 | Sigma-Aldrich | F7524-500ML | |
| 青链霉素 | Sigma-Aldrich | P4333-100 mL | |
| β-巯基乙醇 | -- | -- | |
| 佛波酯 | -- | -- | |
| 药物处理 | 多西他赛 | MedChemExpress | HY-B0011 |
| LW6 | MedChemExpress | HY-13671 | |
| Stattic | MedChemExpress | HY-13818 | |
| Bay 11-7082 | MedChemExpress | HY-13453 | |
| 恩杂鲁胺 | MedChemExpress | HY-70002 | |
| 细胞转染 | Silencer®阴性对照 | Thermo Fisher | AM4611 |
| Lipofectamine™ 2000转染试剂 | Thermo Fisher | 11668019 | |
| si-PEAK1#1, si-PEAK1#2 | Thermo Fisher | AM16708 | |
| 细胞活性检测 | CCK-8试剂盒 | Beyotime | -- |
| 增殖检测 | EdU染色液 | Beyotime | -- |
| 核染色 | DAPI溶液 | Beyotime | -- |
| 荧光显微镜 | 荧光显微镜 | KEYENCE | BZ-800 |
| 集落形成 | 吉姆萨染色 | Sigma | GS-500 |
| Transwell迁移 | Transwell小室 | Corning | CLS3422 |
| 共培养 | Transwell小室(0.4 μm) | Corning | CLS353095 |
| ELISA | CCL2 ELISA试剂盒 | Multi Sciences | EK187EG |
| IL-6 ELISA试剂盒 | Multi Sciences | EK106 | |
| RT-qPCR | PrimeScript RT试剂盒 | Takara | -- |
| SYBR Premix Ex Taq | Takara | -- | |
| Western blotting | RIPA裂解液 | Beyotime | P0013B |
| PVDF膜 | -- | -- | |
| ChemiDoc™成像系统 | -- | -- | |
| 抗β-actin抗体 | Abcam | ab8226 | |
| 抗PD-L1抗体 | Abcam | ab205921 | |
| 抗HIF-1α抗体 | Abcam | ab51608 | |
| 抗磷酸化STAT3 (Y705)抗体 | Abcam | ab76315 | |
| 抗STAT3抗体 | Abcam | ab68153 | |
| 抗磷酸化NF-κB (p65 S529)抗体 | Abcam | ab109458 | |
| 抗NF-κB (p65)抗体 | Abcam | ab32536 | |
| 抗Bcl2抗体 | Abclonal | A19693 | |
| 抗Bax抗体 | Abclonal | A12009 | |
| 抗cleaved Casp3抗体 | Abclonal | A11021 | |
| 免疫组化 | 抗CCL2抗体 | ABclonal | A23288 |
| 抗Ki67抗体 | Abcam | ab15580 | |
| 抗CD8抗体 | ABclonal | A11856 | |
| 抗CD45抗体 | ABclonal | A2115 | |
| 抗iNOS抗体 | ABclonal | A14031 | |
| 抗CD163抗体 | ABclonal | A8383 | |
| 抗PD-L1抗体 | ABclonal | A1645 | |
| 抗granzyme B抗体 | ABclonal | A2557 | |
| 抗IFN-γ抗体 | ABclonal | A12450 | |
| TUNEL染色 | TUNEL试剂盒 | Abcam | ab206386 |
| Western blotting | 抗Arg1抗体 | Abclonal | A1847 |
| 抗CD206抗体 | Abcam | ab64693 | |
| 抗E-cadherin抗体 | Abclonal | A24874 | |
| 抗Vimentin抗体 | Abcam | ab92547 | |
| 抗Snail抗体 | Abcam | ab216347 | |
| 抗PEAK1抗体 | Cell Signaling Tech | 72908 | |
| 抗Twist1抗体 | Abcam | ab50887 | |
| 免疫荧光 | Alexa Fluor 488山羊抗兔IgG | Abcam | ab150077 |
| Western blotting | HRP标记的山羊抗兔IgG | Abcam | ab205718 |
| HRP标记的山羊抗小鼠IgG | Abcam | ab205719 | |
| 动物实验 | BALB/c裸鼠 | SiPeiFu Biotechnology | -- |
| 多西他赛 | -- | -- |
汇总复现实验时建议重点确认的条件及原文阅读提示。
| 环节 | 核对要点 |
|---|---|
| 细胞培养 | 细胞系来源(ATCC货号),培养基类型,FBS浓度,PMA分化条件 阅读提示:Methods: Cell lines |
| 药物处理 | DTX浓度(0.1-25 nM短期,1 nM长期),处理时间(2天或30天),抑制剂浓度(LW6 10 μM,Stattic 10 μM,Bay 11-7082 15 μM),恩杂鲁胺浓度(5-40 μM) 阅读提示:Methods: Cell treatment |
| 细胞转染 | siRNA序列或质粒,转染试剂(Lipofectamine 2000),转染后收集时间(48小时) 阅读提示:Methods: Cell transfection |
| 功能实验 | CCK-8细胞接种密度(5000细胞/孔),处理时间(24小时),EdU染色细胞数(1×10^5),集落形成细胞数(800),Transwell迁移时间(24小时) 阅读提示:Methods: Cell viability assay, EdU staining, Colony formation assay, Transwell assay |
| 共培养 | Transwell孔径(0.4 μm),细胞数量(PCa 5×10^5,THP-1 1×10^6),共培养时间(72小时) 阅读提示:Methods: Co-culture system |
| 体内实验 | 小鼠品系(BALB/c nude),周龄(6-8周),细胞注射数量(5×10^5),DTX剂量(10 mg/kg),给药频率(每周一次),肿瘤体积测量间隔(3天),实验周期(4周) 阅读提示:Methods: Xenograft experiments |
| 分子检测 | Western blotting抗体货号及稀释比例,RT-qPCR引物序列,ELISA试剂盒货号 阅读提示:Methods: Western blotting, RT-qPCR, ELISA |